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scipy.sparse、pandas.sparse、sklearn稀疏矩阵使用

单机环境下,如果特征较为稀疏矩阵较大,那么就会出现内存问题,如果不上分布式 + 不用Mars/Dask/CuPy等工具,那么稀疏矩阵就是一条比较容易实现路。...文章目录 1 scipy.sparse 1.1 SciPy 几种稀疏矩阵类型 1.2 lil_matrix 1.3 矩阵通用属性 1.4 稀疏矩阵存取 2 pandas.sparse 2.1 SparseArray...2.2 新建SparseDataFrame 2.3 格式转化 2.4 稀疏矩阵属性 2.5 scipy.sparse与pandas.sparse 3 sklearn 1 scipy.sparse 参考...由于在内存存储顺序差异,csc_matrix 矩阵更适合取列切片, 而 csr_matrix 矩阵更适合用来取行切片。...1.2 lil_matrix 这里只说lil_matrix,因为笔者这款,且比较方便。 lil_matrix 是第二直观稀疏矩阵存储方式。

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SciPy 稀疏矩阵(5):CSR

然而,LIL 格式稀疏矩阵并不是最适合进行矩阵向量操作稀疏矩阵格式,它还有优化空间。...如图所示,我们可以发现 LIL 格式稀疏矩阵虽然可以快速获取某一行信息,但是它任意相邻两行非零元素列索引以及对应元素值并不是存储在一段连续内存空间中,换句话说就是当缓存第 i 行非零元素信息即将用完时候...实例化 SciPy CSR 格式稀疏矩阵定义位于 scipy.sparse csr_matrix 类,对其进行实例化就能获取一个 SciPy CSR 格式稀疏矩阵实例。...因此,我们需要自己实现两种格式稀疏矩阵矩阵向量操作,这一也不难,只需要继承 SciPy 对应格式稀疏矩阵类并重写 _mul_vector 方法就可以了,代码如下所示。...然而,模仿 LIL 格式稀疏矩阵格式 SciPy 并没有实现,大家可以尝试自己去模仿一下,这一也不难。因此,下回直接介绍模仿 CSR 格式稀疏矩阵格式——CSC 格式。

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SciPy 稀疏矩阵(6):CSC

然而,模仿 LIL 格式稀疏矩阵格式 SciPy 并没有实现,大家可以尝试自己去模仿一下,这一也不难。因此,这回直接介绍模仿 CSR 格式稀疏矩阵格式——CSC 格式。...实例化 SciPy CSC 格式稀疏矩阵定义位于 scipy.sparse csc_matrix 类,对其进行实例化就能获取一个 SciPy CSC 格式稀疏矩阵实例。...优缺点 SciPy CSC 格式稀疏矩阵有着以下优点: 进行算术操作性能非常高效。 进行列切片操作性能非常高效。 进行矩阵向量运算操作特别迅速。...对于一个大稀疏矩阵我们显然也可以进行分块,只不过绝大多数情况下大量块是元素全为零矩阵,显然,我们可以通过仅存储非零矩阵块也能实现稀疏矩阵压缩存储。...然而,SciPy 实现了模仿 CSR 格式稀疏矩阵格式,模仿其他稀疏矩阵格式全都没有实现,大家可以尝试自己去模仿一下,这一也不难。大家可以尝试自己去模仿一下,这一也不难。

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c++矩阵类_Matlab与Python矩阵运算

本章我们从矩阵运算模块出发,对比Python与Matlab在实现矩阵创建与运算时异同,以帮助习惯使用Matlab用户快速熟悉并应用NumPy/SciPy库。   array还是matrix?...1,   Matlab序列各元素被视为第1个,第2个,第3个……   a23=A(2,3)   矩阵与元素智能相乘   元素智能相乘即矩阵各素分别对应相乘-Python_np.array  ...#矩阵,适用于Python 3.5以上版本   -Python_np.martix   #矩阵   -Matlab   B=A*A %矩阵B=A....需要注意是array生成1维数组在进行矩阵时,会视其在乘号左侧或右侧转化为对应1xN或Nx1矩阵。matrix则无法自动转化。  ...此外由于在array1xN数组为1维数组,其无法通过上述.T或np.transpose()操作转置成如Nx1矩阵(由于时会自动变形,针对其转置使用场景不多)。

