可视化沿垂直轴的分布 一次性可视化多个分布的最简单的方法是将数据的均值或者中位值显示为点,同时通过误差线来显示点上下的波动。例如下图就是这样的可视化结果。 ? ?的可视化存在很多问题。...顶部和底部线条要么延伸到数据的最大值和最小值,要么延伸到框高的1.5倍以内的最大值或最小值,取其较短者为准。对于超过框高1.5倍的使用点来进行表示,表示离群值。对于?...对于小提琴图而言,虽然其可以显示数据的分布密度。但是这个图和之前介绍的密度图一样,都有一个缺点是,会在没有数据的地方绘制曲线。这个我们可以通过绘制具体的数据点来规避这个问题。...如果想显示一段时间内的分布趋势,则脊线图通常会表现得特别好。 山脊图本质上就是多个密度图放到一起的结果。它类似于小提琴图。但是在可视化方面使人们能够更好的理解数据。...例如,下图两个在11月的35华氏度和50华氏度下峰就比上面的小提琴图容易看出来。 ? 另外,脊线图可缩放到非常大量的分布。例如,图9.11显示了从1913年到2005年的电影长度分布。
,还有几何平均数和调和平均数。...(七)离差 离差=标准计分*10+50 (八)机率密度函数 是一个描述这个随机变量的输出值,在某个确定的取值点附近的可能性的函数,它的公式 我们可以先不用管它的概念和公式,只要记住两点:1、这个机率密度函数是以平均值为中心呈左右对称...;2、它会受到平均值和标准差的影响 可以想象一下,一张直方图之间的组距不断缩小,当缩小到极限的时候就变成了曲线图,那么这个曲线的公式就是机率密度公式。...MTT法药物作用不同时间,细胞的增殖情况,肯定不是只有两组数据的。...0h的数据比较,那么我们怎么能一次性求出各组pvalue呢(我之前用的是特别笨的方法,把每组数据和0h数据按照t test 方法算,然后再添加到总的图片中)点击analyze>选择one-wayANOVA
那么今天我们就为大家介绍一下目前在R语言中流行的绘图包ggplot2。 1. ggplot2的安装:install.packages("ggplot2")。...,由斜率和截距指定 geom_area 面积图(即连续的条形图) geom_bar 条形图 geom_bin2d 二维封箱的热图 geom_blank 空的几何对象,什么也不画 geom_boxplot...箱线图 geom_contour 等高线图 geom_crossbar crossbar图(类似于箱线图,但没有触须和极值点) geom_density 密度图 geom_density2d 二维密度图...) geom_vline 竖直线 统计变换函数 描述 stat_abline 添加线条,用斜率和截距表示 stat_bin 分割数据,然后绘制直方图 stat_bin2d 二维密度图,用矩阵表示 stat_binhex...几何对象(geom_)上面指定的图形属性需要呈现在一定的几何对象上才能被我们看到,这些承载图形属性的对象可能是点,可能是线,可能是bar stat :统计变换比如求均值,求方差等,当我们需要展示出某个变量的某种统计特征的时候
,图片来自作者 从图上可以看出,似乎处理组的收入的估计核密度有“更胖的尾巴”(更高的方差),但组间均值更为相似。...3.用相似的方法计算第二组的U₂ 4.统计检验量是stat = min(U₁, U₂) 在两个分布之间没有系统秩差(即中位数相同)的零假设下,检验统计量在均值和方差已知的情况下,是渐近正态分布的。...计算R和U的直观方法是:如果第一个样品的值都大于第二个样品的值,那么R₁= n₁(n₁+ 1)/2,因此,U₁将为零(可得到的最小值)。...小提琴图 结合了汇总统计和核密度估计的箱线图的一个很好的扩展是小提琴图。小提琴图显示了沿y轴的独立密度,所以他们不会重叠。默认情况下,它还在内部添加一个微型箱线图。...脊线图 最后,脊线图沿x轴绘制多个核密度分布,比小提琴图更直观,但部分重叠。不幸的是,在matplotlib和seaborn中都没有默认的脊线图。我们需要从joypy导入它。
二维平面两点 与 两点间的曼哈顿距离为: 推广到N维空间, 与 之间的曼哈顿距离为: 在上图中,绿色线条表示的为欧式距离,红色线条表示的为曼哈顿距离,黄色线条和蓝色线条表示的为曼哈顿距离的等价长度...常用聚类算法 K均值聚类 ① 定义 K均值聚类(k-means clustering)算法是一种常用的、基于原型的聚类算法,简单、直观、高效。...第二步:计算每个聚类的几何中心,如果几何中心与聚类中心不重合,再以几何中心作为新的聚类中心,重新划分聚类....point):除了孤立样本和外周样本以外的样本都是核心点; 上图中,A和B为核心点,C为边界点,D为噪声点....算法缺点 (1)当数据量过大时,要求较大的内存支持I/O消耗很大; (2)当空间聚类的密度不均匀、聚类间距差别很大时、聚类效果有偏差; (3)邻域半径和最少样本数量两个参数对聚类结果影响较大.
