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2
回答
如何分割和命名文本文件(基于否)。(大数据的内容行)?
、
我在
Linux
机器上有一个1000's的文本文件,每个文本文件的名称都有一个前缀(OG00*),包含9个唯一的I。_c0_g2_i1.p1
TRINITY
_DN6645_c0_g1_i2.p1
TRINITY
_DN19713_c3_g1_i2.p1
TRINITY
_DN4587_c0_g1_
浏览 0
提问于2021-04-12
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1
回答
提取部分列名以创建新列
、
下面的矩阵列如下:
TRINITY
_DN109651_c0_g1_i112.38 32.55 62.98 37.92 9.05
TRINITY
_DN26469_c0_g1_i1 1.91 0.00 2.62 2.92 2.22我想为每一行提取第一列(
TRINITY
_DN12001_c0_g1_i3)的一部分,并使用该ID创建一个新列。我想让它看起来像
浏览 0
提问于2020-05-01
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1
回答
samtools和三位一体导致conda env中的不一致
、
、
、
check the package plan carefully - bioconda/
linux
-64::
trinity
==2.9.1=h8b12597_0 condainstall -c bioconda busco -y 到目前为止,我已经尝试过在我的频道中添加conda -
浏览 8
提问于2022-03-03
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3
回答
如何在12.04安装三位一体?
、
、
、
我尝试添加PPA并执行sudo apt-get install kubuntu-default-settings-
trinity
kubuntu-desktop-
trinity
,但是我得到了一个错误:: Depends: ark-
trinity
but it is not going to be installed Depends: kcontrol-
trinity
Depends: tdm-
trinity
but it is not going to
浏览 0
提问于2012-09-28
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1
回答
将ID的多个变量打印到带有ID的单行中,并在行中打印其单变量?
、
我有一个包含10,000多个条目的文件:
TRINITY
_DN4798_c0_g1_i1.p1 GO:0046659
TRINITY
_DN4326_c0_g1_i3.p1 GO:0000977|GO:0045944
TRINITY
_DN4798_c0_g1_i1.p1 GO:0046658
TRINI
浏览 0
提问于2020-03-23
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2
回答
arxiv.org反机器人“搜索和摧毁”实际上是做什么的?
、
lanl.arxiv.org数学和科学预印服务(以前称为xxx.lanl.gov)对忽视其robots.txt,机器人当心的机器人有严格的政策。在那一页上,有一个标签为“点击这里启动对你的网站的自动‘寻找和破坏’的链接,这是他们的robots.txt禁止的,但可能行为恶劣的机器人会跟随它,并收获后果。问题是,实际后果是什么?我从来没有胆量去真正点击那个链接来看看它能做什么。他们能做些什么,既有效又合法?
浏览 0
提问于2009-05-01
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3
回答
将包含多个数据条目的行扩展为单个行,每个行包含一条数据
、
、
、
、
例如: SOAP.k35.scaffold280 0003723 SOAP.k35.scaffold429 0004930 0016021SOAP.k35.scaffold429 = 0004930
TRINITY
_DN23171_c1_g1_i2 = 0006457
TRINITY
_DN23171_c1_
浏览 22
提问于2019-02-04
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1
回答
使用可变字符串数拆分特定列的内容
、
、
、
例如
TRINITY
_DN6318_c1_g1_i1 GO:0004707GO:0005524
TRINITY
_DN23871_c0_g1_i1 GO:0003735
TRINITY
_DN23871_c0_g1_i1 GO:0005829
TRINITY
_DN6318
浏览 0
提问于2019-09-25
得票数 1
1
回答
正在将文本重新格式化为R中的表格
、
、
、
、
文本文件如下所示:
TRINITY
_GG_17866_c3_g1_i1GO:0000226GO:0006259GO:0003674我最终想要得到的是这样的(用制表符分隔)
TRINITY
_GG_17866_c1
浏览 5
提问于2020-07-01
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2
回答
如何删除具有相同结构但内容不同的文件中的模式?
、
ID=
TRINITY
_DN0_c0_g1_i1.p1;Parent=
TRINITY
_DN0_c0_g1~~
TRINITY
_DN0_c0_g1_i1.p1;Name=ORF%20type%3A5prime_partialID=
TRINITY
_DN0_c0_g1_i1.p1.exon1;Parent=
TRINITY
_DN0_c0_g1_i1.p1 BAN_
TRINITY
_DN0_c0_g1_i1 transdecoder+ 0 ID=cds.
TR
浏览 3
提问于2021-08-05
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5
回答
使用unix (awk,sed,bash?)用第四个下划线截断列中的项?
