重塑pandas中的距离矩阵

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python、pandas

我有一个df1形状的数据帧 'From': ['A','B','C'], 'Price': [1,2,3] 我正在尝试做的是重塑df1，使其具有df2的形式。所需的

浏览 8提问于2020-02-19得票数 1

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将3列数据帧转换为矩阵

python、pandas、dataframe、matrix

["John", "Tuesday", 2], ["Mary", "Sunday", 6], ["Mary", "Monday", 4], ["Mary", "Tuesday", 7]] df = pandas.DataFrame(A, columns=["names", "dates", "times"]) 我想重塑它，这样我就可以创建一

浏览 22提问于2019-01-05得票数 6

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在熊猫中如何将高程合并到欧几里德距离矩阵中？

python、pandas、matrix、euclidean-distance、altitude

2820.0530112481106, "4": 3236.75098902635}) 我正在尝试创建一个距离矩阵使用scipy.spatial.distance中的pdist和squareform，我可以执行以下操作： from scipy.spatial.distance import pdist, squareformeuclidean') index

浏览 14提问于2019-05-14得票数 0

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为什么不能使用LSTM的3D音量输入？

machine-learning、neural-network、lstm、recurrent-neural-network

在我最近阅读的论文CountNet: Estimating the Number of Concurrent Speakers Using Supervised Learning中，它规定从CNN层输出的

浏览 32提问于2020-10-19得票数 0

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解析具有多个分隔符的txt文件

python、parsing

我有一个data.txt文件，其中包含对象之间的交互，以及它们之间的距离。举个小例子，假设我有对象a，b，c，A，B，C；我只测量了它们之间的相互作用一个距离值。0.132424 -0.122704 -0.112826 0.089461 0.086023 0.084290 我想解析这个数据文件，并将其重塑为一个矩阵，该矩阵的大小实际上与标题中给出的大小相同

浏览 38提问于2021-04-09得票数 0

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如何将标签添加到用于生成树状图的距离矩阵中，并使标签也显示在树状图上？

python、arrays、numpy、scikit-learn、scipy

我有一个距离矩阵：我想要添加标签到矩阵，然后再执行分层聚类使用我使用以下方法从距离矩阵生成UPGMA树状图：#from scipy.spatial.distance我知道错误： TypeError: average() got an un

浏览 8提问于2022-11-28得票数 1

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matlab中的KNN算法

matlab、machine-learning、distance、classification、knn

我需要实现KNN算法来对我的图像进行分类。根据的说法，它只有两个测量值，通过这两个测量值计算距离来找到最近的邻居，但在我的例子中，我有400张25x42的图像，其中200张用于训练，200张用于测试。我寻找了几个小时，但我找不到找到点之间距离的方法。编辑:我已经将前200张图像重塑为1X1050，并将它们存储在200X1050的矩阵trainingData中。

浏览 1提问于2012-06-02得票数 1

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按位置排序的距离重塑向量的距离矩阵

r、euclidean-distance

, 0, 3, 4, 0, 4, 0)), row.names = c(NA, -10L), class = c("tbl_df", "2", "3", "4", "5"), c("1", "2", "3&quo

浏览 20提问于2019-05-30得票数 2

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以矢量化方式查询距离矩阵

python、pandas、vectorization

一般的问题是在列表中找到每个城市之间的总行程，然后返回到第一个城市，给出一个距离矩阵。下面是这个问题的有效解决方案，但我不知道如何将其转换为向量化的解决方案。“矩阵”是一个包含距离矩阵的熊猫数据，而城市是一个城市列表。import pandas as pd

浏览 1提问于2018-07-29得票数 3

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从pandas数据帧中获取N个最小距离对

python、pandas、numpy、dataframe

考虑下面的代码，它从一组带标签的坐标生成一个距离矩阵：import pandas as pdC 7.211103 5.099020 0.000000 1.414214有没有有效的方法(使用numpy、pandas等)从这个距离矩阵<e

浏览 23提问于2020-05-17得票数 3

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如何利用三角矩阵使np.where更有效？

python、numpy、scipy、python-itertools

我得到了这样的代码，其中距离是一个下三角矩阵，定义如下：def make_them_touchx, y = np.where(distance == t) return result 我的问题是，大矩阵(例如，2000*100)的np.where非常慢。如