箱线图(Boxplot)是一种用于展示一组数据分布特征的图形,它能够提供以下信息:中位数:箱线图中的中位线表示数据的中位数。...density: 密度参数,可能用于调整箱线图内密度图的显示。legend.h: 图例的高度。legend.x.pos 和 legend.y.pos: 图例在图表中的位置。...数据框,并设置分组变量 Group 映射到 x 轴,指标 Index 映射到 y 轴,同时 Group 映射到颜色,用于区分不同组的颜色。...stat_boxplot(geom = "errorbar", width = 0.15):添加一个箱线图的统计变换,这里使用 errorbar 几何对象,宽度设置为 0.15,这可能是用来表示箱线图的中位数线或四分位数范围的误差条...geom_boxplot(width = .4, outlier.shape = NA):添加一个箱线图几何对象,箱子的宽度设置为 0.4,并且移除异常值(outliers)的点。
描述性统计分析(Description Statistics)是通过图表或数学方法,对数据资料进行整理、分析,并对数据的分布状态、数字特征和随机变量之间的关系进行估计和描述的方法。...几何平均数,多用于流程转化中的平均,比如多步骤的转化率求平均值 data = df['武力'] #简单算数平均数 np.average(data) #加权平均数 np.average(data,weights...我平时喜欢用的小提琴图(violin plot)用于显示数据分布及其概率密度。它结合了箱形图和密度图的特征,主要用来显示数据的分布形状。...离中趋势分析 极差 极差又被称为全距,是指数据集合中最大值与最小值的差值 # 极差 np.max(df['武力'])-np.min(df['武力']) 方差、标准差 方差是度量随机变量和其数学期望(即均值...偏态系数 以平均值与中位数之差对标准差之比率来衡量偏斜的程度。偏态系数小于 0,因为平均数在众数之左,是一种左偏的分布,又称为负偏。
小提琴图查看异常值 小提琴图Violin Plot是用来展示多组数据的分布状态以及概率密度。这种图表结合了箱形图和密度图的特征,主要用来显示数据的分布形状。跟箱形图类似,但是在密度层面展示更好。...偏态系数的计算: 未分组数据: 分组数据: 是否存在: SK=0对称分布 SK>0右偏分布 SK<0左偏分布 偏态的程度: 低度偏态分布 中等偏态分布 高度偏态分布 偏态对众数、中位数和均值之间关系的影响...: 对称分布:均值=中位数=众数 左偏分布:均值<中位数<众数 右偏分布:众数<中位数<均值 例: >>> import pandas as pd >>> import numpy as np >>>...——人口密度(人/平方公里) 说明现象的强度、密度和普遍程度 某总量指标/另一性质不同但关联的总量指标 计划完成程度相对数 将某一时期实际完成数与计划完成数进行对比 说明计划的完成程度 动态相对数 将同一现象在不同时期的指标数值进行对比...易受极端值的影响,但受极端值的影响比算术平均数和调和平均数要小, 适用于对比率数据的平均, 主要用于计算平均增长率, 看作是均值的一种变形, 有一项为0就无法计算H 简单几何平均: 加权几何平均数:
平均数:数据的中心。 中位数:数据从小到大排列,中间一个或中间两个数的平均值。 众数:次数出现最多的数。 全距:最大值与最小值的差。仅描述数据的宽度,并没有描述数据上界和下届间数据的分布。...箱线图:显示数据的全距(上边缘,下边缘),四分位距以及中位数。如图(此图来自internet), ?...几何分布:进行一系列相互独立的实验;每次实验的成功的概率相同;目的是求取得第一次实验成功需要进行多少次实验。...泊松分布:单独事件在给定区间内随机独立的发生;一直该区间内的事件平均发生次数且为有限值。 正态分布(高斯分布):曲线对称,中央部位的概率密度最大,均值和中位数和众数均位于中央。...三,总体和样本的估计 样本均值称作总体均值的点估计量,样本均值给出了总体均值很好的估计。 不再使用样品方差估计总体方差,样本方差小于总体方差,所以用下面这个公式: ?
