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钱文峰研究组优化单细胞DNA甲基化修饰异质性算法并发布数据库HeteroMeth

DNA甲基化是真核生物体内广泛存在的一种表观遗传修饰,在基因转录调控、细胞分化、基因组印迹、X染色体失活等生物学过程中发挥着至关重要的作用。由于测序技术和计算方法的局限,以往研究者获得的是一个细胞群体的平均DNA甲基化水平。平均化的甲基化水平虽然承载着一定的信息,却丢失了诸如不同细胞之间存在的甲基化异质性等重要信息,而后者在胚胎发育、细胞分化过程中可能具有特殊的意义。

上述研究发表于Genomics, Proteomics & Bioinformatics(DOI:10.1016/j.gpb.2018.07.002)。钱文峰研究组助理研究员郇庆和博士研究生张宇亮为该论文的共同第一作者。该研究得到了中国科学院战略性先导科技专项的资助。

利用细胞群体样品亚硫酸氢盐测序的数据准确地定量细胞间DNA甲基化异质性

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  • 原文链接https://kuaibao.qq.com/s/20180915B0AATR00?refer=cp_1026
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