以下部分是基于《Fundamentals of Data Visualization》学习笔记,要是有兴趣的话,可以直接看原版书籍:https://serialmentor.com/dataviz/
作者:Matteo Courthoud 翻译:陈超校对:赵茹萱本文约7700字,建议阅读15分钟本文从可视化绘图视角和统计检验的方法两种角度介绍了比较两个或多个数据分布形态的方法。 从可视化到统计检验全方位分布形态比较指南: 图片来自作者 比较同一变量在不同组别之间的经验分布是数据科学当中的常见问题,尤其在因果推断中,我们经常在需要评估随机化质量时遇到上述问题。 我们想评估某一政策的效果(或者用户体验功能,广告宣传,药物,……),因果推断当中的金标准就是随机对照试验,也叫作A/B测试。在实际情况下,我们会
数据处理是日常科研工作中很重要的一部分,这里就会涉及到统计学知识。但说真的,统计是一个难倒了很多人的学科,科研本身就是个被动掉头发的事情,遇到了统计之后,很多人都会为此主动薅掉无数根头发,平日里大家总是觉得现在有那么多方便快捷的数据软件,直接分析就好了,但是这种投机取巧的想法,并不是长久之计,而且不学习统计学,你可能分析方法用错了,都不知道。笔者最近也是在整理实验数据,所以,给大家整理了一些统计学的基本知识以及统计学在Graphpad prism里的应用,希望可以集思广益,帮到大家。
描述性统计分析(Description Statistics)是通过图表或数学方法,对数据资料进行整理、分析,并对数据的分布状态、数字特征和随机变量之间的关系进行估计和描述的方法。描述性统计分析分为集中趋势分析和离中趋势分析。
1. ggplot2的安装:install.packages("ggplot2")。
何为EDA,何谓探索性数据分析?英文名为Exploratory Data Analysis,是在你拿到数据集后,并不能预知能从数据集中找到什么,但又需要了解数据的基本情况,为了后续更好地预处理数据、特征工程乃至模型建立。因此探索性数据分析,对了解数据集、了解变量之间对相互关系以及变量与预测值之间的关系尤其重要。
相关术语熟悉 首先认识数据的属性 属性是一个数据字段,表示数据对象的一个特征 标称属性 标称属性的值是一些符号或事物的名称,这一些值可以看做是枚举的 比如,职业,具有教师、农民、程序员等等 二元属性 二元属性是一种标称属性,只有两个类别或状态:0或1,0代表该属性不出现,1代表出现,二元属性也叫作布尔属性 二元属性有对称或者非对称一说 序数属性 值之间可能有有意义的序或者秩评定 数值属性 它是可度量的值,可以是区间标度或者比例标度 离散属性与连续属性 这个...好理解 数据的基本统计描述 中心趋势度量:
全距:最大值与最小值的差。仅描述数据的宽度,并没有描述数据上界和下届间数据的分布。
总第56篇 很多时候我们走的走的就会忘记当初为什么而出发。 我们有的时候在拿到数据以后不知道该怎么进行分析,该去分析什么,其实这些在我们以前的统计学中都学过。 不管是用Python还是R,其实和用Excel一样,只不过现在之所以用Python、R是因为大数据时代么,数据太多,Excel的处理能力跟不上,但是这些都只是一个工具而已,核心还是围绕统计学不变的。 今天就来聊聊我们该从哪些方向去分析(描述)数据。 01|总规模度量: 总量指标又称统计绝对数,是反映某一数据的整体规模大小,总量多少的指标。他是对原
计算有限个数的数据的中位数的方法是:把所有的同类数据按照大小的顺序排列。 如果数据的个数是奇数,则中间那个数据就是这群数据的中位数;如果数据的个数是偶数,则中间那2个数据的算术平均值就是这群数据的中位数。
在《Python数据清洗--类型转换和冗余数据删除》和《Python数据清洗--缺失值识别与处理》文中已经讲解了有关数据中重复观测和缺失值的识别与处理,在本节中将分享异常值的判断和处理方法。
分布是描述一个样本数据最核心、最重要的方式。R内嵌了很多常用的统计分布,提供了四类函数:概率密度函数(density),累积分布函数(probability)、分位数(quantile)和伪随机数(random)。在R中分别用d,p,q,r表示这4个项目,后面接分布的英文名称或缩写。
中位数(又称中值,英语:Median),统计学中的专有名词,代表一个样本、种群或概率分布中的一个数值,其可将数值集合划分为相等的上下两部分。对于有限的数集,可以通过把所有观察值高低排序后找出正中间的一个作为中位数。如果观察值有偶数个,则中位数不唯一,通常取最中间的两个数值的平均数作为中位数。
数据分布图简介 绘制基本直方图 基于分组的直方图 绘制密度曲线 绘制基本箱线图 往箱线图添加槽口和均值 绘制2D等高线 绘制2D密度图 数据分布图简介 中医上讲看病四诊法为:望闻问切。而数据分析师分析数据的过程也有点相似,我们需要望:看看数据长什么样;闻:仔细分析数据是否合理;问:针对前两步工作搜集到的问题与业务方交流;切:结合业务方反馈的结果和项目需求进行数据分析。 “望”的方法可以认为就是制作数据可视化图表的过程,而数据分布图无疑是非常能反映数据特征(用户症状)的。R语言提供了多种图表对数据分布进行描述