数据分布图简介 绘制基本直方图 基于分组的直方图 绘制密度曲线 绘制基本箱线图 往箱线图添加槽口和均值 绘制2D等高线 绘制2D密度图 数据分布图简介 中医上讲看病四诊法为:望闻问切。...密度曲线表达的意思和直方图很相似,因此密度曲线的绘制方法和直方图也几乎是相同的。区别仅在于密度曲线的横轴要绑定到连续型变量,另外绘制函数的名字不同。R语言示例代码如下: ? 运行结果: ?...R语言示例代码如下: ? 运行结果: ? 往箱线图添加槽口和均值 在上一节绘制的基本箱线图之上,还能进一步绘制以展示更多信息。 其中最常见的是为箱子添加槽口,它能更清晰的表示中位数的位置。...R语言实现代码如下: ? 运行结果: ? 通过stat_summary()函数,还可以在箱线图中标记均值点。R语言实现代码如下: ? 运行结果: ? 绘制2D等高线 本例选用如下测试集: ?...等高线图也是密度图的一种,因此绘制密度图和等高线图用的是同一个函数:stat_density(),只是它们传入的参数不同。首先绘制经典栅格密度图,R语言实现代码如下: ? 运行结果: ?
,可以是区间标度或者比例标度 离散属性与连续属性 这个...好理解 数据的基本统计描述 中心趋势度量:均值(有结尾均值,即抛弃少数极端数值)、中位数、众数(分单峰、双峰..)...也可以往盒图里面加入平均值(mean)。如图。下四分位数、中位数、上四分位数组成一个“带有隔间的盒子”。上四分位数到最大值之间建立一条延伸线,这个延伸线成为“胡须(whisker)”。...图片.png 切尔诺夫脸和人物线条画 层次可视化技术 把维度划分成子集,将子集层次可视化 ?...图片.png 使得当对象i和j匹配时,d(i,j)=0;当对象不同时,d(i,j)=1。于是,我们得到 ?...属性的总数是p,其中p=q+r+s+t。 ? 图片.png 对于对称的相异性,每个状态同等重要,则i和j的相异性为: ?
