R中的glht函数与手工计算的结果不同

可能是由于以下原因：

1. 数据处理不一致：glht函数在进行多重比较时，可能会对数据进行一些预处理或转换，以满足统计模型的要求。如果手工计算时没有进行相同的数据处理，就会导致结果不同。
2. 统计模型不同：glht函数使用的统计模型可能与手工计算使用的模型不同。不同的模型会导致计算结果的差异。
3. 假设检验方法不同：glht函数可能使用不同的假设检验方法来计算多重比较的结果。如果手工计算时使用了不同的方法，就会得到不同的结果。
4. 参数设置不同：glht函数可能有一些默认参数或选项，如果手工计算时没有设置相同的参数，就会导致结果不同。

为了解决这个问题，可以尝试以下方法：

1. 仔细查看glht函数的文档和参数说明，确保使用正确的参数和选项。
2. 检查数据处理的一致性，确保手工计算和glht函数使用相同的数据处理方法。
3. 确认手工计算使用的统计模型和假设检验方法，并与glht函数的默认设置进行比较。

如果问题仍然存在，可以尝试使用其他的R包或函数进行多重比较，或者咨询专业的统计学家或数据科学家来获取更准确的结果。