将DNA序列看作是只包含['A', 'C', 'G', 'T']4个字符的字符串，给一个DNA字符串 ，找到所有长度为10的且出现超过1次的子串。...序列进行整数编码: [‘A’, ‘C’, ‘G’, ‘T’]4个字符分别用[0, 1, 2, 3](二进制形式(00, 01, 10, 11)所表示，故长度 为10的DNA序列可以用20个比特位的整数所表示...1.设置全局整数哈希int g_hash_map[1048576]; 1048576 = 2^20，表示所有的长度为10的 DNA序列。...3.从DNA的第11个字符开始，按顺序遍历各个字符，遇到1个字符即将key右移2位 (去掉最低位)，并且将新的DNA字符s[i]转换为整数后，或运算最高位(第19 、20位)，g_hash_map[key...4.遍历哈希表g_hash_map，若g_hash_map[i] > 1，将i从低到高位转换为10个字符的DNA 序列，push至结果数组。
需求：计算快递单号的非重复计数 ? (一) 需求分析 如果要计算非重复计数，我们很容易可以想到一个函数DistinctCount，那如果直接使用是不是就可以了呢？...因为DistinctCount在计算非重复计数的时候会把空值也作为一个值来进行计算，所以导致数据上的差异。...快递单号非重复计数:=Calculate(DistinctCount('表1'[快递单号]), Filter('表1','表1'[快递单号]BLANK()) ) (三) 展现需求 最后我们把字段拖入到透视表中 ?...但是和我们要求的数据透视表有些许差异，结果是要求把订单号全部显示出来，而直接拖入字段后把没有快递单号的订单号给隐藏了。这里留个小悬念，可以自己动手实现下这个功能。
在NGS的数据分析中，去除PCR重复序列是一个常见的分析步骤，无论是WES/WGS的snp calling，还是chip_seq, ATAC_seq，都需要对原始的bam文件进行过滤，去除其中的PCR重复序列...在samtools中也提供了去除PCR重复的命令markdup, 该命令对输入的bam文件有以下两点要求 必须是经过samtools fixmate命令处理之后的文件 必须是按照比对上染色体坐标位置排序之后的文件...另外，由于fixmate命令要求输入的bam文件为按照read name,即序列名称排序之后的文件，所以在使用markdup命令时，需要以下4步转换过程 # 第一步，按照read name排序bam文件...2. picard MarkDuplicates picard的MarkDuplicates命令称得上是使用的最广泛的去除PCR重复的工具了，要求输入的bam文件为按照比对位置排序之后的文件，用法如下...input.bam # 第二步，运行markdup命令 sambamba markdup positionsort.bam markdup.bam 除了这三种方法之外，还有很多的工具可以去除PCR重复序列
引言 在软件开发中，数据处理常常面临重复数据的问题。去重与统计重复次数是数据处理中不可或缺的一部分。Java提供了多种方式来实现对象的去重与重复计数。...本文将通过分析一段代码，详细讲解如何在Java中实现对象的去重和重复计数，并探讨其原理、应用场景和优化策略。...小结 通过对以上代码的详细解析，我们可以清楚地看到，利用Java的集合框架以及重写 equals 和 hashCode 方法，可以方便地实现对象的去重与重复计数。...深入分析与扩展 计数的静态变量问题 在我们的示例中，计数变量 count 被设为静态的，这意味着它是所有 Person 对象共享的。这种设计适用于全局统计，而不是个别对象的计数。...结论 本文通过详细的代码示例和深入的分析，展示了如何在Java中实现对象的去重与重复计数。从基本的 HashSet 使用到高级的并发处理，我们探讨了多种实现方法和优化策略。
我的博客即将同步至腾讯云开发者社区，邀请大家一同入驻：https://cloud.tencent.com/developer/support-plan?...在研究 DNA 时，识别 DNA 中的重复序列有时会对研究非常有帮助。 编写一个函数来查找 DNA 分子中所有出现超多一次的10个字母长的序列（子串）。...方法返回true和false来判断子串是否出现超多一次，但是字符串保存的空间消耗大。...复习一下位运算中的按位与或非 按位或规则： 1｜1=1 1｜0=1 0｜1=1 0｜0=0 按位与规则： 1&1=1 1&0=0 0&1=0 0&0=0 非运算规则： ~1=0 ~0=1 再复习一下十六进制...class Solution { public List findRepeatedDnaSequences(String s) { //ACGT的SCII码的二进制表示
