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沙龙
1
回答
pheatmap
annotation_colors
未
使用
指定
的
调色板
r
、
colors
、
pheatmap
我
使用
here中
的
脚本制作了一个热图,其中包含用于注释行
的
颜色。V10])colnames(anno) <- "Annotation"
pheatmap
mycolors中
指定
的
颜色。它们似乎只是默认选项,无论我是否包含
annotation_colors
= mycolors[1],都不会对绘图上
的</e
浏览 173
提问于2020-04-28
得票数 0
1
回答
pheatmap
:更改注释颜色并防止图形窗口弹出
r
、
colors
、
heatmap
、
pheatmap
在上,我找到了
pheatmap
函数(它为我想做
的
事情提供了比heatmap.2更多
的
控制)。我不能更改注释(类别)
的
颜色。这是我
的
MWE:library(RColorBrewer) filena
浏览 2
提问于2017-01-13
得票数 10
1
回答
彩色地图中
的
彩色标度
r
、
colors
、
pheatmap
我给出了一类相关矩阵
的
热图。我想修复颜色缩放,特别是针对infection_status。其选择
的
粉红色色调不仅与感染斑相似,而且看起来与hpi相似。 clustering_distance_cols = "euclidean", cluster_rows = TRUE, annotation = dge_cp
浏览 1
提问于2021-03-27
得票数 0
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3
回答
Pheatmap
注释颜色和边框
r
、
pheatmap
Pheatmap
library(
pheatmap
)
使用
annotation_colors
在每个热图列
的
顶部添加标题ID颜色。set.seed(123)colnames(df)<-LETTERSrep(c("Pat",&q
浏览 1
提问于2015-10-23
得票数 15
回答已采纳
1
回答
pheatmap
()条件分组中
的
小故障,以及其他混淆点
r
、
pheatmap
c("black", "orange")ann_colors = list(condition = condition)
pheatmap
(mat, annotation = annotation, color = colorRampPalettebrewer.pal(n =
浏览 150
提问于2020-04-03
得票数 0
1
回答
Pheatmap
-注释:下标越界错误
r
、
pheatmap
Test RData:注释:
pheatmap
(t(pred.MDSC), fontsize=8)但是,如果我随后尝试向其添加注释(
使用
文件中
的
annoDF ):它返回错误: Error in
annotation_colors
[[colna
浏览 4
提问于2020-02-11
得票数 0
1
回答
pheatmap
中缺少批注和颜色
r
、
pheatmap
使用
pheatmap
R包,我需要制作一个带有自定义颜色集注释
的
热图。我
使用
以下代码:mat<-replicate(23, rnorm(23)) 这会生成一个热图,其
浏览 33
提问于2019-11-14
得票数 2
回答已采纳
2
回答
在R中
使用
pheatmap
自动分类和添加注释
r
、
annotations
、
heatmap
、
categorization
、
pheatmap
我有一个由一些不同科目的学生
的
成绩所做
的
数据。学生
的
特点也是他们
的
性别(F或M),这是作为后缀在他们
的
名字(如Anne_F,Albert_M等.)
使用
这些数据,我已经用这种方式创建了一个具有
pheatmap
()包
的
heatmap: Carl_M <- c(6,7,9,5,7) Albert_M <- c(8,8,8,7,
浏览 7
提问于2022-02-06
得票数 0
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1
回答
如何将键值和图例放在热图
的
底部
r
、
pheatmap
有人告诉我如何
使用
pheatmap
将表达式键索引和图例键显示在热图
的
底部吗?您可以
使用
以下代码来生成热图。非常感谢!"#fdbb84",D = "#e34a33", E = "red"),
pheatmap
(test, an
浏览 24
提问于2020-09-18
得票数 1
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1
回答
是否可以根据kmeans结果
的
注释而不是聚类结果对其进行着色?
r
、
annotations
、
cluster-analysis
在层次聚类中,我可以
使用
以下命令来实现:
pheatmap
(data,annotation_col=metadata,annotation_row=metadata,
annotation_colors
=我试过fviz_cluster,但我找不到如何根据每个点
的
注释而不是根据它
的
簇来给每个点着色。
浏览 17
提问于2021-02-04
得票数 0
1
回答
如何在这张热图中改变颜色?
