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Cell. Syst. | 一种端到端的自动化机器学习工具,用于解释和设计生物序列

今天为大家介绍的是来自James J. Collins团队的一篇论文。自动化机器学习(AutoML)算法可以解决将ML应用于生命科学时面临的许多挑战。然而,由于这些算法通常不明确处理生物序列(如核苷酸、氨基酸或糖肽序列),且不容易与其他AutoML算法进行比较,它们在系统和合成生物学研究中很少被使用。在这里,作者介绍了BioAutoMATED,这是一个用于生物序列分析的AutoML平台,将多个AutoML方法集成到一个统一的框架中。用户可以自动获得分析、解释和设计生物序列的相关技术。BioAutoMATED可以预测基因调控、肽-药物相互作用和糖肽注释,并设计优化的合成生物学组件,揭示突出的序列特征。通过自动化序列建模,BioAutoMATED使生命科学家更容易将ML应用到他们的工作中。

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