首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

R:具有自定义变量重要性的Caret rfe permimp

在R语言中,Caret包是一个非常流行的机器学习工具包,它提供了一套统一的界面和函数,用于在R中进行各种机器学习任务。其中,rfe(Recursive Feature Elimination)是Caret包中的一个函数,用于特征选择。

特征选择是机器学习中的一个重要步骤,它的目的是从原始数据中选择出最具有预测能力的特征,以提高模型的性能和泛化能力。rfe函数通过递归地进行特征选择,每次迭代都会剔除最不重要的特征,直到达到指定的特征数量或者达到指定的性能指标。

在rfe函数中,permimp参数用于指定自定义变量重要性的计算方法。自定义变量重要性是一种衡量特征重要性的方法,它可以根据特征的变化对模型性能的影响程度来评估特征的重要性。

常用的自定义变量重要性计算方法包括:

  1. Random Forest Importance(随机森林重要性):通过构建随机森林模型,计算每个特征在模型中的平均不纯度减少程度,来评估特征的重要性。
  2. Boruta Importance(Boruta重要性):通过构建随机森林模型,并与随机生成的“影子特征”进行比较,来评估特征的重要性。
  3. LASSO(Least Absolute Shrinkage and Selection Operator):通过L1正则化方法,将不重要的特征的系数收缩到零,从而实现特征选择。
  4. Elastic Net(弹性网络):结合L1和L2正则化方法,既能选择重要特征,又能保留高度相关的特征。
  5. Recursive Feature Addition(递归特征添加):从一个空模型开始,逐步添加特征,直到达到指定的特征数量或者达到指定的性能指标。

对于Caret包中的rfe函数,可以根据具体的需求选择合适的自定义变量重要性计算方法,并通过permimp参数进行指定。在实际应用中,可以根据特征的类型、数据的分布以及模型的要求来选择合适的自定义变量重要性计算方法。

腾讯云相关产品和产品介绍链接地址:

腾讯云提供了一系列与云计算相关的产品和服务,包括云服务器、云数据库、云存储、人工智能、物联网等。具体推荐的产品和产品介绍链接如下:

  1. 云服务器(CVM):提供弹性、可靠、安全的云服务器实例,满足不同规模和需求的应用场景。详细介绍请参考:https://cloud.tencent.com/product/cvm
  2. 云数据库MySQL版(CDB):提供高性能、高可用的云数据库服务,支持自动备份、容灾、监控等功能。详细介绍请参考:https://cloud.tencent.com/product/cdb_mysql
  3. 云存储(COS):提供安全、可靠、低成本的云存储服务,支持多种数据存储和访问方式。详细介绍请参考:https://cloud.tencent.com/product/cos
  4. 人工智能(AI):提供丰富的人工智能服务,包括图像识别、语音识别、自然语言处理等。详细介绍请参考:https://cloud.tencent.com/product/ai
  5. 物联网(IoT):提供全面的物联网解决方案,包括设备接入、数据管理、应用开发等。详细介绍请参考:https://cloud.tencent.com/product/iot

以上是腾讯云在云计算领域的一些相关产品和服务,可以根据具体需求选择合适的产品来支持和扩展云计算应用。

页面内容是否对你有帮助?
有帮助
没帮助

相关·内容

R语言随机森林模型中具有相关特征变量重要性

p=13546 ---- 变量重要性图是查看模型中哪些变量有趣好工具。由于我们通常在随机森林中使用它,因此它看起来非常适合非常大数据集。...大型数据集问题在于许多特征是“相关”,在这种情况下,很难比较可变重要性解释。 为了获得更可靠结果,我生成了100个大小为1,000数据集。...顶部紫色线是的可变重要性值 ,该值相当稳定(作为一阶近似值,几乎恒定)。红线是的变量重要性函数, 蓝线是的变量重要性函数 。例如,具有两个高度相关变量重要性函数为 ?...实际上,我想到是当我们考虑逐步过程时以及从集合中删除每个变量时得到结果, apply(IMP,1,mean)} 在这里,如果我们使用与以前相同代码, 我们得到以下图 plot(C,VI[2,]...然而,当我们拥有很多相关特征时,讨论特征重要性并不是那么直观。

