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R语言中定位分析

定位分系是寻找GWAS和*QTL多效性SNP分析方法。...另外跟在孟德尔随机分析之后,在MR后面做定位分析,其实最好结果是两个表型并不在遗传学上共享因果变异,这样才能更有利证明两个表型之间因果关系。...,H4值范围在0-1之间,0表示概率为0%,1表示概率为100%。后验概率越高越好。很多文献认为PPA > 0.95位点是共定位位点,也有一些文献会放松要求到0.75。...接下来我们看下在R中如何进行实现这个分析方法。首先是包安装: install.packages("coloc") 1....共定位分析 ####abf 算法 my.res <- coloc.abf(dataset1=D1, dataset2=D2) 数据结果中包含两个子结果,一个是summary,主要描述了SNPs数量,以及

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常见手机定位方式浅谈_夹具常见定位方式

示例如图2: 2 GPS卫星网络 为了解算测站三维坐标,必须观测4颗GPS卫星,称为定位星座。 1.1.2地面监控系统 对于导航定位来说,GPS卫星是一动态已知点。...所以如果想知道接收机所处位置,至少要能接收到4个卫星信号。如下图所示: 3 GPS位置计算方法 从以上四个方程中解出x,y,z和t就可以定时、定位。...网传微信三点定位原理也是这个样子。 6 三点定位原理 由于基站定位时,信号很容易受到干扰,所以先天就决定了它定位不准确性,精度大约在150米左右,基本无法开车导航。...当某些WiFi信息不在数据库中时,可以根据附近其他WiFi位置信息推断出未知WiFi位置信息,并上传服务器。 7 WiFi 定位 3.2数据采集 这些AP位置映射数据怎么采集呢?...8 AGPS定位 AGPS优势主要在其定位精度上。在室外等空旷地区,其精度在正常GPS工作环境下,可达10米左右,堪称目前定位精度最高一种定位技术。

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是Excel,不!是R

R作为可视化大势,自然也可以画出这些,有一篇就通过ggplot2包进行了部分总结,甚是有趣,小编复刻学习了一番,现对代码做简单注释,以作分享。...饼,将一般进行直角坐标轴到极坐标轴转换(coord_polar()) ggplot(df,aes(x=factor(1),a,fill=factor(var)))+ geom_bar...) # 点和线距是对象a数据有盘高盘低,条形是关于对象b,成交量 # facet_grid(item~....瀑布 瀑布可表现图形涨跌趋势,后一个柱子和前一个柱子有增长和下降关系。...漏斗 漏斗数据分布在图形中间,用coord_flip()转换方向,可以看到不同组最大,最小值差异 df_tmp4% select(1:3) %>% arrange(a) %

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RR传统图形绘制多

布局函数 layout() 上面的方法创建大小是相同,而 layout() 就要高级不少。...layout() 将图片内部区域分割为一组行和列,但行高和列宽度可以分别控制,并且每个子可以占据超过一行或一列位置。 layout() 用矩阵作为参数来表示上述思想,矩阵值就是子序号。...巧妙地设定矩阵,就可以自由实现多种组方式了。不过显然到这里,还感觉差一些东西:默认情况下,所有的行高和列宽尺寸都是相同, 而且内部也是以这种方式分割。怎么实现自定义行高或列宽?...这里 heights 设定是一个相对占比,比如子 1 占 5/(5+3)。同样操作可以应用到 widths上。...更多操作查看文档啦~ 这里其实只要知道 layout() 函数,以及通过矩阵设定子排列思想使用起来就简单。 更复杂操作就要学习 grid 了,可能未来某天我会学习并写写。

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R】蜜蜂beeswarm

蜜蜂或蜂群(beeswarm)这个名字,大家可能比较陌生,但是大家肯定都见过他尊容。下面这张就是一个典型蜜蜂。因为看上去像一群飞舞蜜蜂而得名。...从图中可以发现,beeswarm很好体现了数据分布,更加清楚、直观。而jitter和散点图,难以快速获取信息,point图中点过于密集,jitter中分布过于散乱。...这也是很多科学论文选择beeswarm原因,在小样本下也许jitter或者points方法也能够传达我们想要传递信息,但是在样本量较大时候,这两个绘图方法就不太适合了。...而beeswarm在大样本情况下也比较适用。不仅可以体现每一个样本具体情况,而且能够查看整体情况。...后面小编会详细给大家介绍beeswarm这个R使用,绘制更多不同类型蜜蜂

