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从奔腾I的VCD播放到AI区块链播放器——程序优化的魔法

大家好,我是第二次参加LiveVideoStack举办的活动,第一次参加的时候我准备了两部分内容:程序化和流行的VR、AR。当时出品人陆老师(陆其明)谈到单纯地讲程序化太偏,可能整体效果不好,于是我临时改换了演讲主题,讲另外一个也就是VR、AR的案例。但是在参会时有人向我反映,在这种纯粹的讲代码讲技术的特殊行业,只讲例子反而不如今天讲的这个,所以我的思想发生了变化。这次来分享,我就迫不及待的把之前准备的东西拿出来,今天的内容也比较适合,短小精悍。我会与大家分享几个小例子和编码中一些小的技巧,而最近火热的区块链播放器,AI增强的另外一些编码器主题可能太大,需要更多的时间与大家讨论。我认为这些话题有可能在今年10月份有可能有结果,现在定论为时尚早。程序开发就是如此,等到大家出结果的时候,可能风口已经过去,大家也已经不追了,这是一种趋势。

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BIB | PreDTIs: 利用梯度增强框架预测药物-靶点相互作用

今天给大家介绍Mohammad Ali Moni与Ulfarsson等人在Briefings in Bioinformatics上发表的文章“PreDTIs: prediction of drug–target interactions based on multiple feature information using gradient boosting framework with data balancing and feature selection techniques”。发现药物 - 靶点(蛋白质)相互作用(DTIS)对于研究和开发新的药物具有重要意义,对制药行业和患者具有巨大的优势。然而,使用实验室实验方法对DTI的预测通常是昂贵且耗时的。因此,已经为此目的开发了不同的基于机器学习的方法,但仍有需要提升的空间。此外,数据不平衡和特征维度问题是药物目标数据集中的一个关键挑战,这可以降低分类器性能。该文章提出了一种称为PreDTIs的新型药物 – 靶点相互作用预测方法。首先,蛋白质序列的特征载体由伪定位特异性评分矩阵(PSEPSSM),二肽组合物(DC)和伪氨基酸组合物(PSEAAC)提取;并且药物用MACCS子结构指数编码。此外,我们提出了一种快速算法来处理类别不平衡问题,并开发MoIFS算法,以删除无关紧要和冗余特征以获得最佳最佳特征。最后,将平衡和最佳特征提供给LightGBM分类器的以识别DTI,并应用5折CV验证测试方法来评估所提出的方法的预测能力。预测结果表明,所提出的模型预测显着优于预测DTIS的其他现有方法,该文章的模型可用于发现未知疾病或感染的新药。

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Kylin快速入门系列(4) | Cube构建优化

上一篇博文我们已经介绍过,在没有采取任何优化措施的情况下,Kylin会对每一种维度的组合进行预计算,每种维度的组合的预计算结果被称为Cuboid。假设有4个维度,我们最终会有24 =16个Cuboid需要计算。   但在现实情况中,用户的维度数量一般远远大于4个。假设用户有10 个维度,那么没有经过任何优化的Cube就会存在210 =1024个Cuboid;而如果用户有20个维度,那么Cube中总共会存在220 =1048576个Cuboid。虽然每个Cuboid的大小存在很大的差异,但是单单想到Cuboid的数量就足以让人想象到这样的Cube对构建引擎、存储引擎来说压力有多么巨大。因此,在构建维度数量较多的Cube时,尤其要注意Cube的剪枝优化(即减少Cuboid的生成)。

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