1.9K20

R语言随机森林模型中具有相关特征变量重要性

p=13546 ---- 变量重要性图是查看模型中哪些变量有趣好工具。由于我们通常在随机森林中使用它,因此它看起来非常适合非常大数据集。...大型数据集问题在于许多特征是“相关”,在这种情况下,很难比较可变重要性解释。...红线是的变量重要性函数,    蓝线是的变量重要性函数   。例如,具有两个高度相关变量重要性函数为 看起来  比其他两个  要  重要得多,但事实并非如此。...我想我发现图形混乱,因为我可能会想到  重要性     恒定。考虑到其他变量存在,我们已经掌握了每个变量重要性。...关联度接近1时,与具有相同   ,并且与蓝线相同。 然而,当我们拥有很多相关特征时,讨论特征重要性并不是那么直观。

2K20

使用R语言进行机器学习特征选择①

使用caret包,使用递归特征消除法,rfe参数:x,预测变量矩阵或数据框,y,输出结果向量(数值型或因子型),sizes,用于测试特定子集大小整型向量,rfeControl,用于指定预测模型和方法一系列选项...特征重要性可以通过构建模型获取。...一些模型,诸如决策树,内建有特征重要性获取机制。另一些模型,每个特征重要性利用ROC曲线分析获取。...varImp用于获取特征重要性。从图中可以看出glucose, mass和age是前三个最重要特征,insulin是最不重要特征。...特征选择一个流行自动方法称为 递归特征消除(Recursive Feature Elimination)或RFE。 下例在Pima Indians Diabetes数据集上提供RFE方法例子。

3.5K40

机器学习-R-特征选择

使用caret包 使用递归特征消除法,rfe参数 x,预测变量矩阵或数据框 y,输出结果向量(数值型或因子型) sizes,用于测试特定子集大小整型向量 rfeControl,用于指定预测模型和方法一系列选项...Caret R包提供findCorrelation函数,分析特征关联矩阵,移除冗余特征 [python] view plain copy set.seed(7) # load the library...一些模型,诸如决策树,内建有特征重要性获取机制。另一些模型,每个特征重要性利用ROC曲线分析获取。...varImp用于获取特征重要性。从图中可以看出glucose, mass和age是前三个最重要特征,insulin是最不重要特征。...特征选择一个流行自动方法称为 递归特征消除(Recursive Feature Elimination)或RFE。 下例在Pima Indians Diabetes数据集上提供RFE方法例子。

2K80

机器学习-R-特征选择

使用caret包 使用递归特征消除法,rfe参数 x,预测变量矩阵或数据框 y,输出结果向量(数值型或因子型) sizes,用于测试特定子集大小整型向量 rfeControl,用于指定预测模型和方法一系列选项...Caret R包提供findCorrelation函数,分析特征关联矩阵,移除冗余特征 [python] view plain copy set.seed(7) # load the library...一些模型,诸如决策树,内建有特征重要性获取机制。另一些模型,每个特征重要性利用ROC曲线分析获取。...varImp用于获取特征重要性。从图中可以看出glucose, mass和age是前三个最重要特征,insulin是最不重要特征。...特征选择一个流行自动方法称为 递归特征消除(Recursive Feature Elimination)或RFE。 下例在Pima Indians Diabetes数据集上提供RFE方法例子。