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python高级数组之稀疏矩阵

稀疏矩阵定义: 具有少量非零项矩阵(在矩阵,若数值0元素数目远多于非0元素数目,并且非0元素分布没有规律时,)则称该矩阵稀疏矩阵;相反,为稠密矩阵。...稀疏矩阵格式 存储矩阵一般方法是采用二维数组,其优点是可以随机地访问每一个元素,因而能够容易实现矩阵各种运算。...对于稀疏矩阵,采用二维数组存储方法既浪费大量存储单元来存放零元素,又要在运算浪费大量时间来进行零元素无效运算。因此必须考虑对稀疏矩阵进行压缩存储(只存储非零元素)。...CSR、CSC是用于矩阵-矩阵矩阵-向量运算有效格式,LIL格式用于生成和更改稀疏矩阵。Python不能自动创建稀疏矩阵,所以要用scipy特殊命令来得到稀疏矩阵。...LIL格式更改和切割矩阵: LIL格式最适合切片方法,即以LIL格式提取子矩阵,并通过插入非零元素来改变稀疏模式。

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【水了一篇】Scipy简单介绍

SciPy包含模块有最优化、线性代数、积分、插值、特殊函数、快速傅里叶变换、信号处理和图像处理、常微分方程求解和其他科学与工程中常用计算。...---- 4 稀疏矩阵 稀疏矩阵(英语:sparse matrix)指的是在数值分析绝大多数数值为零矩阵。反之,如果大部分元素都非零,则这个矩阵是稠密(Dense)。...上述稀疏矩阵仅包含9个非零元素,另外包含26个零元。SciPyscipy.sparse模块提供了处理稀疏矩阵函数。...主要使用以下两种类型稀疏矩阵: CSC-压缩稀疏列(Compressed Sparse Column),按列压缩。 CSR-压缩稀疏行(Compressed Sparse Row),按行压缩。...SciPy通过scipy.spatial模块处理空间数据,比如判断一个是否在边界内、计算给定点周围距离最近以及给定距离内所有点。 这里不详细介绍,请看这里。

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走过19年,每年千万下载量,科学计算开源库SciPy前世今生

SciPy 发展里程碑 20 世纪 90 年代末期,美国梅奥医学中心博士生 Travis Oliphant 发布了一系列构建于数值数组之上包,并提供了用于信号处理、特殊函数、稀疏矩阵、正交、最优化和快速傅里叶变换等算法...这些包 Multipack 是一组包装了 Fortran 和 C 语言扩展模块,用于解决非线性方程和最小二问题、求微分方程积分以及拟合曲线。...数据结构:稀疏矩阵 scipy.sparse 提供了 7 种稀疏矩阵数据结构,或者称之为稀疏格式。其中最重要一种是压缩行/压缩列稀疏格式,它们分别为 CSR 与 CSC。...这两种方法都提供了快速主轴索引与快速矩阵-向量乘法,这两种稀疏格式在 SciPy 及依赖得到了广泛应用。...从新特性角度来看,scipy.sparse 矩阵与线性运算子现在都已经支持 Python 矩阵乘法(@)。

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走过19年,每年千万下载量,科学计算开源库SciPy前世今生

SciPy 发展里程碑 20 世纪 90 年代末期,美国梅奥医学中心博士生 Travis Oliphant 发布了一系列构建于数值数组之上包,并提供了用于信号处理、特殊函数、稀疏矩阵、正交、最优化和快速傅里叶变换等算法...这些包 Multipack 是一组包装了 Fortran 和 C 语言扩展模块,用于解决非线性方程和最小二问题、求微分方程积分以及拟合曲线。...数据结构:稀疏矩阵 scipy.sparse 提供了 7 种稀疏矩阵数据结构,或者称之为稀疏格式。其中最重要一种是压缩行/压缩列稀疏格式,它们分别为 CSR 与 CSC。...这两种方法都提供了快速主轴索引与快速矩阵-向量乘法,这两种稀疏格式在 SciPy 及依赖得到了广泛应用。...从新特性角度来看,scipy.sparse 矩阵与线性运算子现在都已经支持 Python 矩阵乘法(@)。