注意:默认情况下,函数scale()对矩阵或数据框的指定列进行均值为0、标准差为1的标准化。要对每一列进行任意均值和标准差的标准化,可以使用如下的代码:
对于有误差的统计值,我们一般都是采用均值作为使用值。但是这种使用均值代替的方式是不是合理?为什么不用中位数、几何平均数什么的?这需要一个解释。
mpl.rcParams['font.sans-serif'] = ['SimHei'] # 指定默认字体
这一章我们将会用到‘iris’(鸢尾花)数据集,这个数据集属于R中自带的数据,因此不需要额外的加载。首先,查看数据的维度和结构,使用函数dim()和names()可以分别得到数据的维度和数据的列表名称也就是变量名称。使用函数str()和函数attribute()可以查看数据的结构和属性。
中医上讲看病四诊法为:望闻问切。而数据分析师分析数据的过程也有点相似,我们需要望:看看数据长什么样;闻:仔细分析数据是否合理;问:针对前两步工作搜集到的问题与业务方交流;切:结合业务方反馈的结果和项目需求进行数据分析。
notch控制是否在图中显示中位数的置信区间,默认值为False, 当取值为True时,会计算中位数的置信区间,并在图中将置信区间与中位数相连,用法如下
对于基础概念就不在此赘述,挑当中的几个easy混淆的点和关键点说说
NGS系列文章包括NGS基础、高颜值在线绘图和分析、转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析 (重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘(典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step))、批次效应处理等内容。
中医上讲看病四诊法为:望闻问切。而数据分析师分析数据的过程也有点相似,我们需要望:看看数据长什么样;闻:仔细分析数据是否合理;问:针对前两步工作搜集到的问题与业务方交流;切:结合业务方反馈的结果和项目需求进行数据分析。
R 的基础绘图系统由 Ross Ihaka 编写,功能非常强大,主要由 graphics 包和 grDevices 包组成,它们在启动 R 时会自动加载。基础绘图系统中有两类函数,一类是高水平作图函数,另一类是低水平作图函数。
数据的集中趋势描 述是寻找反映事物特征的数据集合的代表值或中心值,这个代表值或中 心值可以很好地反映事物目前所处的位置和发展水平,通过对事物集中 趋势指标的多次测量和比较,还能够说明事物的发展和变化趋势。国家 的人均GDP就是一个集中趋势指标,虽然每个人对国家的GDP贡献度不 一样,但是人均GDP能够代表每个人对国家GDP的平均贡献度,从而反 映一个国家的经济发展水平。
统计学一般分统计描述及统计推断两部分。统计描述是通过图表或数学方法,对数据资料进行整理后描述数据的客观规律,而统计推断则是使用从总体中随机抽取的数据样本,用样本数据总结的规律去对总体的未知特征进行推断。本章主要学习统计推断常见的概念及相关基础内容。
摘要:脑电图(EEG)和脑磁图(MEG)记录是研究人类神经反应的宝贵工具,但它们存在噪音,并可能受到多种过程的影响。为了解决这一问题,一个有效的方法是使用特定频率的刺激,并测量响应相位的一致性。本文描述了一种测量相位一致性的贝叶斯方法,并使用神经语言学的示例和模拟数据进行了阐述。本研究建议,与传统的统计方法相比,贝叶斯方法更具描述性和可解释性,并且在检测与刺激相关的差异时对参与者数量要求更低。
道德经云:”道生一,一生二,二生三,三生万物“。学习知识亦是如此,一个概念衍生出两个概念,两个概念演化出更小的子概念,接着衍生出整个知识体系。
导读:要做好数据分析,除了自身技术硬以及数据思维灵活外,还得学会必备的统计学基础知识!因此,统计学是数据分析必须掌握的基础知识,即通过搜索、整理、分析、描述数据等手段,以达到推断所测对象的本质,甚至预测对象未来的一门综合性科学。统计学用到了大量的数学及其它学科的专业知识,其应用范围几乎覆盖了社会科学和自然科学的各个领域,而在数据量极大的互联网领域也不例外,因此扎实的统计学基础是一个优秀的数据人必备的技能。
✅作者简介:人工智能专业本科在读,喜欢计算机与编程,写博客记录自己的学习历程。 🍎个人主页:小嗷犬的博客 🍊个人信条:为天地立心,为生民立命,为往圣继绝学,为万世开太平。 🥭本文内容:Python Matplotlib库:统计图补充 ---- Python Matplotlib库:统计图补充 1.引言 2.直方图 3.箱线图 4.误差条图 5.小提琴图 6.尖峰栅格图 7.二维直方图/散点密度图 8.Hexbin散点图 9.扇形图 ---- 1.引言 上两期我们讲了 Matplotlib 库
网址:http://www.cnblogs.com/muchen/p/5430536.html
