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沙龙
1
回答
计算
R
中
矩阵
中
每个
站点
的
物种
出现
次数
我有像下面这样
的
站点
矩阵
的
物种
。其中
物种
在列(a,b,c,d),
站点
在行(W,X,Y,Z)。我想知道
每个
站点
出现
的
物种
的
数量,而不考虑它们
的
丰富性。换句话说,
物种
"a“将
出现
4次,
物种
b和d
出现
两次,而
物种
c
出现
一次。如果我使用c
浏览 2
提问于2018-02-23
得票数 0
1
回答
比较共现
矩阵
、
、
、
我不确定最好
的
表达方式,也许我
的
目标比我试图实现
的
要容易得多。我正在尝试比较两个共现
矩阵
(MatA和MatB),它们以
站点
为行,以
物种
出现
在
每个
站点
为列,1=present和0=absent。(
站点
),我希望在MatA
中
搜索每一行(
站点
),并首先
计算
有多少
物种
同时
出现
,如果可能的话,还会跟踪哪些
物种
。值得一提<
浏览 19
提问于2019-06-07
得票数 0
1
回答
如何在
矩阵
中
重复相同
的
函数,更改函数
的
参数
、
我有这样
的
功能来自“β分离”包:哪里
站点
:将
计算
多个
站点
差异
的
站点
数量。如果未指定,默认为所有<e
浏览 1
提问于2021-09-20
得票数 1
回答已采纳
1
回答
如何避免
计算
重复数据点
我有一个数据集,看起来像这样我需要一个
每个
StandType
的
每个
物种
有多少网站
的
摘要。xtab1 <- xtabs(~SPECIES +StandType, X2016RawData) 这给了我一个类似于下面这样
的
表。由于采样持续了多天,因此存在
物种
和
站点
的
重复。 在上面的示例
中
,您
浏览 0
提问于2017-09-23
得票数 1
4
回答
计算
物种
在不同地点发生
的
频率
、
、
我需要
计算
物种
在不同地点发生
的
相对频率。如果在8个采样点中有5个发现了
物种
a,其相对频率为62.5 %。我想知道如何在
R
中
这样做,最好是使用dplyrd <-data.frame(site = c(1,1,2,2,3,3,4,4), species = c('a','b', 'a','b', 'a','d
浏览 3
提问于2022-08-22
得票数 0
回答已采纳
1
回答
计算
网格
中
物种
的
出现
次数
、
我在
R
中有大约500,000个点
的
一种候鸟
物种
在美国各地
的
出现
数据。 我尝试在这些点上覆盖一个网格,然后
计算
每个
网格中
出现
的
次数
。计数完成后,我想将它们引用到一个网格单元ID。在
R
中
,我使用了over()函数来获取范围图中
的
点,这是一个shapefile。is.na(over(data,as(range,"SpatialPolygons")))
浏览 0
提问于2013-07-23
得票数 6
回答已采纳
3
回答
合并
R
中
的
重复列和求和值
、
我有一个很大
的
矩阵
,以
物种
为列,以
站点
为行。它是一个存在/不存在
矩阵
(即
每个
物种
可以存在=1或不存在= 0)。有些
物种
是重复
的
,但它们
的
值并不相同(即相同
的
物种
可以
出现
在一条记录
中
,而在另一条记录
中
则不存在)。 我需要合并列,即当一个
物种
被复制时,我只想保留一条记录并对所有值求和。例如,给定这个<em
浏览 0
提问于2017-02-08
得票数 1
2
回答
如何利用
R
从lat/long数据生成
物种
存在/缺失
矩阵
我有一长串有lat/long数据
的
多种
物种
的
列表。我想用lat/long数据为所有
物种
生成缺席
矩阵
(1,0)。然而,有一种情况是,在同一个lat/long (
站点
)中
出现
了多个
物种
。如何在
R
中考虑这一点,并生成下面的示例数据框架。
浏览 2
提问于2019-10-11
得票数 2
回答已采纳
2
回答
从列
中
获取一些值,使
R
中
的
id列匹配多个新列
、
、
我在
R
中有两个数据帧: Site_code Species_code Abundance 1我有很多信息,以及
站点
代码,但是
每个
站点
只有一行。latitude mean_temp ...etc 2 56 10 我想为df2
中
的
每个
站点
浏览 5
提问于2015-05-05
得票数 2
回答已采纳
1
回答
通过另一个
矩阵
从一个
矩阵
中提取信息
、
、
我有两个
矩阵
,一个是
物种
x性状,另一个是位点x
物种
(存在/缺席)。我需要第三个
矩阵
位点x特征,在每一列,我将有多个值(所有的值为所有
物种
的
一个
站点
)。我该怎么做?通过另一个
矩阵
提取一个
矩阵
的
信息?我只是一个
R
的
初学者..。 我转换了位点x
物种
和cbind
的
两个
矩阵
,但结果是所有的列在一个
矩阵
。,但这是
浏览 2
提问于2017-06-23
得票数 0
回答已采纳
1
回答
为
每个
日期创建时间块并填充存在数据
、
、
、
、
我正在尝试为我
的
数据集中从晚上19:45:00到早上06:30:00
