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高通量数据分析必备|基因组浏览器使用介绍 - 3

前面两篇文章(高通量数据分析必备|基因组浏览器使用介绍 - 1高通量数据分析必备|基因组浏览器使用介绍 - 2)介绍了EPGG的基本使用、各部分特征、Track类型、物种支持、公共数据、结果储存发表和分享等。这都是基本浏览器的功能。除数据浏览功能外,EPGG还提供了数据分析和绘图功能,具体如下:

EPGG还提供了很多实用的分析功能,如下图:

同时展示多个基因在多个样品的表达或修饰状态

基因组浏览器分成2个panel,对比展示区域。类似于基因集展示,但更灵活。

只展示基因区,移除基因间区,更方便浏览。

染色体范围的Track分布。

同源基因、同源区域展示,两物种共线性基因组联动。

两个数值Track在给定区域的比较,比如看启动子区H3K4me1和K3K27me3的结合,识别Bivalent promoter

TSS上下游区域H3K4me1, H3K27me3等修饰或TF结合图谱绘制

Roadmap数据专用展示。

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