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SciPy 稀疏矩阵(3):DOK

上回说到,COO 格式稀疏矩阵不支持元素访问操作,即使我们来自己实现这一操作,这一操作时间复杂度相对于普通矩阵而言还是太高了!...这种高效性使得散列表在需要快速查找和访问数据场景特别有用,比如在搜索引擎索引。散列表基本实现涉及两个主要操作:插入(Insert)和查找(Lookup)。...实例化 SciPy DOK 格式稀疏矩阵定义位于 scipy.sparse dok_matrix 类,对其进行实例化就能获取一个 SciPy DOK 格式稀疏矩阵实例。...(零元素改非零元素) 增加关键字和对应值 按照行列索引修改对应值(非零元素改零元素) 删除关键字和对应值 优缺点 SciPy DOK 格式稀疏矩阵有着以下优点: 一(逐个元素或者逐个矩阵块)...至于存储方式也不需要我们去实现,SciPy 已经实现了这样稀疏矩阵存储方式,它就是另一个板块,这个板块共有 4 种稀疏矩阵格式,分别是{BSR, CSC, CSR, LIL},下一回先介绍 LIL 格式稀疏矩阵

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【Python环境】Python数据分析——前言

它提供了如下内容:快速有效多维数组对象ndarray,数组之间运算,基于数组数据读写到磁盘功能,线代运算,傅里叶变换,随机数生成,将C、C++和Fortran集成到Python工具。...● pandas pandas提供了丰富数据结构和功能,可以快速、简单、富于表现地处理结构化数据。它是使Python在数据分析领域强大高效关键组件之一。...除了终端,在工程IPython还提供:HTML笔记本来连接浏览器,Qt界面来显示、编辑和高亮,并行和分布式计算组件。...线代方程和矩阵分解 ◎ scipy.optimize 方程优化和求根 ◎ scipy.signal 信号处理工具 ◎ scipy.sparse 稀疏矩阵稀疏线性解决 ◎ scipy.special...是SPECFUN封装,实现了基本函数功能Fortran库 ◎ scipy.stats 标准连续和离散概率分布,各种统计检验 ◎ scipy.weave 内嵌c++代码来加速数组运算

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matlab 稀疏矩阵 乘法,Matlab 矩阵运算

Copyright 2008 说明:这一段时间Matlab做了LDPC码性能仿真,过程涉及了大量矩阵运算,本文记录了Matlab矩阵相关知识,特别的说明了稀疏矩阵和有限域中矩阵。...(2) 范得蒙矩阵 范得蒙(Vandermonde)矩阵最后一列全为1,倒数第二列为一个指定向量,其他各列是其后列与倒数第二列乘积。可以一个指定向量生成一个范得蒙矩阵。...如果A矩阵是非奇异方阵,则A\B和B/A运算可以实现。A\B等效于A逆左B 矩阵,也就是inv(A)*B,而B/A等效于A矩阵逆右B矩阵,也就是B*inv(A)。...(5) 矩阵转置 对实数矩阵进行行列互换,对复数矩阵,共轭转置,特殊,操作符.’共轭不转置(见运算); (6) 运算 在MATLAB,有一种特殊运算,因为其运算符是在有关算术运算符前面加点,...二、有限域中矩阵 信道编码矩阵运算一般都是基于有限域,因此需要将普通矩阵转换为有限域中矩阵,使其运算在有限域GF(m)

