头脑风暴 我有一个设想： 用root权限，新建一个环境R4.1，然后在里面安装R4.1 在R4.1中安装那几个包 将Rstudio的R版本设置为新建环境的R4.1 我的顾虑： 不确定我用root新建的环境...，能不能让大家使用 不确定Rstudio-server能不能指定新建环境中的R4.1版本 3....新建conda环境并激活进入 因为conda环境还挺大，所以我在空间大的地方，新建文件夹R4.1_and_Rstudio 「新建环境：」 conda create -p /mnt/data/R4.1_and_Rstudio...其它人用Rstudio-server安装R包 因为现在Rstudio-server用的是conda环境中的R4.1，它会在conda环境中有一个library，普通用户没有写入的权限，安装R包时会在自己的路径下自动新建一个...2，外部是可以用conda环境中的程序的，指定路径就行。
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来回答VIP会员群中两位观众老爷的问题，「R中计算效应值及如何无缝拼图」，下面通过两个案例来进行展示，结果仅供参考，希望各位观众老爷能够喜欢。...❞加载R包 library(tidyverse) library(magrittr) library(patchwork) library(aplot) library(cowplot) R种计算效应值大小...（SST） SST <- sum((data$outcome - mean(data$outcome))^2) # 计算Eta-squared eta_squared <- SSB / SST ❝R中用于拼图的包有很多...，小编常用的主要有「patchwork」，「cowplot」两款，当然「aplot」也属于拼图包的范畴，但是要实现无缝隙的拼图显然「cowplot」更胜一筹。...+p2+plot_layout(guides = 'collect') aplot拼图 p1 %>% insert_right(p2) cowplot拼图 ggdraw()+ draw_plot
1、R中重复值的处理 unique函数作用：把数据结构中，行相同的数据去除。...：unique，用于清洗数据中的重复值。...2、R中缺失值的处理 缺失值的产生 ①有些信息暂时无法获取 ②有些信息被遗漏或者错误处理了 缺失值的处理方式 ①数据补齐（例如用平均值填充） ②删除对应缺失值（如果数据量少的时候慎用） ③不处理 na.omit...<- na.omit(data) 3、R中空格值的处理 trim函数的作用：用于清除字符型数据前后的空格。...') 使用R.studio的小伙伴，在下载包很慢的的时候，可以使用R的官网站点，在中国地区会快很多，以解决此问题。
有朋友问两个比值数据，怎么求他们的 p 值？ 例如，两组人，分别接受两种药物治疗，想知道疗效之间是否有差异，计算 p 值。 接受药物 1 治疗，30 人，其中 20 人有疗效，10 人没有疗效。...直观上判断，药物 1 的疗效要好（20:10 vs 10:20），但与药物 2 的疗效相比，是否达到了显著性的差异了呢？...值 = 0.01938，如果显著性阈值定为 0.05，则两种药物的疗效达到了统计学意义的上差异。...另外判断差异时，不仅要看 p 值，还要看 OR 值，这里的 OR 值 = 3.901234，其 95 % 置信区间为 1.212812 - 13.467843，是有意义的。...OR 的置信区间不能跨过 1，否则 p 值再小也无意义。
战战兢兢的我只能向老师汇报了，老师说DEseq2与edgeR算法上比较相似，可能对于这些p值为零的基因判定比较松，给的p为零值。...但是第三种差异分析的方式limma就不是，它用芯片分析的方法去做，给p值的判定比较严格。于是如获至宝的我，按照老师的指导进行了p值窜天高现象的探索与分析。...edgeR火山图 limma火山图 可以发现不同的工具对p值有着不同的控制程度，在DESeq2\edgeR中我们甚至可以发现p值为0的情况，那么p值小到什么程度会变成0呢，跳出p值，这么小的数在R中计算有意义吗...这些因素包括具体的计算方式、假设的违背程度、审稿人和期刊的偏好等。由于不同人对结果的偏好和重视程度不同，所以无法提供一个确定的用来报道的截断点。 在具体操作中，有几种常见的方法可以处理非常小的p值。...p值小于该领域内常用截断阈值，如基因组中常见的5E-08、1E-05 ---- 小结 在这篇推文中，我们讨论了以下几个问题： 如何检查自己机器的机器精度 R中p值小到什么程度会变成0 多大的数在R中计算有意义
