R语言编程艺术 第1章 快速入门

今天是生信星球陪你的第258天

大神一句话，菜鸟跑半年。我不是大神，但我可以缩短你走弯路的半年~

就像歌儿唱的那样，如果你不知道该往哪儿走，就留在这学点生信好不好~

这里有豆豆和花花的学习历程，从新手到进阶，生信路上有你有我！

新的开始。其实手头事情很多，想着要不结束后再开始？可是，忙完这阵，也不过是忙下一阵而已，择日不如撞日，就今天。发文临近12点，没赶上。干脆悠然选了个封面图~~~走啦。

1.R语言运行

交互模式

常规的session，用source("z.R")运行脚本

批处理模式

在linux命令行运行 R CMD BSATCH z.R

（计算，小函数，赋值，内置数据集作图）

2.函数

oddcount()计算整数向量中奇数的个数

(1)小知识点

取整 ，取余 ，

行首的大于号和加号，

for循环和k=k+1，

注意代码简洁，可以不写下标

函数中的return：没有显式调用return()时，R语言的函数会返回最后计算的值，不写需谨慎）

函数的作用域

{}内是函数体，里面的n、x都是局部变量，在函数体外无效

（2）关于参数

定义函数：

调用函数：

形参和实参：12是x的实际参数，接受了默认参数y，覆盖了参数z。

默认参数：y的初始化值是2。

3.数据结构

（1）向量

向量必须术语某种“模式”，即数据类型mode()，比如整数型、字符型

字符串实际上是字符模式(而不是数值模式)的单元素向量。

字符串的拆分和组合：paste和strsplit

（2）矩阵

例：

矩阵乘法：

取子集，提取子矩阵

（3）列表

值的容器，其中的值可以属于不同的数据类型。

组件（组成部分），以

str代表structure(结构)。这个函数可以显示任何R对象的内部结构，不只限于列表。

（4）数据框

通常通过读取文件和数据框来创建。是特殊的列表，可以通过开头。作图是有返回值的，返回列表¨G3Gstr代表structure(结构)。这个函数可以显示任何R对象的内部结构，不只限于列表。¨K15K通常通过读取文件和数据框来创建。是特殊的列表，可以通过调用列。

（5）类

R语言是一门面向对象的编程语言。对象是类的实例。

4.扩展

读取--read.table，默认header=FALSE

class-查看类型，head，查看前几行。

lm(y~x)函数，拟合预测方程：y=β0+β1×x

lma

5.获取帮助

（1）help()

help(seq)

快捷方式

？seq

?"for"

(2)example()

运行示例代码

(3)不清楚要找什么

(4)其他主题的帮助

整个包的帮助文档：

help(package=MASS)

主题搜索

（5）批处理模式帮助

R CMD command --help

R CMD INSTALL --help

6.互联网资源

R语言主页(http://www.r-project.org/)

R语言主页(http://www.r-project.org/)

CRAN(R语言综合资料网，网址为http://cran.r-project.org/)

简书：小洁忘了怎么分身

隔壁生信技能树公益视频合辑（学习顺序是linux，r，软件安装，geo，小技巧，ngs组学！）

国内看B站，教学视频链接：https://m.bilibili.com/space/338686099

国外看YouTube，教学视频链接：https://m.youtube.com/channel/UC67sImqK7V8tSWHMG8azIVA/playlists