图中的下四分位数指的是数据的25%分位点所对应的值(Q1);中位数即为数据的50%分位点所对应的值(Q2);上四分位数则为数据的75%分位点所对应的值(Q3);上须的计算公式为Q3+1.5(Q3-Q1)...(r'C:\Users\Administrator\Desktop\sunspots.csv') # 绘制箱线图(1.5倍的四分位差,如需绘制3倍的四分位差,只需调整whis参数) plt.boxplot...同理,如果数据点落在偏离均值正负3倍标准差之外的概率将会更小,可以认为这些数据点为极端异常点。为使读者直观地理解文中提到的概率值,可以查看标准正态分布的概率密度图,如下图所示: ?...设置折线类型 linewidth = 2, # 设置线条宽度 color = 'steelblue', # 设置折线颜色 marker = 'o', # 往折线图中添加圆点...结语 本期的内容就介绍到这里,下一期将分享如何基于模型完成异常值的识别,如果你有任何问题,欢迎在公众号的留言区域表达你的疑问。同时,也欢迎各位朋友继续转发与分享文中的内容,让更多的人学习和进步。
R内嵌了很多常用的统计分布,提供了四类函数:概率密度函数(density),累积分布函数(probability)、分位数(quantile)和伪随机数(random)。...在R中分别用d,p,q,r表示这4个项目,后面接分布的英文名称或缩写。 ? 5.2集中趋势的分析 5.2.1集中趋势的测度 描述统计分布集中趋势的指标主要是平均数、中位数、众数,也称为“平均指标”。...这些指标的主要作用包括: 反映总体各单位变量分布的集中趋势和一般水平; 便于比较同类现象在不同单位之间的水平; 便于比较同类现象在不同时期的发展变化趋势或规律; 用于分析现象之问的依存关系。...5.2.2 R语言实现 函数summary()可以计算出一组数据的五数和均值。...(cars$speed) >q[4]-q[2] [1]7 R中的方差函数和标准差函数分别是var()和sd()R还有一个比较特殊的函数,即离差mad(),它用于计算中位数绝对偏差,具有渐近正态的一致性。
一、简介 上一篇中我们介绍了ggplot2的基本语法规则,为了生成各种复杂的叠加图层,需要了解ggplot2中一些基本的几何图形的构造规则,本文便就常见的基础几何图形进行说明; 二、各基础图形 2.1...abline()、hline()与vline() 在R的基础绘图系统中我们可以在已绘制的图床上通过abline来添加线条,在ggplot2中当然也有类似的方法: geom_abline(): ...x轴,则可以使用geom_vline()来快捷地添加垂直线条,xintercept传入的参数即为线条在x轴上的位置,若传入向量则可同时添加多条线条: library(ggplot2) p <- ggplot...,我们先从一维的说起: geom_density(): 和R基本绘图系统中的密度曲线绘制方法很接近: library(ggplot2) data <- data.frame(matrix(rnorm...(aes(label = text), vjust = "inward", hjust = "inward") 2.10 violin() 小提琴图是一种功能和箱线图类似,但增加了核密度估计功能的图形
绘制基本箱型图 6.7 向箱型图添加槽口 6.8 向箱型图中添加均值 6.9 绘制小提琴图 6.10 绘制点图 6.11 基于分组数据绘制多个点图 6.12 绘制二维数据的密度图 第五章 散点图...,密度曲线和箱型图之间的关系。...Q:如何向箱线图添加槽口notch以判断各组数据的中位数是否存在差异?...#这是因为置信域即槽口的上边界超过了箱体,但是没有什么毛病图还是可以用的惹 6.8 向箱型图中添加均值 Q:如何向箱型图添加均值?...fun = "mean", geom = "point", shape = 23, size = 3, fill = "white") #设置size=3让点大一点并且填充白色 *对于正态分布数据,均值和中位数几乎一样
密度曲线表达的意思和直方图很相似,因此密度曲线的绘制方法和直方图也几乎是相同的。区别仅在于密度曲线的横轴要绑定到连续型变量,另外绘制函数的名字不同。R语言示例代码如下: ? 运行结果: ?...R语言示例代码如下: ? 运行结果: ? 06 往箱线图添加槽口和均值 在上一节绘制的基本箱线图之上,还能进一步绘制以展示更多信息。其中最常见的是为箱子添加槽口,它能更清晰的表示中位数的位置。...R语言实现代码如下: ? 运行结果: ? 通过stat_summary()函数,还可以在箱线图中标记均值点。R语言实现代码如下: ? 运行结果: ? 07 绘制2D等高线 本例选用如下测试集: ?...也可以通过设置密度函数美学特征集中的colour参数来给不同密度的等高线着色,R语言实现代码如下: ? 运行结果: ? 8.绘制2D密度图 本例选用如下测试集: ?...等高线图也是密度图的一种,因此绘制密度图和等高线图用的是同一个函数:stat_density(),只是它们传入的参数不同。首先绘制经典栅格密度图,R语言实现代码如下: ? 运行结果: ?