P值广泛用于统计中，包括T检验、回归分析等。大家都知道，在假设检验中P值起到非常重要的作用。为了更好理解P值，先来看看什么是原（零）假设。 在假设检验中，什么是原（零）假设？...图片 什么是P值？ 天行健表示：P值是介于0和1之间的一个数值，用来测量你的数据和原假设有多大的相符性；P值表达的是，你的数据有多大的可能性呈现是一个真实的原假设？...它没有去测量对备择假设的支持有多大。...如果P值比较小(＜0.05）,那么你的样品（参数）有足够的证据告诉你，可以拒绝原假设，即新旧材料之间有差异； 如果P值>0.05,那么我们很难下结论说新旧材料间是明显差异的，只能说没有足够的数据和证据证明差异性...； 如果P值恰好等于0.05，那么我们很难有结论说有无明显差异，在这种情况下，需要收集更多的数据来重新计算P值；或者，冒着一定的风险认为新旧是有差异的。
该F检验和P值出场了 我其实一开始只想知道p-value在线性方程组里是怎么计算出来了，后来查到了是必须要通过F值才能够得到. F检验的公式形象化的理解就是： ?...要减去pfit的原因是随着你方程中的系数项越多，你也需要更多的样本数量才能够去拟合方程。比如你需要2个点才能确定一条直线，3个点来确定一个平面。...从上面的式子也看得出，这是一个分子大分母就小，分子小分母就大的式子，我甚至觉得长得有点像odds.... 那么这个式子又怎么得到我们的P值呢？...P值是检验样置信度的一个指标，一般我们认为p<=0.05时(一般选择这个显著水平)，模型的信号不存在偶然性，模型的结果可靠 ?...dof, expctd = chi2_contingency(obs, correction = False) p 0.59094761107842753 总结： R^2可以量化模型响应变量与因变量间的关系强弱
p=10809 本文用于比较六个不同统计软件程序（SAS，Stata，HLM，R，SPSS和Mplus）的两级分层线性模型的过程和输出 下面介绍的六个模型都是两级分层模型的变体，也称为多级模型，这是混合模型的特殊情况...请注意，像SAS和Mplus一样，SPSS报告方差分量的标准误差，而HLM和R报告标准差。我们无法得出结论，哪个更适合报告，但是差异不会影响这些参数的p值。 ...这与混合模型中的交互项有关，即通过外向的教师体验和按性别的教师体验。 SAS结果 在固定效果表中，有两个交互作用项，其中一个（）远不重要，p值> 0.5。 ...另外，ICC与模型5几乎完全相同，这意味着交互作用项不会改变按类别说明的差异比例： 总结 进行比较的目的是调查来自六个不同统计软件程序的嵌套两级层次模型的过程和结果可能存在的差异。...总体而言，我们发现SAS，Stata（带有reml选项），HLM，R和SPSS产生的实际估计值之间没有太大差异。Mplus使用另一种估算方法ML，这导致其估算值与其他估算值有所不同。
请注意，像SAS和Mplus一样，SPSS报告方差分量的标准误差，而HLM和R报告标准差。我们无法得出结论，哪个更适合报告，但是差异不会影响这些参数的p值。 ...这与混合模型中的交互项有关，即通过外向的教师体验和按性别的教师体验。 SAS结果 在固定效果表中，有两个交互作用项，其中一个（）远不重要，p值> 0.5。 ...这并不是说不应该将它们用于这种类型的分析，但是在向具有非结构化协方差矩阵的模型中添加更复杂的参数时，应谨慎使用。 与以前的模型一样，SAS，HLM和R的结果相对接近相等，而Mplus的估计略有不同。...另外，ICC与模型5几乎完全相同，这意味着交互作用项不会改变按类别说明的差异比例： 总结 进行比较的目的是调查来自六个不同统计软件程序的嵌套两级层次模型的过程和结果可能存在的差异。...总体而言，我们发现SAS，Stata（带有reml选项），HLM，R和SPSS产生的实际估计值之间没有太大差异。Mplus使用另一种估算方法ML，这导致其估算值与其他估算值有所不同。