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Java服务异常排查定位

引言 研发工程师日常工作除了开发实现新需求之外,排查定位问题也是重要组成部分。...如果在发生线上故障时能够快速定位线上bug并且修复bug,不仅是研发工程师技术能力重要体现,同时也可以帮助线上及时止血避免平台故障进一步蔓延,从而导致影响用户体验或者产生不可挽回资损。...因此本文主要聚焦日常工作中经常遇到异常场景,梳理了问题排查定位思路大,这样大家在实际项目中如果遇到类似的异常场景,可以按照思路大进行问题排查定位解决,相信大家掌握了故障定位分析套路之后就可以做到遇到问题时临危不乱...Java服务异常 系统资源问题定位 系统资源问题定位核心是找到到底是哪个进程在异常占用系统资源,特别是在服务器中混部了多种服务时候,经常会遇到系统资源竞用情况。...同时结合实际经验提炼了各个异常情况下问题根因分析思路以及排查定位,大家在遇到类似问题时候可以参考大图中思路进行问题排查定位以及解决。 END

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R基础绘图篇 | 旭日与冰柱绘制

写在前面 旭日(sunbrust diagram),通常也被称为多层饼(multi-level pie chart)或径向树,通常会用来展示层级占比关系,通过一系列圆环展示层次结构。...冰柱(icicle diagram)也叫分区层(partition layer chart),也就是直角坐标系下旭日,他们都是展示层级占比关系王者。...开始绘图 需要调用R包有以下4个 library(ggraph) library(igraph) library(RColorBrewer) library(dplyr) 读取数据 #df<-read.csv...('旭日.csv',header=TRUE,stringsAsFactors=FALSE) df<-read.csv(file.choose( ),header=TRUE,stringsAsFactors...=FALSE) 旭日 分割角度均等平分 edges<- data.frame(rbind( cbind(rep('origin',4),unique(as.character(df$Season)))

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基于视觉语义信息定位综述

因此,有几篇论文采用了两级检测器进行物体检测,如R-CNN、Fast R-CNN、Faster R-CNN,与单阶段检测器不同,两阶段检测器需要获得区域建议,对结果进行分类并调整候选边界框位置,由于两级检测器设计思想...语义信息应用 语义信息和SLAM技术是相互促进两部分,语义信息与定位和建相结合可以提高定位和场景理解准确性,近年来,语义vSLAM技术推动了定位和地图发展,对自动驾驶、移动机器人和无人机等研究领域产生了重大影响...本节将重点讨论语义定位和语义建两个方面。...面对急剧视点变化,论文[72]采用语义描述符匹配进行全局定位,以实现多视点下定位。...B、 语义建是SLAM另一个目标,它服务于vSLAM中定位问题,通常,我们希望机器人保存地图,以便机器人在下一步工作中不需要重复构建地图,从而节省大量计算资源,在应用中,由vSLAM构造地图包括稀疏地图

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R可视乎|饼

(pie chart)被广泛地应用于各个领域,用于表示不同分类占比情况,通过弧度大小来对比各种分类。...饼通过将一个圆饼按照分类占比划分成多个切片,整个圆饼代表数据总量,每个切片(圆弧)表示该分类占总体比例,所有切片(圆弧)加和等于100%。 下面会介绍两种在R中实现饼方法。...这里做了两种类型标签,下面两就是根据不同标签绘制。labs包含了百分比和名字,中间用\n来分行;lab则只包含百分位数。...ggplot2 包绘制饼 使用R中ggplot2包geom_bar()函数绘制堆积柱形,然后将直角坐标系转换成极坐标系,就可以显示为饼,但还是需要使用geom_text()函数添加数据标签。...但是可以看到:由于缺乏饼与数据标签之间引导线,总感觉美观度不够,所以推荐使用graphics包pie()函数绘制饼。 代码以及资料存在我github上,可见文末原文链接。

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R可视乎|气泡

气泡 气泡是一种多变量图表,是散点图变体,也可以认为是散点图和百分比区域组合[1]。气泡最基本用法是使用三个值来确定每个数据序列,和散点图一样。...气泡通过气泡位置及面积大小,可分析数据之间相关性。 本文可以看作是《R语言数据可视化之美》[1]学习笔记。...前两部分可见(跳转): 趋势显示二维散点图 分布显示二维散点图 该书对气泡绘制并不是非常详细,小编将内容进行了大量拓展。下面的例子将一步步带你完成气泡绘制。...该基本可以满足我们日常生活气泡可视化了。相信大家通过前面的详细介绍,应该可以自行绘制,只要换个数据,懂得各个代码含义即可。...如果不喜欢圆形气泡,可以将代码中shape=21进行更改,正方形是shape=22,得到如下: ?