Time Limit: 10 Sec Memory Limit: 162 MB Submit: 2987 Solved: 1111 Description 一个有n个结点的树，设它的结点分别为v1,...v2, …, vn，已知第i个结点vi的度数为di，问满足这样的条件的不同的树有多少棵。...给定n，d1, d2, …, dn，编程需要输出满足d(vi)=di的树的个数。 Input 第一行是一个正整数n，表示树有n个结点。第二行有n个数，第i个数表示di，即树的第i个结点的度数。...其中1<=n<=150，输入数据保证满足条件的树不超过10^17个。 Output 输出满足条件的树有多少棵。...上面是整棵树的排列方案 下面是每个点重复的方案 一边除乘一边除 // luogu-judger-enable-o2 #include #define int long long using
基因组注释包括基因组结构注释和基因组功能注释 结构注释的核心是基因识别，为了提高基因识别效率需要首先寻找并标记去除 重复的和低复杂性的序列。 什么是重复序列？...重复序列（repetitive sequence）是在基因组中不同位置出现的相同或对称性序列片段，一般不编码多肽。组织形式有两种：串联重复序列和分散重复序列。...分类 大致分三类： 低度重复序列 中度重复序列 高度重复序列 特点 GC含量低，AT含量高，3'和5'端有直接重复序列存在，有利形成环形结构。...常用数据库 GIRI的RepBase：常用的真核生物DNA重复序列数据库 RepeatMasker:常用的重复序列分析工具 ALU数据库：人和灵长类Alu重复片段 LINE-1数据库...： STR数据库：短的串联重复序列数据库，不再提供服务 ---- 1 RepeatMasker工具 这个工具有webserver版本和命令行版本 Using and Understanding
在Python脚本语言中，数据结构有许多种，常见的数据类型有：序列，映射与集合三大类型，其中序列又分为可变序列和不可变序列，可变序列有2类：列表(List)与字节数组(Byte Array)对象，不可变序列有...我们在编写脚本时，或多或少使用上面的数据类型作为基本数据类型或自身的容器，既然是容器，必要时我们需要统计容器中各元素出现的次数。接下来，我给大家分享几种统计的方法。...，然后使用for循环对color列表进行遍历，如果元素不在字典内，我们就对元素进行初始化赋值，对于后续重复出现的元素进行累加操作，这样就可以实现各元素次数的统计，如下图： 如果你不想初始化赋值，那么为了避免引发...0，如果是list，那么默认值为空列表[]，如果是集合，默认是空集合{}等等，然后按照字典的方式对其进行计数，下图是它的文档字符串： 肆 >>>使用collections模块的Counter类可以统计各元素的次数...这大概是最简单也是最便利的解决方式了，Counter类也是字典dict的子类，它接受一个可迭代的对象或者映射作为参数，生成的结果可以统计各元素的次数，当然它也可以获取前N最多计数次数，如下所示： 以上就是统计元素频数的几种方法
文章背景： 工作中，有时需要计算某一单元区域内不重复数字的个数。可以借助COUNTA和UNIQUE函数完成这一需求。下面介绍两种场景。...1 不重复数字计数（只包含数字） 表中，数量这一列都是数字。...D1单元格内的公式如下： =COUNT(UNIQUE(D4:D10)) 首先通过UNIQUE函数进行去重，然后通过COUNT函数计数。 （1）COUNTA 函数计算范围中不为空的单元格的个数。...（4）UNIQUE 函数返回列表或范围中的一系列唯一值。 2 不重复数字计数（包含数字和文本） 表中，数量这一列既有数字，也有文本。另外，有时需要对单元格区域进行筛选。...参考资料： [1] Excel指定条件下不重复计数的四种方法(https://www.sohu.com/a/483394565_408374) [2] COUNTA 函数(https://support.microsoft.com
CSS的规范中，有一个很奇特的特性，支持计数器的功能。... 这段代码表示了做一件事情的顺序，现在我们可以使用CSS的计数器来给这些步骤标注顺序。...每行之前都有了一个步骤的数字标注，很神奇吧。 这个属性自CSS2.1起开始写入规范，目前大多数主流的浏览器都可以支持，唯一不支持的就是IE7了。...这个特性看起来简单，但是如果我们能够合理的使用，效果还是非常好的。 参考资料： 1、Learn to count with CSS