p=21892 引言 多元统计分析 中，交互作用是指某因素作用随其他因素水平的不同而不同，两因素同时存在是的作用不等于两因素单独作用之和(相加交互作用)或之积(相乘交互作用)。...在一个回归模型中，我们想写的是 ? 当我们限制为线性模型时，我们写 ? 或者 ? 但是我们怀疑是否缺少某些因素……比如，我们错过所有可能的交互影响。我们可以交互变量，并假设 ?...这里有几种可能的交互作用（限制为成对的）。进行回归时观察到： ?...如果我们更改变量的“_含义_”（通过重新编码，通过排列真值和假值），将获得下图 glm(Y~X1+X2+X3+X1:X2+X1:X3+X2:X3,data=dbinv,family=binomial)...（相同变量的三种指标）和右边的部分不再有可能发生交互作用。
p=10809 简介 本文用于比较六个不同统计软件程序（SAS，Stata，HLM，R，SPSS和Mplus）的两级分层线性模型的过程和输出。...这与混合模型中的交互项有关，即通过外向的教师体验和按性别的教师体验。 SAS结果 在固定效果表中，有两个交互作用项，其中一个（）远不重要，p值> 0.5。...与以前的模型一样，SAS，HLM和R的结果相对接近相等，而Mplus的估计略有不同。...另外，ICC与模型5几乎完全相同，这意味着交互作用项不会改变按类别说明的差异比例： 总结 进行比较的目的是调查来自六个不同统计软件程序的嵌套两级层次模型的过程和结果可能存在的差异。...总体而言，我们发现SAS，Stata（带有reml选项），HLM，R和SPSS产生的实际估计值之间没有太大差异。Mplus使用另一种估算方法ML，这导致其估算值与其他估算值有所不同。
p=10809 简介 本文档用于比较六个不同统计软件程序（SAS，Stata，HLM，R，SPSS和Mplus）的两级分层线性模型的过程和输出。 ...这与混合模型中的交互项有关，即通过外向的教师体验和按性别的教师体验。 SAS结果 在固定效果表中，有两个交互作用项，其中一个（）远不重要，p值> 0.5。 ...与以前的模型一样，SAS，HLM和R的结果相对接近相等，而Mplus的估计略有不同。...另外，ICC与模型5几乎完全相同，这意味着交互作用项不会改变按类别说明的差异比例： 总结 进行比较的目的是调查来自六个不同统计软件程序的嵌套两级层次模型的过程和结果可能存在的差异。...总体而言，我们发现SAS，Stata（带有reml选项），HLM，R和SPSS产生的实际估计值之间没有太大差异。Mplus使用另一种估算方法ML，这导致其估算值与其他估算值有所不同。
下面两第一个图是未加axis.break()的结果，第二幅是加了该参数的结果。...首先随机构造一个数据，，我们想把y为7~17的数数据进行截断。思路是：构造一列：type，把小于7的命名为“samll”，大于17的命名为“big”，然后利用facet效果构建图。...breaks[1]) %>% bind_rows(d) mymin = function(y) ifelse(y <= breaks[1], 0, breaks[2]) p...参考资料： R语言作图——坐标轴截断画图 http://blog.sina.com.cn/s/blog_6a4ee1ad0102x5at.html ggplot坐标轴截断 https://www.jianshu.com.../p/0e4fa8849479 代码，数据与相关资料已放在我的github上了，见文末阅读原文。
本文在做学术论文中，正好想做一下把y轴一些数据进行截断的效果。通过网上检索，整理了一下两种方式构建坐标轴截断图。...下面两第一个图是未加axis.break()的结果，第二幅是加了该参数的结果。...首先随机构造一个数据，，我们想把y为7~17的数数据进行截断。思路是：构造一列：type，把小于7的命名为“samll”，大于17的命名为“big”，然后利用facet效果构建图。...breaks[1]) %>% bind_rows(d) mymin = function(y) ifelse(y <= breaks[1], 0, breaks[2]) p...mymin(y), ymax = y)) + facet_grid(type ~ ., scales = "free") + theme(strip.text=element_blank()) p