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SciPy 稀疏矩阵(2):COO

上回说到,计算机存储稀疏矩阵核心思想就是对矩阵非零元素信息进行一个必要管理。...SciPy COO 格式稀疏矩阵 在开始 SciPy COO 格式稀疏矩阵之前我花了一些篇幅讲解稀疏矩阵三元组存储策略,这主要是因为 SciPy COO 格式稀疏矩阵存储策略就是三元组存储策略第...01 实例化 SciPy COO 格式稀疏矩阵定义位于 scipy.sparse coo_matrix 类,对其进行实例化就能获取一个 SciPy COO 格式稀疏矩阵实例。...: 有利于各种稀疏矩阵格式快速转换。...允许重复行列索引。 可以高效地构造稀疏矩阵。 在借助稀疏工具情况下,可以高效地进行矩阵列向量操作。

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SciPy库在Anaconda配置

本文介绍在Anaconda环境,安装Python语言SciPy模块方法。...scipy.optimize模块包含了这些算法,包括全局优化、最小二拟合、非线性方程求解等。 插值:提供了一系列插值方法,用于从有限数据点中估计连续函数值。...线性代数:提供了线性代数运算函数,例如求解线性方程组、计算特征值和特征向量、计算矩阵逆等。scipy.linalg模块包含了这些函数。...稀疏矩阵:提供了处理大规模稀疏矩阵函数和工具,包括矩阵创建、运算、分解等。scipy.sparse模块包含了这些功能。   ...activate py38   运行上述代码,即可进入指定虚拟环境。随后,我们输入如下代码。

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机器学习基础与实践(二)——数据转换

如果数据很小,可以在稀疏矩阵上运用toarray 方法。 2.4 对离群进行标准化 如果你数据有离群(上一篇我们提到过),对数据进行均差和方差标准化效果并不好。...注:稀疏数据输入: normalize 和 Normalizer 既接受稠密数据(dense array-like),也接受稀疏矩阵(from scipy.sparse)作为输入 稀疏数据需要转换成压缩稀疏行...此外,在文本处理也经常会遇到二值特征值(很可能是为了简化概率推理),即使在实际中正则化后词频或者TF-IDF值通常只比未正则化效果好一。...注:稀疏数据输入: binarize 和 Binarizer 既接受稠密数据(dense array-like),也接受稀疏矩阵(from scipy.sparse)作为输入 稀疏数据需要转换成压缩稀疏行...在稀疏矩阵,缺失值被编码为0存储为矩阵,这种格式是适合于缺失值比非缺失值多得多情况。

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在 Cython 中高效访问 scipy lil_matrix

在 Cython 中高效地访问 scipy lil_matrix(LInked List format)可以通过以下步骤实现:导入所需模块: 首先,导入必要模块,包括 numpy 和 scipy.sparse...使用 cimport 导入声明: 使用 cimport 声明导入 numpy 和 scipy.sparse lil_matrix 类。...然而,在 Cython 访问 scipy 稀疏矩阵时,可能会遇到一些问题。例如,lil_matrix 表示使用不同长度列表列表。将此类数据结构有效地传递给 Cython(无需复制)可能很困难。...然后,您可以使用 cdef 语句声明变量来存储 scipy 稀疏矩阵。...在这个示例,我们首先创建了一个 lil_matrix 对象 A,并设置了一些值。然后,我们访问了矩阵元素,并将其转换为 CSR 格式(压缩稀疏行格式)以进行更高效操作。

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Erasure-Code-擦除码-2-实现

现在我们需要找到1个质多项式([Prime-Polynomial]), 来替代GF(7)7角色, 最终得到1个有256个元素多项式伽罗华域 GF(2⁸)....满足这些性质四则运算, 就可以GF(2⁸)来建立高次曲线, 进而在GF(2⁸)上实现EC. 标准EC实现 以上讨论是标准EC原理, 现在我们将以上内容总结, 应用到实践上面....GF(2⁸) 下加减法直接异或计算, 不需要其他工作. GF(2⁸) 下乘法和除法查表方式实现....之所以把单位矩阵也放到编码矩阵上面, 看起来没有什么, 只是把输入无变化输出出来这种风格, 原因在于在编码理论, 并不是所有的生成Code都是k个原始数据 和 m个校验数据形式, 有些编码算法是将...EC实现到这里就结束了, 有了GF(2⁸)四则运算实现后, 再通过牛顿消元实现矩阵求解, 就可以完整实现出一套EC算法了.