1.5K50

机器学习中特征选择(变量筛选)方法简介

理论非常复杂,实在不是一个临床医生能完全掌握,以下简单介绍下,感兴趣自己看书,后续会推一些相关R使用教程。...3种方法简单解释如下,以后单独演示时会专门再解释: 过滤法:进行变量选择时不考虑模型表现和变量重要性等,只是通过变量自身情况、变量关系进行选择。...包装法:变量选择考虑到了模型表现和变量重要性等信息,属于是对每一个模型进行“量身定制”变量 嵌入法:变量选择过程就在模型训练过程之中 R语言中实现 后续主要介绍3个包:caret、mlr3、tidymodels...caret包中封装法有递归特征消除(recursive feature elimination,rfe)算法,遗传算法(genetic algorithms,ga)和模拟退火(Simulated annealing...过滤法通过sbf函数实现,但其实部分数据预处理方法属于过滤法内容。 mlr3中变量选择主要包括两种:过滤法和包装法。不过和caret实现方法略有不同。

3K50

全代码 | 随机森林在回归分析中经典应用

(实际上面的输出中也已经有体现了),8个重要变量,0个可能重要变量 (tentative variable, 重要性得分与最好影子变量得分无统计差异),1个不重要变量。...变量少了可以用默认绘图,变量多时绘制图看不清,需要自己整理数据绘图。 定义一个函数提取每个变量对应重要性值。...从图中可以看出重要性排名前4变量都与“分享”相关 (分享产生阅读次数, 总分享人数, 总分享次数,首 次分享率),文章被分享对于增加关注是很重要。...绘制准确性随超参变化曲线 plot(borutaConfirmed_rf_default) 绘制贡献最高 20 个变量 (Boruta评估变量重要性跟模型自身评估重要性略有不同) dotPlot...机器学习第21篇 - 特征递归消除RFE算法 理论 机器学习第22篇 - RFE筛选出特征变量竟然是Boruta4倍之多 机器学习第23篇 - 更多特征变量却未能带来随机森林分类效果提升 机器学习相关书籍分享

51530

Feature Selection For Machine Learning in Python (Python机器学习中特征选择)

更新于2016年12月:修正了RFE部分关于所选择变量错字。感谢 Anderson。 ?...Python中机器学习特征选择 Baptiste Lafontaine照片,保留一些权利 特征选择 特征选择是一个过程,您可以自动选择数据中您感兴趣对预测变量或输出贡献(影响)最大特征。...这是一个二元分类问题,其中所有的属性都是数字。 1.单因素特征选择 可以使用统计测试来选择与输出变量具有最强(最紧密)关系那些要素。...分数表明了plas,age和mass重要性。...如果您正在寻找关于特征选择更多信息,请参阅以下相关文章: 使用Caret R软件包进行特征选择 提高特征选择准确性并减少训练时间 特征选择介绍 使用Scikit-Learn在Python中进行特征选择

1.7K60

第7章 模型评估 笔记

7.5 caret包对变量重要程度排序 得到监督学习模型后,可以改变输入值,比较给定模型输出效果变化敏感程度来评估不同特征对模型重要性。...31.116 total_eve_minutes 31.116 ... plot(importance) 扩展rpart等一些分类算法包中从训练模型中产生对象包含了变量重要性...这个费了好大劲,好像只有数值变量才行。...7.8 利用caret包选择特征 特征选择可以挑选出预测误差最低属性子集,有助于我们判断究竟应该使用哪些特征才能建立一个精确模型,递归特征排除函数rfe,自动选出符合要求特征。...[,c("churn")]) Accuracy Kappa 0.8520710 0.2523709 扩展 7.9 评测回归模型性能 均方根误差法RMSE,相对平方差RSE,可决系数R-Square

77520

R语言实现模型构建

在创建模型时候,需要从筛选变量、模型,数据分组,评估模型等一系列过程才能创建一个有实际意义模型。...今天就给大家介绍在R语言中一个工具包caret(Classificationand Regression Training)。此包是为了解决分类和回归问题数据训练而创建一个综合工具包。...首先看下包安装: install.packages("caret") 接下来我们看下在这个包中几个主要功能: 1. 数据分割。...lmProfile$variables#查看对应每个数量变量名称。 ? 4. 模型训练预测。在这里需要用到train函数进行模型构建具体参数如下: ?...如果使用了自定义性能指标(通过trainControl中summaryFunction参数,指标的值应该与其中一个参数匹配。