今天在写一个android的程序时，本来想初始化一个list的集合，以避免第二次的数据添加在第一次的后面，就直接使用了对象=null,发现在给list集合添加数据后运行出现了这样的错误。...翻译下来的意思是 试图在空对象引用上调用接口方法的布尔java. U.List.Advices（java. Lang.Object）” 也就是说这个list集合并没有初始化。...查询资料后发现 比如： List list=new ArrayList(); new相当于开辟了一块新内存放入了对象，并把它的引用给了list.而 list=null 就相当于list...声明了一个空的对象的引用，并没有开辟新的空间，所以我在上面添加数据的时候就会出现空对象引用。...当然，这只是我个人的理解。学习中，还是得不断踩坑，哪怕这个坑很小。
在两个环境中看sed的命令，可以发现返回的并不相同： Linux环境中： ? linux MacOS环境中： ? MacOs 其二个显示的是所有的了，明显比linux中的命令少。...如果在MacOS中执行sed -i 命令的话，会提示：invalid command code； 改成 sed -i .bak 或者在正则表达式之前加"" （比如sed -i "" 's/ /_/g'...此外，两者对于\n的处理也不相同。 这是由于MacOS自带的sed等命令是基于BSD的，存在一些不足。
作业要求：高低不同的汽油对汽车油耗作二因素方差分析 作业数据：三种品牌的汽车X、Y、Z；四种标号（A、B、C、D） A B C D X 21.8 22.4 20.6 23.1 Y 31.3 34.2...30.6 33.7 Z 23.1 27.3 26.1 28.6 解： 第一步：数据整理导入 1.1 整理成下方的表格样式，方便分析； 1.2 导入数据到SPSS 1.3在【变量试图】里面设置...如图： 1.5点击【值标签】，还可以检验 第二步：方差分析 菜单： 【分析】→【一般线性模型】→【单变量】 SPSS里【单变量】指的是因变量Y有一个 点击【模型】 若想设置【交互作用】，...可进行如下操作，本题假设无交互作用； 点击【选项】，点选里面的【齐性检验】 得出结论： 由方差分析表可知 行因素的P值为0.000<0.05，拒绝原假设，说明不同汽车品牌对耗油量有显著差异...； 列因素的P值为0.039<0.05，拒绝原假设，说明不同汽油种类对耗油量有显著差异； 版权声明：本文内容由互联网用户自发贡献，该文观点仅代表作者本人。
索引数据框中的某一列 df$A可以索引数据框df中列名为A的列的所有值。那么假如列名是一个R对象怎么做？...分别指定为x轴和y轴）指定绘图属性，但如果列名字是一个R对象呢？...sym把一个R字符串对象转换为一个symbol。 (bang-bang操作符)!!则把symbol再转回R字符串对象，等同于直接写这个对象。...看新的例子中，xvariable="A"；xvariable_en <- sym(xvariable)转换为了symbol；aes(x=!!xvariable_en)等同于直接写aes(x=A)。...兜兜转转，2步转换把想传的值传进去了。 # 注意sym和!!
了解R是如何存储数据的将对R的机制、性能的理解亦或是代码的优化都有帮助。...绑定（binding）与 引用（reference） 将c(1, 2, 3)赋值给变量x时，实际上是将数值向量绑定到x上的过程，变量x称为引用。 ?...列表 列表存储的是数值引用的引用。 l1 <- list(1, 2, 3) ? 重新赋值给新的变量，也是创建一个引用。 ?...当对列表l2进行修改时，有意思的地方来了：下面l2只是将第3个元素的引用指向新的数值。 l2[[3]] <- 4 ?...不过R这里会使用一个全局字符串池，字符串向量的每一个元素实际上是池中唯一字符串的一个指针。 ? 以上内容整理自《Advanced R》
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