、
、
、
AT1G15820.1
TRINITY
_DN96909_c1_g2_i1.p1
TRINITY
_DN96909_c1_g2_i1.p1 1.36e-115AT1G15820.1
TRINITY
_DN96909_c1_g1_i1.p1
TRINITY
_DN96909_c1_g1_i1.p1 6.26e-66 我想取第三列并截断它,以便
浏览 7
提问于2021-11-29
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4
回答
移除两列中包含字符串的行
、
、
我有一个标签分隔文件:
TRINITY
_DN12995_c0_g1_i1.p1 PF06799 NA
TRINITY
_DN6047_c0_g1_i1.p1 PF10585 GO:0008641
TRINITY
_DN2787_c0_g1_
浏览 0
提问于2019-09-06
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3
回答
有没有办法重新格式化以下文本文件的结构
、
、
文本文件如下所示:
TRINITY
_GG_17866_c6_g1_i1
TRINITY
_GG_17866_c1_g1_i7GO:0006139
TRINITY
_GG_17866_c5_g1_i1GO:0005488 我最终想要得到的是这样的
TRINITY
_GG_17866_c6_g1_i1
TRINITY<
浏览 27
提问于2020-07-01
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1
回答
如何使用Ubuntu命令行删除fasta文件中其他字符/字符串/模式之间、之前和之后的字符/字符串/模式
、
如何从以下内容更改fasta文件中的所有行:CATGAGCTGTTCAGGCACAAGCCACAACATTTATCCACAGTAAGCTCTGAGAAAGTACAA>
TRINITY
_DN40607ATGGGATTAACTGGTAAGTTAATTGCTGCAATA
浏览 0
提问于2022-07-24
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4
回答
在pfam输出文件中将多行连接成一行
、
、
、
我有多行的以下数据:
TRINITY
_GG_428_c0_g1_i1_orf1 PF00036.27 efhand
TRINITY
_GG_428_c0_g1_i1_orf1 PF13405.1 EF_hand_4
TRINITY
_GG_428_c0_g1_i1_orf1 PF13202.1 EF_hand_3 <e
浏览 3
提问于2016-03-09
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回答
将值合并到用逗号分隔的同一列中
、
head(a) 1
TRINITY
_GG_100008_c0_g1_i8.mrna1 GO:00305152
TRINITY
_GG_100008_c0_g1_i8.mrna1 GO:00305154
TRINITY
_GG_100016_c0_g1_i1.mrna1 GO:0004467 5
TRINITY
_GG_1000
浏览 24
提问于2020-12-05
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3
回答
从数据框中删除反转的重复项
、
、
TRINITY
_DN16813_c0_g1_i3
TRINITY
_DN16813_c0_g1_i4 96.491 228 8 0 202 429 417 190 3.049999999999999e-104 377
TRINITY
_DN16813_c0_g1_i4
TRINITY
_DN16813_c0_g1_i3 96.104 231 9 0 190 420 429 1992.979999999999999e-104 377 我只需要保留一行,其中第三列的值较高
TR
浏览 41
提问于2019-01-27
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1
回答
如何比较两个文件的第一列但获得第二列(使用Perl)
、
、
基本上我有:
TRINITY
_DN10001_c0_g1_i1
TRINITY
_DN10001_c0_g1_
TRINITY
_DN10001_c0_g1_i1_g.84091_m.84091
TRINITY
_DN100032_c0_g2_i1
TRINITY
_DN100032_c0_g2_
TRINITY
_DN100032_c0_g2_i1_g.20078_m.20078
TRINITY
_DN100032_c0_g2_i1
TRINI
浏览 0
提问于2016-11-23
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1
回答
基巴纳的服务不会开始
、
、
Nov 13 12:10:13
Trinity
systemd[1]: Stopped Kibana - dashboard for Elasticsearch.Nov 13 12:10:13
Trinity
systemd[1]: kibana.service: Failed with result 'exit-code'.Nov 13 12:10:11
Trinity
systemd[1]: Stopped Kibana - dashboard for Elasticsearch.Nov 13 12:10:11 <e
浏览 0
提问于2020-11-13
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2
回答
提取多列并在中间添加空字符。
、
、
我有一个具有以下格式的文件:
TRINITY
_DN119037_c0_g1_i1 4 * 0 0 * * 0 0 TAAGATTAGGTTGTATTCCAG* XO:Z:NM
TRINITY
_DN119099_c0_g1_i1 4 * 0 0 *
浏览 0
提问于2019-04-04
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