1.4K31

一套完整基于随机森林机器学习流程(特征选择、交叉验证、模型评估))

(实际上面的输出中也已经有体现了),54个重要变量,36个可能重要变量 (tentative variable, 重要性得分与最好影子变量得分无统计差异),6,980个不重要变量。...(boruta$finalDecision) ## ## Tentative Confirmed Rejected ## 32 46 8943 绘制鉴定出变量重要性...变量少了可以用默认绘图,变量多时绘制图看不清,需要自己整理数据绘图。 定义一个函数提取每个变量对应重要性值。...,这也太赞了吧 基于Caret和RandomForest包进行随机森林分析一般步骤 (1) Caret模型训练和调参更多参数解读(2) 基于Caret进行随机森林随机调参4种方式 机器学习第17篇...机器学习第21篇 - 特征递归消除RFE算法 理论 机器学习第22篇 - RFE筛选出特征变量竟然是Boruta4倍之多 机器学习第23篇 - 更多特征变量却未能带来随机森林分类效果提升 机器学习相关书籍分享

8.4K31

Boruta 和 SHAP :不同特征选择技术之间比较以及如何选择

在每次迭代中,扩展版本由原始数据与水平连接混洗列副本组成。我们只维护在每次迭代中特征: 比最好随机排序特征具有更高重要性; 比随机因素(使用二项式分布)好于预期。...决策树标准特征重要性方法倾向于高估高频或高基数变量重要性。对于 Boruta 和 RFE,这可能会导致错误特征选择。 本次实验 我们从 Kaggle 收集了一个数据集。...使用 RFE 选择某个特征次数(左);使用 RFE + SHAP 选择某个特征次数(右) 在我们案例中,具有标准重要性 RFE 显示是不准确。...它通常选择与 CustomerId 相关随机预测变量。SHAP + RFE 最好不要选择无用特征,但同时承认一些错误选择。 作为最后一步,我们重复相同过程,但使用 Boruta。...此外,我们使用 SHAP 替换了特征重要性计算。SHAP 有助于减轻选择高频或高基数变量影响。综上所述,当我们对数据有完整理解时,可以单独使用RFE

2K20

Boruta 和 SHAP :不同特征选择技术之间比较以及如何选择

在每次迭代中,扩展版本由原始数据与水平连接混洗列副本组成。我们只维护在每次迭代中特征: 比最好随机排序特征具有更高重要性; 比随机因素(使用二项式分布)好于预期。...决策树标准特征重要性方法倾向于高估高频或高基数变量重要性。对于 Boruta 和 RFE,这可能会导致错误特征选择。 本次实验 我们从 Kaggle 收集了一个数据集。...使用 RFE 选择某个特征次数(左);使用 RFE + SHAP 选择某个特征次数(右) 在我们案例中,具有标准重要性 RFE 显示是不准确。...它通常选择与 CustomerId 相关随机预测变量。SHAP + RFE 最好不要选择无用特征,但同时承认一些错误选择。 作为最后一步,我们重复相同过程,但使用 Boruta。 ?...此外,我们使用 SHAP 替换了特征重要性计算。SHAP 有助于减轻选择高频或高基数变量影响。综上所述,当我们对数据有完整理解时,可以单独使用RFE

