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    组装结果纠错

    一、组装结果优化原理 1.1为什么需要对组装结果进行矫正(polishing)? 由于三代 nanopore 测序质量比较低,原始数据中存在大量测序错误,即使拼接前进行了纠错,组装结果中仍会存在错误,用长读长或短读长的数据对组装结果进行矫正可以,提高准确率,减少 Miscalls,Indels 即使组装工具带有纠错功能,仍建议再次进行一轮或多轮的矫正。 1.2为什么需要对组装结果进行多轮矫正(polishing)? 二、 medaka 组装结果纠错 Medaka 是一个基于叠加序列的一致性序列修正工具,高度推荐使用以获得最佳的一致性准确性。 四、racon 组装结果纠错 Racon 是一个基于 minimap 和 miniasm 的,构建一致性序列(consensus)的一款软件,也可以用于纠错。

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