浏览 0提问于2018-06-18得票数 1

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如何从NetworkX最小生成树中绘制树状图？

python、scipy、networkx

我使用NetworkX从距离矩阵中计算出最小生成树。我现在要用它来做一个树状图。我的MST：我试过使用邻接矩阵(使用NetworkX的to_pandas_adjacency)df = nx.to_pandas_adjacency(T) from scipy.spatial.distance0's，我猜链接计算欧氏距离，最后得到一个3簇树状图(其中所有簇的点都在0距离<

浏览 1提问于2019-08-09得票数 1

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运行scipy.spatial.distance.pdist后提取距离

python、pandas、similarity、euclidean-distance

我有一个Pandas数据框架(见下面的小例子)。我想根据3列(特征)中的值计算观察(行)之间的欧几里德距离。我正在使用scipy.spatial.distance.pdist。据我所知，返回的对象(dist)包含我的20个观察(行)之间的190段距离。我想，这是一个“展开的”三角矩阵--第一行和第二行之间的距离，大概是第一行和第三行之间的

浏览 4提问于2017-11-03得票数 1

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KNeighborsRegressor用户定义的度量整形

python-2.7、scikit-learn、nearest-neighbor

我正在定义一个自定义的距离度量，以便在Scikit- KNearestRegressor中使用。我的距离度量根据视觉特征获取两幅图像并计算它们的相似性： # the RGB images have size 480x640因此，我的X矩阵是图像的矩阵。KNeighborsRegressor(n_neighbors=d['kneighbours'

浏览 3提问于2015-11-11得票数 1

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Networkx:从Pandas* DataFrame中的距离矩阵绘制网络*

python、pandas、dataframe、networkx

我有一个余弦距离矩阵作为熊猫数据帧。如果我将其转换为numpy矩阵并执行以下操作，则可以将其可视化为网络：G = G=nx.from_numpy_matrix(DistMatrix)plt.show() 问题是我丢失了节点的标签。然而，这些标签是在熊猫数据框中的。作为距离矩阵，列标签当然与索引标签相同，并且矩阵的

浏览 3提问于2017-10-12得票数 1

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C++ Armadillo重塑只有一维大小的矩阵

c++、armadillo

使用，当我只指定一维大小时，如何重塑矩阵？结果是一个12乘3的矩阵，与原来的6乘6矩阵保持相同的元素数(36)。B中的<

浏览 0提问于2017-08-08得票数 1

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从距离矩阵中绘制图形或网络？

python、graph、plot、social-networking

我正在尝试绘制/绘制(matplotlib或其他python库)一个大距离矩阵的2D网络，其中距离将是所绘制网络的边以及其节点的线和列。0.9, 0.2],['d', 0.7, 0.2, 0.1, 0] ] 我正在搜索从这样的(更大的:数千列和线)距离矩阵绘制&#

浏览 1提问于2012-11-22得票数 28

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基于已计算数据的R距离矩阵格式

r、phylogeny

前两列是细菌的名称，最后一列是指示有机体之间的相关性的数字(基于一种基因组相似性)。bacteria3 0.54596bacteria3 bacteria2 0.36528 我希望能够将这些加入到某种系统发育树中。我看到'nj‘需要一个距离矩阵来做这件事。如何将其转换为距离矩阵或可用格式？(这些数字已经是距离，所以不应该做任何数学运算)我

浏览 0提问于2012-10-12得票数 3

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如何向量化这个for循环(matlab)

matlab、for-loop、vectorization

我非常感谢关于如何向量化以下for loop (Matlab)的建议： for i=1:lasti end 我所说的向量化是指使用矩阵运算而不是for循环。编辑:实际上我真正想要矢量化的是下面。我把它加进去以防某个勇敢的灵魂想试一试...

浏览 0提问于2013-03-05得票数 3

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sklearn的成对距离结果出乎意料地不对称

python、pandas、numpy、scikit-learn

我正在计算向量元素之间的欧几里得成对距离。我使用sklearn包中的pairwise_distances函数。然而，某些元素的结果矩阵仅是近似对称的:在一个示例中，假设相等的元素的值仅等于小数点后15位。我意识到了这一点，因为我在假设输入矩阵对称的下游分析中遇到了错误。下面是我试图计算成对距离的向量(它是pandas<

浏览 0提问于2017-01-16得票数 2

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