BGISEQ自主平台meta测序教师节感恩回馈

参与教师节活动赢测序豪礼

又是一年教师节，为了向长期奋斗在科研工作中的老师们表达敬意，科技君精心准备了上百份宏基因组测序好礼，只要您的研究对象是人肠道菌群，样本数达到30个以上，就有机会赢取价值上万元的测序折扣！还有什么比直接省钱来得更实在？

【活动内容】

2.提交问卷即可参与抽奖，保存抽奖结果作为后续签单折扣凭证，并联系当地科技销售代表签订合同；

【参与条件】人粪便样本，样本数大于30；

【奖项设定】

特等奖2名，一折（获奖者享受该折扣的样本数可多达30个）；

一等奖5名，三折（获奖者享受该折扣的样本数可多达30个）；

二等奖10名，五折（获奖者享受该折扣的样本数可多达30个）；

三等奖100名，八折（样本数不限，先到先得）；

【产品包内容】

提取+建库+测序（5G/10G clean data）；

【活动时间】2018.9.10-2018.11.10；

【活动细则】

1. 全国科研用户均可参与，每个用户限一个名额，参与抽奖的项目样本数需大于30个；

2. 特等奖/一等奖/二等奖获奖者享受对应折扣的样本数最多为30个；多于30个样本的项目，多出部分按八折优惠；

3. 获奖者需在12月10日之前签订合同时一并支付50%预付款，并于半年之内完成送样，否则默认放弃领奖；

4. 获奖名额仅限科室内部使用，不可折现，不可转让。

*本次活动最终解释权归深圳华大基因股份有限公司所有

选择BGISEQ平台meta测序的理由

稳定的产出高质量测序数据

图1 1000+条lane BGISEQ平台测序质量统计

低duplicates获更多有效数据和更高覆盖度

图2 BGISEQ平台meta测试结果展示

基因/物种检测结果与H平台一致率高

BGISEQ平台与H平台基因/物种检测结果一致性分析

表1 BGISEQ平台与H平台基因检测结果一致性

图3 BGISEQ平台与H平台物种检测结果一致性

无Index hopping担忧

BGISEQ平台利用DNA纳米球（DNB）技术，采用滚环扩增，以一个单链模板DNA进行环化建库，且在环化步骤中，非环化的DNA将被消化，从原理上为您分忧。

图4 BGISEQ平台环化示意图

案例展示

1、BGISEQ-500宏基因组测序应用性能测试结果[1]

为评估BGISEQ-500的宏基因组测序应用性能，本研究收集并提取了20例健康成年人粪便DNA，采用BGISEQ-500平台完成该20例样本的深度宏基因组测序。同时，研究人员随机选择8例DNA样本作为技术重复，产出8对文库构建重复与8对测序重复数据集以评估该测序平台的稳定性，并完成全部20例DNA样本在Illumina HiSeq2000 与HiSeq4000双平台的测序以评估跨平台数据的一致性。

在定性层面，BGISEQ-500平台内的两组技术重复内可稳定检测的基因数高达99.5%以上，在定量层面，两组数据间的基因相对丰度相关性可高达0.92以上，物种相对丰度相关性可高达0.99（图5），这一结果显示了BGISEQ-500平台内高稳定性；此外，对BGISEQ-500与HiSeq2000的比较展示： 跨平台数据集可稳定检测的基因一致性高达91.8%，对平台间基因丰度的统计检验仅检出3.25%显著差异基因，两平台在物种丰度的相关性仍达94.8%（图6）。

图5 BGISEQ-500与HiSeq2000/HiSeq4000平台间的一致性评价

图6 BGISEQ-500与HiSeq2000平台间差异基因的比较

2、基于BGISEQ平台完成全球首个大鼠肠道微生物参考基因集构建[2]

基于BGISEQ-500平台，采用宏基因组鸟枪法测序技术，总计测序量 2,512Gb；通过数据组装，基因预测，去除冗余基因序列，最终得到包含约510万个非冗余的SD大鼠肠道微生物参考基因集，约为大鼠自身基因的200倍，并且趋近于饱和。其中，64.6%的基因可注释到物种门水平，主要归属于厚壁菌门（75.90%）、拟杆菌门（10.83%）和变形杆菌门（6.77%）；26.7%的基因可注释到物种属水平，主要为梭菌属（8.74%）、拟杆菌属（6.25%）、罗斯氏菌属（4.75%）、瘤胃球菌属（4.44%）和毛螺菌属（2.58%）。同时，在基因功能水平上，53.1%的基因可以注释到 KEGG数据库（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）。

【参考文献】

1. Fang C, Zhong H, Lin Y,et al. Assessment of the cPAS-based BGISEQ-500 platform for metagenomic sequencing[J].GigaScience, 2017, 7(3): gix133.

2. Pan H, Guo R, Zhu J,et al. A gene catalogue of the Sprague-Dawley rat gut metagenome[J].GigaScience, 2018, 7(5): giy055.

撰稿：张 义

编辑：市场部