Python内建的 collections 集合模块中的 Counter 类能够简洁、高效的实现统计计数。...虽然 Counter 中的 count 表示的是计数，但是 Counter 允许 count 的值为 0 或者负值。...mapping 类型的数据是一样的，但是由于字典中的键是唯一的，因此如果字典中的键重复会保留最后一个。...，但是不同于字典，如果指定的关键词重复，程序会抛出SyntaxError异常。...当其中某个 Counter 中对应的元素不存在的时候，默认将其计数设置为 0，这也是为什么'd'的计数为-2的原因。
一、题目描述 所有 DNA 都由一系列缩写为 'A'，'C'，'G' 和 'T' 的核苷酸组成，例如："ACGAATTCCG"。在研究 DNA 时，识别 DNA 中的重复序列有时会对研究非常有帮助。...编写一个函数来找出所有目标子串，目标子串的长度为 10，且在 DNA 字符串 s 中出现次数超过一次。...L 的滑动窗口。...检查滑动窗口中的序列是否在 HashMap中。 如果是，则找到了重复的序列，将序列假如到HashSet中。 否则，将序列添加到 HashMap中。...在执行的循环中，有N−L+1 个长度为 L 的子字符串，这会导致 O((N−L)L) 时间复杂性。
今天和大家聊的问题叫做 重复的DNA序列 ，我们先来看题面： https://leetcode-cn.com/problems/reverse-words-in-a-string-ii/ All DNA...题意 所有 DNA 都由一系列缩写为 'A'，'C'，'G' 和 'T' 的核苷酸组成，例如："ACGAATTCCG"。在研究 DNA 时，识别 DNA 中的重复序列有时会对研究非常有帮助。...，出现多次的就是结果。...beginIndex) { string tempRes = s.substr(beginIndex, 10); if (++myMap[tempRes] == 2) {//第一次出现两次，避免重复...，你们的支持是我最大的动力 。
前文介绍了重复匹配问题的动态规划算法，但是遗留了重复结果输出的问题。本文对该问题进行了补充说明。 前文《序列匹配(五)——重复匹配问题的动态规划算法》介绍了重复匹配问题的动态规划算法。 ? ?...但是这个公式在回溯时会出现重复结果输出的问题，比如： ? ? 校正公式和代码 ? ? 这样的公式目前还没有出现重复结果输出的问题： ? ? ? 相应的代码放在了文末。 对比对总长度的估计 ? ?...i) { // 保证序列s的每个字符都比对上 for (k = n - 1; k >= 0; k--) printf("%c", saln[k]);...i) { // 保证序列s的每个字符都比对上 for (k = n - 1; k >= 0; k--) printf("%c", saln[k]);...= 0 是很有必要的，否则A(0,0)=F(0,0)会导致重复结果输出 for (j = 1; j <= n; j++) aUnit[0][j]->M = gap; //
RepeatMasker软件用于查找基因组上的重复序列，默认情况下，会将重复序列原有的碱基用N代替，从而达到标记重复序列的目的。...除此之外，也可以采用将重复序列转换为小写或者直接去除的方式，来标记重复序列。 该软件将输入的DNA序列与Dfam和Repbase数据库中已知的重复序列进行比对，从而识别输入序列中的重复序列。...在Sequence中输入或者上传FASTA格式的DNA序列；Search Engine选择比对软件，Speed/Sensitivity选择运行模式，不同模式的主要区别在于运行速度与敏感度的差异，DNA.../configure 需要注意的是，至少需要安装上述四种比对软件中的任意一种。...运行完成后，会生成多个文件，后缀为masked的文件为标记重复序列后的文件，后缀为.out的文件保存了重复序列区间信息。
之前有写过 找出数组中只出现一次的数，今天再来看下怎么找出数组中重复出现的数。 有一个长度为 n 的数组，所有的数字都在 0~n-1 的范围，现在要求找出数组中任意一个重复的数字。...思路一： 先给数组排序，然后再遍历一遍有序数组，依次比较相邻元素，就很容易能找出数组中重复的值。使用快排排序的话时间复杂度为 O(nlogn) 。...#arr数组中没有重复元素的情况 #数组长度为7，元素范围为0-6 arr = [0,1,2,3,4,5,6] arr[0] == 0 arr[1] == 1 arr[2] == 2 我们通过一个具体的例子来捋一捋思路...== i，换句话说就是不断的调整数组，使其满足 arr[i] == i，比如数组中第一个元素 arr[0] 为 4 ，那就要把元素 4 放到下标为 4 的位置上去。...推荐文章： 找出数组中只出现一次的数 我给自己配置的第一份保险 每天微学习, 长按加入一起成长.