所谓机器学习和深度学习, 背后的逻辑都是数学, 所以数学基础在这个领域非常关键, 而统计学又是重中之重, 机器学习从某种意义上来说就是一种统计学习。
写科普文,写的简明扼要很难,写的妙趣横生也很难,其实难能可贵的读者耐心的阅读及友情转发。
考虑上算数平均数和几何平均数的数据项采用不同的权重,就是加权算数平均数和加权几何平均数。
figure.add_subplot:添加子图,可以指定子图的行数、列数和选中图片的编号。
在进行数据分析时,我们往往不会对原始的一条一条的数据直接进行分析,因为那毫无意义。通常,需要对数据先做一些聚合运算,比如求和、求平均值、计数等,也就是会用到一些分析指标和术语,这些指标和术语可以帮助我们打开思路,从多种角度对数据进行深度解读。
因为是随机的所以两组个体不会完全的相同(identical)。但是有时候,它们在总体表现时甚至不是“相似”的(similar)。例如,我们可能在一个群体中有更多的男性,或者年长的人,等等。(我们通常称这些特征为协变量或控制变量)。当这种情况发生时,就不能再确定结果的差异只是由于实验得来的。因此,随机化后,检查所有观察变量是否在组间平衡,是否没有系统差异是非常重要的。
比较一个变量在不同组中的分布是数据科学中的一个常见问题。当我们想要评估一项策略(用户体验功能、广告活动、药物等)的因果效应时,因果推断的黄金标准便是随机对照试验,也就是所谓的A /B测试。在实践中,我们为研究选择一个样本,并将其随机分为对照组(control group)和实验组(treatment group)比较两组之间的结果。随机化确保了两组之间的唯一差异,这样我们就可以将结果差异归因于实验效果。
首先,要做一件事情首先要搞清楚的是:为什么要这么做?随着年纪越来越大,越来越觉得时间珍贵,所以每一分钟都要用好。而参加这个兴趣小组的原因很简单,想进一步提升自己的能力!
本篇介绍随机变量和概率分布的基本概念,以及有关概率分布的一些简单统计量,它们构成了概率和统计的基础知识。
来源:DeepHub IMBA本文6400字,建议阅读12分钟我们看到了很多不同的方法来比较两个或多个分布,无论是在可视化上还是在统计上。 比较一个变量在不同组中的分布是数据科学中的一个常见问题。当我们想要评估一项策略(用户体验功能、广告活动、药物等)的因果效应时,因果推断的黄金标准便是随机对照试验,也就是所谓的A /B测试。在实践中,我们为研究选择一个样本,并将其随机分为对照组(control group)和实验组(treatment group)比较两组之间的结果。随机化确保了两组之间的唯一差异,这样我
单变量图(chart for one variable)是指使用数据组的一个变量进行相应图的绘制。想要可视化这个变量,就需要根据不同的数据变量类型绘制图。数据变量分为连续变量(continuous variable)和离散型变量(discrete variable)。
其中的x是一个由数据值组成的数值向量。参数freq=FALSE表示根据概率密度而不是频数绘制图形。参数breaks用于控制组的数量。在定义直方图中的单元时,默认将生成等距切分。
【小提琴图】其实是【箱线图】与【核密度图】的结合,【箱线图】展示了分位数的位置,【小提琴图】则展示了任意位置的密度,通过【小提琴图】可以知道哪些位置的密度较高。 小提琴图的内部是箱线图(有的图中位数会用白点表示,但归根结底都是箱线图的变化);外部包裹的就是核密度图,某区域图形面积越大,某个值附近分布的概率越大。 通过箱线图,可以查看有关数据的基本分布信息,例如中位数,平均值,四分位数,以及最大值和最小值,但不会显示数据在整个范围内的分布。如果数据的分布有多个峰值(也就是数据分布极其不均匀),那么箱线图就无法展现这一信息,这时候小提琴图的优势就展现出来了!
别说,还真有,而且常见的统计图形它都能绘制,更重要的是,统计指标信息自动添加,绘制的结果完全符合出版需求~~
聚类(cluster)与分类(class)问题不同,聚类是属于无监督学习模型,而分类属于有监督学习。聚类使用一些算法把样本分为N个群落,群落内部相似度较高,群落之间相似度较低。在机器学习中,通常采用“距离”来度量样本间的相似度,距离越小,相似度越高;距离越大,相似度越低.
箱线图,是指—种描述数据分布的统计图,是表述数据的第一四分位数、中位数、第三四分位数与异常值(离群值)的一种图形方法。它也可以粗略地看出数据是否具有对称性,分布的分散程度等信息,特别是可用于对多组样本的比较。
接下来示例中,我们绘制一项探索类风湿性关节炎新疗法研究的结果。数据已经包含在随vcd包分发的Arthritis数据框中。(请确保在使用前已经安装vcd包,使用命令install.packages("vcd"))
箱线图展示的就是分位数,中间的线表示的是中位数,也就是50%分位数,如果非要在箱线图上画上表示平均值的线段也是可以实现的,今天介绍一下实现代码
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