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(5392)
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沙龙
1
回答
导入:无法打开X服务器‘’@ error/import.c/ImportImageCommand/361
、
我正在尝试运行python脚本来生成热
图
和聚类
树状
图
。但我收到一条错误信息说:我是
linux
和python
的
新手我
的
操作系统是
linux
fedora。 谢谢。
浏览 0
提问于2015-11-04
得票数 2
1
回答
如何在R中手动创建heatmap.2
的
树状
图
矩阵?
、
以下是由gplots::heatmap.2创建
的
我
的
热图示例heatmap.2(cor,Rowv=F,Colv=F,dendrogram="none",trace="none",col=bluered)#fig2 我想在fig2中创建一个
树状
图
,其中X和Y被手动分组在一起,这样我就可以与fig1比较相关
图</e
浏览 8
提问于2014-02-19
得票数 0
1
回答
R和Matlab结构
、
、
、
我对R知之甚少,但我需要将matlab中
的
层次聚类所产生
的
树状
图
转换为R
树状
图
结构。下表显示了matlab函数中分层聚类产生
的
树状
图
;其中第一列和第二列是对象或分支
的
is,第三列是距离。 有没有办法把这个表(或matlab
的
树状
图
)映射成R
树状
图
?
浏览 1
提问于2016-01-18
得票数 0
回答已采纳
1
回答
来自Factorminer Hclust对象不在Pheatmap中聚类
树状
图
、
、
交叉发布:https://www.biostars.org/p/450365/ 我正在尝试使用pheatmap::pheatmap创建一个20行10列
的
矩阵热
图
。为了聚类列,我使用了一个在输入矩阵上运行FactoMineR::HCPC后获得
的
hclust对象。但是,当我使用hclust对象时, 这是我
的
代码: library(tidyverse)library(FactoMineR)
浏览 35
提问于2020-07-19
得票数 1
回答已采纳
1
回答
如何在GUI中绘制DENDROGRAM
、
、
、
、
我正在使用QtDesigner
的
图形用户界面来绘制
树状
图
。我
的
代码如下,但我不能绘制
树状
图
,我如何修复它?
树状
图
图像:
浏览 48
提问于2021-02-27
得票数 0
回答已采纳
2
回答
R中
的
决斗
树状
图
(在r中将
树状
图
背靠背放置)
、
、
、
、
有没有什么相当直接
的
方法可以把两个
树状
图
“背靠背”放在r中?这两个
树状
图
包含相同
的
对象,但聚类方式略有不同。我需要强调
树状
图
的
不同之处。因此,类似于包所做
的
事情,但可能涉及较少,以土壤科学为导向?如果能够对
树状
图
进行线条划分,以最大化对象之间
的
直线数量(见上文),这将突出
树状
图
之间
的
任何差异,这将是
浏览 1
提问于2012-09-17
得票数 9
1
回答
从海上簇图中提取
树状
图
、
、
、
给出了以下示例,它来自:df = df.set_index('model')df sns.clustermap(df) 问:如何才能得到非图形形式
的
树状
图
背景信息:从
树状
图
的
根开始,我想以最大
的
长度切割它。例如,我们有一条从根到左簇(L)
的
边,一条到右簇(R)
的</e
浏览 0
提问于2018-10-21
得票数 4
回答已采纳
2
回答
在python中将层次聚类
的
结果绘制在数据矩阵
的
顶部
、
、
、
、
在Python中,如何将
树状
图
绘制在值矩阵
的
顶部,并适当地重新排序以反映聚类?下面是一个示例: 我使用scipy.cluster.dendrogram制作
树状
图
,并对数据矩阵执行分层聚类。那么,我如何将数据绘制为矩阵,其中行已被重新排序,以反映在特定阈值下切割
树状
图
所导致
的
聚类,并使
树状
图
与矩阵一起绘制?我知道如何在scipy中绘制
树状
图
,但不知道如何绘制数据
的
浏览 5
提问于2010-06-06
得票数 51
回答已采纳
3
回答
如何抑制海图中
的
树状
图
而仍聚在一起?
、
我想要绘制一个由行和列组成
的
海运集群地图。我不想画
树状
图
。提供了将
树状
图线
的
宽度设置为0
的
方法。此黑客在海运0.7.1中不起作用。
浏览 7
提问于2017-02-23
得票数 27
回答已采纳
2
回答
如何使用R中
的
"factoextra“包中
的
fviz_dend函数更改
树状
图
的
标签?