的
每个
日期创建一个15分钟时间块
的
数据集。然后,我尝试
计算
一个
物种
在
每个
时间段中
出现
/不存在
的
次数
,按
站点
、日期、15分钟
的
时间段进行必要
的
分组。我在多个晚上有多个网站。我已经能够按小时等对数据进行分组,但这并不能解决它只在
物种
存在时计数,而在
物种
不存
浏览 2
提问于2020-07-30
得票数 0
1
回答
我想用0.5度刻度
的
栅格来映射x y数据,然后
计算
每个
0.5单元格内
的
x y点数
、
、
、
、
我有全球数据显示一个
物种
的
预测范围作为点。我
的
目标是在0.5度分辨率
的
细胞中
计算
出现
的
次数
。resolution = 0.5,我需要
计算
每个
单元格
中
x/y
出现
的
<e
浏览 0
提问于2019-07-01
得票数 2
回答已采纳
1
回答
单个单元
中
的
几个
矩阵
运算
、
我有一个样本
矩阵
,其中行表示不同
的
物种
,列引用不同
的
观测位置。细胞内充满1或0's,取决于该
物种
是否在该特定位置被观察到(即:在位置#1和#2
中
观察到
物种
B)。1 1 0c 1 0 0我必须
计算
每种
物种
的
发生情况一个
物种
<e
浏览 6
提问于2016-11-22
得票数 1
回答已采纳
1
回答
计算
R
中
矩阵
中
每列因子
的
出现
次数
、
我有一个很大
的
矩阵
(10000列和600行),下面显示了一个示例,其中包含核苷酸,但也包含NAs。我想
计算
每一列
中
每个
核苷酸(因子)
的
出现
次数
,但忽略NAs。输出应该在列表
中
。
r
4 <- c("a","g","g","g","g","c")
r
5<- c(NA, &q
浏览 18
提问于2020-10-23
得票数 0
回答已采纳
1
回答
按字段分组
的
SQL TOP结果
、
我有一个SQL查询
的
问题。我有一个包含145个
站点
名称
的
列表。在
每个
地点都发现了某些
物种
。我已经创建了
每个
物种
在
每个
站点
被看到
的
次数
的
计数。我想找出在
每个
网站上最常见
的
5个
物种
。[Group size]) DESC; 这只是从所有
站点
返回5个最常见
的
物种
。只是为了澄清,<em
浏览 2
提问于2012-05-14
得票数 3
1
回答
矩阵
中元素
的
频率- Matlab
、
、
从我在matlab
中
运行
的
一个函数
中
,我得到了一个225x400
矩阵
。我想要
计算
这个
矩阵
中
每个
元素
的
频率,这意味着我需要
计算
每个
元素在
矩阵
中
出现
的
次数
。我
的
矩阵
名称是"Idiff“B=unique(Idiff); 来查找Idiff
矩阵
中</e
浏览 0
提问于2012-06-27
得票数 3
回答已采纳
2
回答
如何根据另一列中
出现
的
数据来统计某一列
中
特定值
出现
的
次数
?
因此,我有一个数据框架,其中包含属于几个
物种
的
鱼标本
的
出现
次数
(有几个属于同一
物种
的
标本
出现
)。数据框有一个列,其中包含某个标本
的
物种
名称,以及以前分配给属于该
物种
的
每个
标本
的
从A到E
的
等级(这就是为什么罗非鱼
物种
的
两个标本都有C级,等级被分配给整个
物种
,而不是单独
的
浏览 0
提问于2019-09-14
得票数 0
2
回答
R
纯素
物种
分数和Primer Spearman等级与轴
的
相关性有什么区别?
、
、
、
在
R
中
,vegan提供了一种不同
的
测量方法,称为
物种
分数,它可以
计算
出,但不需要仔细考虑
的
潜在缺点。和,当使用capscale时。我想更好地理解Primer PERMANOVA
中
的
相关性和
物种
分数是如何
计算
的
。第一,这些方法
的
目的究竟有何不同?使用Spearman或Pearson correlations对
R
- vegan
的
物种</em
浏览 1
提问于2017-10-04
得票数 1
回答已采纳
1
回答
从发生数据和气候栅格中使SpatialGridDataFrame相互匹配
、
、
我有两个SpatialGridDataFrame,一个是根据
物种
发生
的
数据创建
的
,另一个是从一个栅格
的
气候数据
中
创建
的
。我需要使两个网格匹配,以执行
物种
多样性模型。我正在努力使这两个对象
的
网格拓扑保持相同,这是运行我将要使用
的
函数所必需
的
。以下是我
的
重复性数据子集: bioclim <- structure(list(x = c(-83.5543059413, -83.545972608, -
浏览 6
提问于2022-01-24
得票数 0
回答已采纳
2
回答
如何
计算
R
中
前10%
的
平均值
、
、
、
、
我
的
数据集包含不同
物种
的
多个观察结果。
每个
物种
都有不同
的
观察
次数
。在
R
中
寻找一种快速方法来
计算
每个
物种
的
给定变量
的
前10%
的
值
的
平均值。write.csv(Bioclim
浏览 4
提问于2016-04-13
得票数 6
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