2.7K20

将SHAP用于特征选择和超参数调优

例如,RFE(递归特征消除)或 Boruta 就是这种情况,其中通过算法通过变量重要性选择特征被另一种算法用于最终拟合。 当我们使用基于排名算法执行特征选择时,SHAP 会有所帮助。...我们没有使用由梯度提升生成默认变量重要性,而是选择最佳特征,例如具有最高 shapley 值特征。由于基于原生树特征重要性存在偏差,因此使用 SHAP 好处是显而易见。...标准方法倾向于高估连续或高基数分类变量重要性。这使得在特征变化或类别数量变化情况下重要性计算变得不可信。...它支持网格搜索或随机搜索,并提供排序特征选择算法,如递归特征消除 (RFE) 或 Boruta。额外提升包括提供使用 SHAP 重要性进行特征选择可能性。...给定分类场景中数据集,我们首先通过优化参数来拟合 LightGBM。然后我们尝试在优化参数同时使用默认基于树特征重要性来操作标准 RFE。最后,我们做同样事情,但使用 SHAP 选择特征。

2.3K30

这3个Scikit-learn特征选择技术,能够有效提高你数据预处理能力

我们需要清理数据,并应用一些预处理技术,以能够创建一个健壮和准确机器学习模型。 特征选择仅仅意味着使用更有价值特征。这里价值是信息。我们希望使用对目标变量有更多信息特性。...在一个有监督学习任务中,我们通常有许多特征(自变量),其中一些可能对目标(因变量)只有很少或没有价值见解。另一方面,有些特性非常关键,它们解释了目标的大部分差异。...例如,权重可以是线性回归系数或决策树特征重要性。 这个过程从在整个数据集上训练估计器开始。然后,最不重要特征被修剪。然后,用剩余特征对估计器进行训练,再对最不重要特征进行剪枝。...rfe.ranking_ array([4, 1, 2, 1, 1, 1, 3]) 根据重要性选择 SelectFromModel 就像RFE一样,SelectFromModel与具有coef或feature_importantances...作者 Soner Yıldırım deephub翻译组 DeepHub 微信号 : deephub-imba

84120

一文教你如何全面分析股市数据特征

导读: 本文主要从股市数据变量特征分布及特征重要性两个角度对数据进行分析。 通过绘制图表等方法分析特征本身对分布状况或特征间相互关系。...特征重要性 通过多种方式对特征重要性进行评估,将每个特征特征重要得分取均值,最后以均值大小排序绘制特征重要性排序图,直观查看特征重要性。...对因变量 影响大小参数。...RFE稳定性很大程度上取决于在迭代时候底层用哪种模型。...例如,假如RFE采用普通回归,没有经过正则化回归是不稳定,那么RFE就是不稳定;假如采用是Ridge,而用Ridge正则化回归是稳定,那么RFE就是稳定

1.9K30

5种数据科学家必须知道特征选择方法

嵌入式:嵌入式方法使用具有内置特征选择方法算法,例如:Lasso和RF有自己特征选择方法。...卡方(chi-squared) 这是另一种基于过滤器方法。 在这种方法中,计算目标和数值变量之间的卡方度量,只选择具有最大卡方值变量。 ?...如前所述,嵌入式方法使用具有内置特征选择方法算法。 例如,Lasso和RF有自己特征选择方法。Lasso Regularizer强制将许多特征权重归零。这里使用Lasso来选择变量。...基于树:SelectFromModel 我们还可以使用随机森林,根据特征重要性选择特征。 我们使用每个决策树中节点杂质计算特征重要性。...在随机森林中,最终特征重要性是所有决策树特征重要性平均值。

1.5K30

【特征工程】不容错过 5 种特征选择方法!

1、方差阈值特征选择 具有较高方差特征表示该特征内值变化大,较低方差意味着要素内值相似,而零方差意味着您具有相同值要素。...如果我们希望出于监督学习目的而选择功能怎么办?那就是我们接下来要讨论。 2、SelectKBest特征特征 单变量特征选择是一种基于单变量统计检验方法,例如:chi2,Pearson等等。...,因此我们将特征分为独立变量和因变量。...首先对估计器进行初始特征集训练,然后通过coef_attribute或feature_importances_attribute获得每个特征重要性。 然后从当前特征中删除最不重要特征。...一样,你可以使用任何机器学习模型来选择功能,只要可以调用它来估计特征重要性即可。

85310
领券