题目描述： 在一个长度为 n 的数组里的所有数字都在 0 到 n-1 的范围内。数组中某些数字是重复的，但不知道有几个数字是重复的，也不知道每个数字重复几次。请找出数组中任意一个重复的数字。...因此不能使用排序的方法，也不能使用额外的标记数组。 对于这种数组元素在 [0, n-1] 范围内的问题，可以将值为 i 的元素调整到第 i 个位置上进行求解。...在调整过程中，如果第 i 位置上已经有一个值为 i 的元素，就可以知道 i 值重复。...以 (2, 3, 1, 0, 2, 5) 为例，遍历到位置 4 时，该位置上的数为 2，但是第 2 个位置上已经有一个 2 的值了，因此可以知道 2 重复： public int duplicate(
题目描述 在一个长度为n的数组里的所有数字都在0到n-1的范围内。 数组中某些数字是重复的，但不知道有几个数字是重复的。也不知道每个数字重复几次。请找出数组中任意一个重复的数字。...例如，如果输入长度为7的数组{2,3,1,0,2,5,3}，那么对应的输出是第一个重复的数字2。 解题思路 最简单的就是用一个数组或者哈希表来存储已经遍历过的数字，但是这样需要开辟额外的空间。...如果题目要求不能开辟额外的空间，那我们可以用如下的方法： 因为数组中的数字都在0~n-1的范围内，所以，如果数组中没有重复的数，那当数组排序后，数字i将出现在下标为i的位置。...如果是，则接着扫描下一个数字；如果不是，则再拿它和m 位置上的数字进行比较，如果它们相等，就找到了一个重复的数字（该数字在下标为i和m的位置都出现了），返回true；如果它和m位置上的数字不相等，就把第...duplication like pointor in C/C++, duplication[0] equal *duplication in C/C++ // 这里要特别注意~返回任意重复的一个
题目 所有 DNA 都由一系列缩写为 A，C，G 和 T 的核苷酸组成，例如：“ACGAATTCCG”。 在研究 DNA 时，识别 DNA 中的重复序列有时会对研究非常有帮助。...编写一个函数来查找 DNA 分子中所有出现超过一次的 10 个字母长的序列（子串）。...k=10; while(i < k-1) { num <<= 2; num |= m[s[i++]];//生成前9位字符的二进制编码表示...s.size()) { num = (num<<2)&~(3<<2*k); //num左移两位，3（11）移动20位，取反变成00，把出去的高位抹掉...num |= m[s[i]];//加入后面进来的 c[num]++; if(c[num]==2)//第二次出现，加入答案
【题目】 所有 DNA 由一系列缩写为 A，C，G 和 T 的核苷酸组成，例如：“ACGAATTCCG”。在研究 DNA 时，识别 DNA 中的重复序列有时会对研究非常有帮助。...编写一个函数来查找 DNA 分子中所有出现超多一次的10个字母长的序列（子串）。...示例: 输入: s = "AAAAACCCCCAAAAACCCCCCAAAAAGGGTTT" 输出: ["AAAAACCCCC", "CCCCCAAAAA"] 【思路】 对长度为10的子字符串进行计数...，选择计数大于1的字符串。...s.size()-9; i++){ str = s.substr(i, ); d[str]++; } // 出现次数大于1的子字符串
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