、
、
、
我正在创建一个闪亮
的
应用程序,它以谷类数据集为例展示了不同
的
聚类技术,例如分层聚类和k-means聚类。我使用"factoextra“包中
的
fviz_dend函数来创建我
的
树状
图
。然而,当我这样做时,
树状
图
不会将谷物
的
名称显示为标签,而是显示数字表示。有没有办法把数值改成标签?我在下面附加了一张使用fviz_dend函数的当前
树状
图
的
图片和一张我使用base R中
浏览 709
提问于2019-10-16
得票数 0
1
回答
更新TreeMap中
的
对象(Java)
、
、
、
我有一个人
的
树状
图
,这个
树状
图
与一个名字和一个person对象相关。那个person对象有另一个包含更多数据
的
树状
图
。我正在尝试读取不统一
的
数据,并用下面的代码更新
树状
图
: course getCourse = courses.get(tempCourseupdate.scores.put(tempCalendar, t
浏览 4
提问于2014-01-28
得票数 2
1
回答
R中按组
的
树状
图
的
颜色分支(不含h或k元素)
、
、
我想根据数据帧中定义
的
特定组对
树状
图
的
分支进行着色。编辑:当我这样做
的
时候,它可以工作colori = rep(NA, length=length(iris$Species))pca_iris<- pca_iris + theme(legend.position = "upper.right"
浏览 5
提问于2020-05-20
得票数 1
1
回答
使用aheatmap/heatmap2 2时,在R中显示
树状
图
的
比例
、
、
在调用NMF包aheatmap或heatmap.2时,如何使R绘制
树状
图标度(以便解释每个
树状
图
的
高度)和热
图
?这些
树状
图
显示了规模:,这是执行plot(hclust(...))
的
默认行为,我想仿真一下,但不确定如何通过heatmap函数来实现。
浏览 0
提问于2014-03-17
得票数 1
回答已采纳
1
回答
recluster.cons函数与彩色
树状
图
、
、
我使用recluster包
的
'recluster.cons‘函数创建了一个
树状
图
。我想知道如何对此函数产生
的
树状
图
的
分支按组进行着色。recluster.cons(sp2, p=1)$cons # sp2 is a presence-absence matrix这是当前
的
树状
图
浏览 19
提问于2020-02-11
得票数 0
回答已采纳
1
回答
在dendextend中将节点标签添加到
树状
图中
、
我有一个带有叶和节点标签
的
树状
图
(class=phylo,使用read.tree读取)。在将其转换为
树状
图
类之后,节点标签不再存在。然而,我想通过在一些节点
的
顶部显示标签来绘制
树状
图
(即在所选集群
的
顶部以NODE_1等形式显示)。
浏览 2
提问于2017-10-20
得票数 2
1
回答
在SELinux中读取文件
的
扩展属性
、
、
我想在
linux
中读取一个文件
的
功能。 我想用完整
的
细节来回答这样
的
问题。
浏览 8
提问于2014-04-17
得票数 1
1
回答
仅将clusters绘制到被切割
的
集群,而不是每一片叶子
、
、
我有一个包含近2000个样本
的
hclust树。我已经将其切割成适当数量
的
集群,并希望绘制
树状
图
,但在我切割集群
的
高度结束,而不是一直到每个单独
的
叶子。每个绘图指南都是关于通过群集或绘制方框来给所有树叶着色,但似乎没有任何东西只是完全离开了切割线下
的
树叶。我
的
完整
树状
图
如下所示:我想把它画出来,就好像它停在我在这里画
的
那条线一样(例如):
浏览 12
提问于2017-08-03
得票数 2
回答已采纳
1
回答
从热图中提取
树状
图
时
的
错误
、
、
、
我试图从二进制矩阵中使用heatmap.2函数创建一个热
图
,并从热图中提取
树状
图
,并将
树状
图
保存为newick文件格式。矩阵在列上有基因组,在列上有基因。当我尝试运行它时,这段代码工作得很好,这将是完整
的
概要文件但是,当我减少基因列
的
数量时,在尝
浏览 4
提问于2016-04-07
得票数 3
1
回答
ape包-打印生成树
、
、
我使用R中
的
ape包来生成系统发育树。我想打印出生成
的
树以png格式,以便我可以管道
的
图像到一个网站。我似乎找不到打印生成树
的
命令(如果可能的话)。如有一些建议/见解,将不胜感激。
浏览 1
提问于2018-04-09
得票数 0
回答已采纳
2
回答
mprotect()是如何工作
的
?
、
我对
linux
内核中
的
一些
常用命令
进行了分析,看到很多次都使用了mprotect()。我想知道
的
是,什么是决定因素,用来找出它正在设置保护值
的
内存地址是否在它自己
的
地址空间中?
浏览 2
提问于2010-09-30
得票数 3
回答已采纳
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