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R可视乎|瀑布

R中plot3D包polygon3D()函数和segments3D()函数可以绘制三维面积,lines3D()函数可以绘制三维曲线图,所以,综合这几个函数可以绘制三维瀑布,该代码,数据来源R语言书可视化之美...在此,就完成这个三维瀑布了,美观度极佳,可解释性也不错。 添加第四个变量 如果想加入第四变量也是没问题,具体不再重复。完整代码可见R语言书可视化之美或者我github中。 ?...行分面的带填充曲线图 使用分面可视化方法也可以展示瀑布数据信息,关于分面可视化方法我已经在R可视乎|分面一页多介绍过。...当然峰峦也可以很好地展示瀑布数据信息,具体将在下一次可视化推送中进行介绍。 以上对绘制瀑布(这里指和网上说瀑布还不一样)进行了详细介绍了。...本篇视为《R语言数据可视化之美》学习笔记,并进行函数详细介绍与解释,版权归原作者所有。其他可视化可在菜单命令[可视化]中搜索得到。

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R EnhancedVolcano 绘制火山

火山是用于差异表达分析结果可视化一种有效方法。...今天,我们来介绍一个用于增强火山绘制强大 R 包:EnhancedVolcano ,该包拥有强大绘图功能,用户可以简单通过设置颜色、形状、大小和阴影等参数定义不同绘图属性,此外通过可以通过添加连线方式有效避免数据点之间重叠现象...使用 EnhancedVocalno 包绘制火山基本可以直接用于文献发表,可以说非常简单又实用一款神器了。 1. 下载与安装 R 版本:3.6.1。...legendVisible = FALSE 可以不展示注 3.6 校正后 p 值作图 EnhancedVolcano(res, lab = rownames(res), x = 'log2...EnhancedVolcano 包绘制火山就先介绍到这里。

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R语言绘制Circos

Circos加拿大生物信息科学家 Martin Krzywinski 开发,最初主要用于基因组序列相关数据可视化。现在越来越多领域把Circos引入其中。...今天我们介绍在R语言中如何绘制Circos。 首先我们看下Circos官网(http://circos.ca/),其实他们提供了自己绘制工具包,为了更加方便绘制Circos。...我们利用了R语言中circlizeR包进行Circos绘制。 ? 1. Install.packages(“circlize”)#安装R包。 2. R载入之后状态 ? 3....我们看下R包中可以实现功能函数列表。...circos.genomicInitialize 基因染色体分布图形绘制不带条 circos.genomicHeatmap 绘制热 circos.genomicDensity 基因密度绘制 circos.genomicLabels

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综述 | 基于特征视觉同步定位和建

摘要 视觉同步定位和建(SLAM)在过去几年中引起了高度关注。...关键词 机器人·SLAM·定位·传感器·因子·语义 1 引言 经过几十年详尽研究和深入调查,同步定位和建 (SLAM) 持续在机器人社区进行研究中占据主导地位。...在我们综述中,我们根据用于执行定位和建特征对最先进基于特征视觉 SLAM 解决方案进行分类。在每个类别中,都对所采用 SLAM 实现进行了彻底讨论和比较。...定位和建也可以由多个机器人车辆以分布式方式完成,同时利用 [134] 中提出并行性,其中跟踪和图像采集是轻量级过程,在所有 MAV 上并行运行,由于其计算需求,建时由功能强大计算机在机外完成。... 8 总结了可用于加速定位和建过程并实时完成估计技术。 3.1.3 解决尺度不确定性 当使用单目相机时,SLAM 系统需要处理固有的尺度不确定性挑战,这是由于难以从单帧中辨别深度而导致

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