密度曲线表达的意思和直方图很相似,因此密度曲线的绘制方法和直方图也几乎是相同的。区别仅在于密度曲线的横轴要绑定到连续型变量,另外绘制函数的名字不同。R语言示例代码如下: ? 运行结果: ?...R语言示例代码如下: ? 运行结果: ? 06 往箱线图添加槽口和均值 在上一节绘制的基本箱线图之上,还能进一步绘制以展示更多信息。 其中最常见的是为箱子添加槽口,它能更清晰的表示中位数的位置。...R语言实现代码如下: ? 运行结果: ? 通过stat_summary()函数,还可以在箱线图中标记均值点。R语言实现代码如下: ? 运行结果: ? 07 绘制2D等高线 本例选用如下测试集: ?...也可以通过设置密度函数美学特征集中的colour参数来给不同密度的等高线着色,R语言实现代码如下: ? 运行结果: ? 08 绘制2D密度图 本例选用如下测试集: ?...等高线图也是密度图的一种,因此绘制密度图和等高线图用的是同一个函数:stat_density(),只是它们传入的参数不同。首先绘制经典栅格密度图,R语言实现代码如下: ? 运行结果: ?
,log()为自然对数、log10()为常用对数、 exp(x) 指数函数 统计函数 函数 描述 mean(x) 平均数 median(x) 中位数 sd(x) 标准差 var(x) 方差 mad(x...要对每一列进行任意均值和标准差的标准化,可以使用如下的代码: newdata <- scale(mydata)*SD +M 其中,M是想要的均值,SD为想要的标准差。...标准化为均值50、标准差为10的变量。...概率函数 在R中,概率函数形如:[dpqr] distribution_abbreviation() 其中第一个字母表示其所指分布的某一方面 d = 密度函数 p = 分布函数 q = 分位数函数 r...geom 均匀分布 unif 超几何分布 hyper Weibull分布 weibull 对数正态分布 lnom Wilcoxon秩和分布 wilcox 举一个正态分布的例子: 在区间[-3, 3]
range 条柱的下限和上限范围。下限和上限异常值将被忽略。 density 为True时,绘制并返回条柱密度。...meanline 是否用线的形式表示均值,默认用点来表示。 showmeans 是否显示均值,默认不显示。 showcaps 是否显示箱线图顶端和末端的两条线,默认显示。...labels 为箱线图添加标签,类似于图例的作用。 flierprops 设置异常值的属性,如异常点的形状、大小、填充色等。 medianprops 设置中位数的属性,如线的类型、粗细等。...meanprops 设置均值的属性,如点的大小、颜色等。 capprops 设置箱线图顶端和末端线条的属性,如颜色、粗细等。 whiskerprops 设置须的属性,如颜色、粗细、线的类型等。...mincnt 表示六边形能够显示的最小值。 marginals 用于沿x轴底部和y轴左侧绘制颜色映射为矩形的边际密度。 extent 表示六边形值的极限。
密度曲线表达的意思和直方图很相似,因此密度曲线的绘制方法和直方图也几乎是相同的。区别仅在于密度曲线的横轴要绑定到连续型变量,另外绘制函数的名字不同。R语言示例代码如下: ? 运行结果: ?...R语言示例代码如下: ? 运行结果: ? 6.往箱线图添加槽口和均值 在上一节绘制的基本箱线图之上,还能进一步绘制以展示更多信息。 其中最常见的是为箱子添加槽口,它能更清晰的表示中位数的位置。...R语言实现代码如下: ? 运行结果: ? 通过stat_summary()函数,还可以在箱线图中标记均值点。R语言实现代码如下: ? 运行结果: ? 7.绘制2D等高线 本例选用如下测试集: ?...也可以通过设置密度函数美学特征集中的colour参数来给不同密度的等高线着色,R语言实现代码如下: ? 运行结果: ? 8.绘制2D密度图 本例选用如下测试集: ?...等高线图也是密度图的一种,因此绘制密度图和等高线图用的是同一个函数:stat_density(),只是它们传入的参数不同。首先绘制经典栅格密度图,R语言实现代码如下: ? 运行结果: ?
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