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Good Feature Matching: Towards Accurate, Robust VOVSLAM with Low Latency 良好特征匹配:实现准确、鲁棒低延迟VOVSLA

本论文旨在为基于特征视觉SLAM提高性能效率,提出了一个主动地图到图像帧特征匹配算法:特征匹配和一个需要评分矩阵选择联系起来,经过仿真,Max-logDet矩阵评分有最好表现。...本文提出算法用于了基于特征单目和双目SLAM系统。在多个数据集表现可量化地表明不降低鲁棒性前提下可减少时延。 ?...GF-ORB-SLAM和ORB-SLAM相比,特征提取时间相同,但是它极大减少了特征匹配和接下来模块耗时,在四个系统延迟最低。...本文主要贡献: 最小二位姿优化误差模型研究,将位姿优化性能和带权重雅各比矩阵谱性质联系起来。 将度量指标的探索和位姿优化最小二条件结合起来,选择Max-logDet值最为最优度量。...单目和双目版本实现已开源。

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python 数据标准化常用方法,z-scoremin-max标准化

唯一可用于稀疏数据 scipy.sparse标准化 preprocessing.robust_scale(X,axis=0, with_centering=True, with_scaling=True...=(0, 1),copy=True): 将数据在缩放在固定区间类,默认缩放到区间 [0, 1],对于方差非常小属性可以增强其稳定性,维持稀疏矩阵为0条目 属性: min_:ndarray,缩放后最小值偏移量...属性: center_:ndarray,中心 scale_:ndarray,缩放比例 classpreprocessing.KernelCenterer: 生成 kernel 矩阵,用于将 svm...可用于稀疏数据 scipy.sparse classpreprocessing.Normalizer(norm='l2', copy=True): 数据归一化类。...scipy.sparse classpreprocessing.Binarizer(threshold=0.0,copy=True): 二值化处理类,可用于稀疏数据 scipy.sparse 方法:

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10行代码搞定图Transformer,图神经网络框架DGL迎来1.0版本

DGL Sparse:为图机器学习设计稀疏矩阵库 DGL 1.0 版本中新增了一个名为 DGL Sparse 库(dgl.sparse),它和 DGL 消息传递接口一起,完善了对于全类型图神经网络模型支持...在下一节,作者演示多个 GNN 示例,展示它们在 DGL Sparse 数学公式和相应代码实现。...图卷积网络(Graph Convolutional Network) GCN 是 GNN 建模先驱之一。GCN 可以同时消息传递视图和矩阵视图来表示。...超图典型特征是其稀疏关联矩阵,因此超图神经网络 (HGNN) 通常使用稀疏矩阵定义。以下是超图卷积网络(Feng et al., 2018)和其代码实现。...DGL Sparse 关键特性 相比 scipy.sparse 或 torch.sparse 等稀疏矩阵库,DGL Sparse 整体设计是为图机器学习服务,其中包括了以下关键特性: 自动稀疏格式选择

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压缩感知“Hello World”代码初步学习

时域测试信号生成 K=7; % 稀疏度(做FFT可以看出来) N=256; % 信号长度 M=64; % 测量数(M>=K*log(N/K),至少40,但有出错概率...对于矩阵形式表达线性方程组: 它最小二解为: 其中 即为矩阵G最小二广义逆(广义逆一种)。...有了这些知识背景后代码就容易理解了,在第三步,得到矩阵T与残差r_n最相关列组成矩阵Aug_t,而第四步实际上就是在求方程组Aug_t*Aug_y=s最小二解。...r_n=s-Aug_t*aug_y;这一句就是求得最小二解更新残差r_n,在下一次迭代中使用。...hat_y(pos_array)=aug_y; 最后一次迭代得到最小二解aug_y即为恢复值,位置分别对应于迭代每一次与残差r_s最相关矩阵T列号。

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