r
、
ggplot2
、
pheatmap
我用
Pheatmap
创建了一个热图。我
的
度量是二进制
的
,我希望注释行颜色(5类)与数据点相同。目前,我有五个类别的一个颜色。我已经附上了我
的
代码生成
的
图表。我不知道该怎么做。提前感谢! library(
pheatmap
)spells2=spells%>%arrange(PAM_completerownames(whz)=spells2$id rownames(c5)
浏览 1
提问于2021-01-12
得票数 1
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1
回答
R-提取(P)热图颜色用于多边形填充
r
、
polygon
、
heatmap
、
fill
、
pheatmap
我在R中创建了一个热图,它
的
大小是n*k,是否可以提取用于ith元素
的
单个颜色?谢谢你,艾伦
浏览 1
提问于2015-01-07
得票数 2
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1
回答
地图上奇怪
的
东西(窃听器?)
r
、
heatmap
、
pheatmap
我对
pheatmap
**:** 做了什么colormat <- df.order[c("FL", "RW", "CL", "= gapRow) 首先,我想问题是由参数annotation_row.I检查两个数据帧
的
行名造成<
浏览 0
提问于2018-12-20
得票数 5
回答已采纳
2
回答
需要64种颜色
的
调色板
:简单
的
热图问题
r
、
colors
、
heatmap
790.4830 790.4830我想要建立一个热图,它足够敏感,每个细胞都有自己
的
阴影maximum for palette Oranges is 9请注意:在上面我粘贴
的
矩阵中,有几个重复
的
值,但通常情况并非如此。我有大约500,000个这样
的
矩阵,我想要绘制它们
的
浏览 2
提问于2020-12-20
得票数 2
回答已采纳
1
回答
滴答标签
的
菲亚特图离散彩色图放置
r
、
plot
、
heatmap
、
pheatmap
我有一个有数千个单元格
的
矩阵,数值从0到5不等。我想
使用
一个离散
的
调色板
来表示各个单元格
的
值。这段代码已经运行得很好,但是彩色地图标签
的
位置已经关闭了。我只想,每一个滴答都在对应颜色
的
中间。library("
pheatmap
") matrix <- round(matrix(rexp(200, rate=.1), ncol=20)/10)color
浏览 1
提问于2021-03-05
得票数 0
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1
回答
带条件热图
r
、
ggplot2
、
heatmap
我
使用
一些rnaseq数据,并且需要在确定
的
基因转录本上绘制一个带有点
的
热图。我想不出如何用ggpplot或
pheatmap
来解决这个问题。因此,我必须
使用
inkscape手动将每个点放在绘图上。Bellow是inkscape
的
图片:我用下面的代码制作了基本
的
情节:a<-pal(200,1
浏览 0
提问于2019-07-16
得票数 1
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1
回答
用
pheatmap
在组内进行聚类
r
、
heatmap
、
pheatmap
我正试图制作一个显示4个不同群体基因表达
的
热图,我想把它们聚在一起。我在列中按组对样本进行了排序。在所有组中
使用
cluster_cols = True集群,混合来自每个组
的
样本
的
顺序。
浏览 0
提问于2018-05-05
得票数 5
1
回答
特定值
的
Pheatmap
颜色
r
、
plot
、
heatmap
、
color-palette
、
pheatmap
我对R非常陌生,最近我一直在玩
pheatmap
库来生成,嗯,热图。我
的
问题是,我想用一种特定
的
方式来着色我
的
热图。我将在下面描述: 我
使用
过各种
调色板
的
breaks参数和color参数,但我似乎无法找到一个好
的
解决方案。我来得最近
的
地方是这样<
浏览 5
提问于2017-01-21
得票数 2
1
回答
使用
pheamap为heatmap中
的
一系列值
指定
特定颜色
r
、
heatmap
、
pheatmap
我想用
pheatmap
制作一个热图,如果有任何值在-1到-0.5之间,它应该是深绿色,在-0.5到-0.10之间
的
任何值都是亮绿色,在-0.10到0之间
的
任何值都应该是白色。同样,0到0.10表示白色,0.10到0.5表示浅紫色,0.5到1之间
的
任何值表示紫色。我也不想在没有集群
的
情况下扩展我
的
数据。0.07 -0.15 -0.45 -0.51 -0.57 -0.68 df <- read.table("test.txt", header
浏览 1013
提问于2021-07-30
得票数 0
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1
回答
按注释对
pheatmap
进行排序
r
、
rstudio
、
heatmap
、
pheatmap
我正在尝试
使用
pheatmap
包创建一个图形。我想按我正在
使用
的
注解对数据进行分组,但它不会分组在一起。我
的
数据在这里: sub_samp <- structure(c(1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, "SPSARDRVGX", "SPTGGSYNX", "SRXGTSGRADE", "SRDXG
浏览 624
提问于2019-09-06
得票数 2
回答已采纳
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