AnnoProbe是曾建明老师2020年开发的一款用于下载GEO数据集并注释的R包,收录在tinyarray里。 idmap##根据所给的GPL号，返回探针的注...

高通量的原始数据通常情况下会上传到NCBI的SRA（Sequence Read Archive）数据库。

生成Group向量的三种常规方法，三选一，选谁就把第几个逻辑值写成T，另外两个为F。如果三种办法都不适用，可以继续往后写else if

箱线图：单个基因在组之间的表达量差异，必须知道每个组是对照组还是实验组。R语言中同一个分组对应一个关键词，比如对照组不能写成对照1，对照2，这样就不能把对照归为...

---title: "GEO表达芯片数据分析"output: html_documentdate: "2023-03-20"---关于该流程代码的说明：（1）本...

GEO数据挖掘—3 富集分析 （一）GO富集分析（用差异基因做富集） 输入数据 #(1)输入数据 gene_up = deg$ENTREZID[deg$chan...

差异分析可视化 rm(list = ls()) load(file = "step1output.Rdata") load(file = "step4outp...

geoChina的用法 #数据下载 rm(list = ls()) library(GEOquery) #先去网页确定是否是表达芯片数据，不是的话不能用本流程。...

检查矩阵是否正常，如果是空的就会报错，空的和有负值的、有异常值的矩阵需要处理原始数据。0~20之间就是一个已经取过log的矩阵

GEO数据挖掘—2 四、代码分析流程 1. 下载数据并从中提取有用信息 gse_number = "GSE56649" eSet <- getGEO(gse_n...

的编号开头是？ •...

用 R 的话也可以使用 getGEO(gse) 和 getGEOSuppFiles(gse)函数 ,

logFC > 0，treat>control，基因表达量上升（而不是上调，上下调要结合p值来定义）

基于接口板的硬件构造，某些形态设备上接口只能作为二层以太网接口，某些形态设备上接口只能作为三层以太网接口，而还有一些接口则比较灵活，可以改变其二三层模式：在二层...

install.packages("AnnoProbe")#用于下载GEO数据的包

在GEO上搜索数据，下载其表达矩阵（如果以M为单位，说明文件可用；如果大小只有K，说明文件不可用）

本教程将以官网—2016年10月飓风马修登陆为例，介绍在实际应用WRF-ARW中涉及到的重启动、海温更新、以及网格嵌套等操作流程（基于北京超算中心云服务器平台）...

这里假设要实现的是“附近的地铁站”功能，key为list，member为地铁站id

大家好！今天给大家介绍一篇2022年7月发表在Genome Medicine(IF:15.266)上的一篇文章。作者对肺鳞癌的转录组数据集进行分析并鉴定到一类衰...

朋友的定位，附近的人，位置共享，打车距离 redis在3.2就已经推出了geospatial！两地之间的距离，方圆几里的人！都可以用它实现 这个需要把你所在...