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#geo

探针转换与基因去重

小辫子

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limma包做差异分析之分组矩阵和比较矩阵

小辫子

"group"的levels为"after"和"befor",所以design2只有两列;"pairinfo"的levels为c(1:18),所以design3...

11510

GEO样本名称处理和对照夹杂影响后续分析吗,如何获取样本名称

小辫子

综上,只要能成功区分,并且分组与样本是一一对应的即可,无论是"control""control" "case""case",还是"control""case""...

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GEO数据提供的rds是一个SingleCellExperiment对象就不会操作了吗?

生信技能树

如果你有任何生信疑问,可以看看我们的这两个专辑哦:《生信马拉松答疑》和《马拉松授课互动答疑》,也欢迎大家图文并茂发邮件:jzhang910@qq.com 或者加...

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第七章 LBS及GEO介绍

RookieCyliner

在一定误差范围内,通常情况下,经纬线和米的换算为:经度或者纬度0.00001度,约等于1米。以下表格列出更细致的换算关系

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Spring Boot和Redis Geo实现附近的人【redis实战 三】

一只牛博

Redis Streams在Spring Boot中的应用:构建可靠的消息队列解决方案【redis实战 二】

10110

Redis Geo:掌握地理空间数据的艺术

一只牛博

在移动互联网和物联网的时代,地理位置数据无处不在。从导航和配送到社交网络和广告,地理位置信息正在重新定义我们与世界的互动方式。但是,处理和分析这些大量的地理空间...

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GEO数据作者不上传具体的样本对应信息是故意为之吗?

生信技能树

老师们好,请教一下这个单细胞数据集的怎么读入呢?需要挑选具体的样本读入,给的GSE的那三个文件是整体的没有分组信息。GSM的RAW只给了barcodes的csv...

9010

SEO老了?GEO来了!玩转传统搜索+AI搜索,吸引眼球大作战!

LeonAlgo

上网冲浪、查资料、找游戏攻略、看爱豆新闻……你们肯定天天都在用搜索引擎,对吧?比如百度、谷歌啥的。但你们有没有想过,为啥有些网站总排在前面,有些却石沉大海?这背...

11300

地图(八)利用python绘制散点地图

HsuHeinrich

2. 基于pyecharts的涟漪散点地图(Effect Scatter Map)

21310

Day1_Jiang

Ace_ice

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三种方式下载GEO芯片注释文件GPL

生信技能树

一般,我最先会使用 GEOquery这个包进行下载,代码如下,只需要给出 GEO编号,设置 getGPL = T即可,随便给一个GSE编号:GSE228568

1.5K10

规范统一格式的GEO RNA-seq count及其标准化数据

用户11414625

参考网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/rnaseqcounts.html#why

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iSeq:GSA-SRA-ENA-GEO-DDBJ 数据下载一网打尽

用户1075469

最近需要下载些公共数据,在简书上搜索到了有小伙伴介绍 iseq,测试了下效果不错,可以媲美 KingFisher,虽然还没曾正式发表(预印本),亲测效果不错,推...

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不装了,摊牌了,转录组测序表达量矩阵就这么简单!

生信技能树

确实是一个fpkm格式的表达量矩阵,虽然说geo页面给出来了一下 差异分析的组合,但是没办法替代我们自己想从原始的counts矩阵开始的差异分析需求。

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GEO—芯片GSE3292 _pd 中无法找到分组信息—火山图中添加目标基因

sheldor没耳朵

采用的数据集是GSE3292,2005年发表的基于芯片的转录组测序数据,按照常规方法导入即可

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redis之地理空间geo实战以及选项详解

九转成圣

Redis GEO Redis GEO 主要用于存储地理位置信息,并对存储的信息进行操作,该功能在 Redis 3.2 版本新增。

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GEO数据挖掘-基于芯片

sheldor没耳朵

在require()函数中,如果直接传递包的名称作为参数,不需要加引号;如果包的名称以字符串形式存储在变量中,则需要使用character.only = TRU...

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如何突破单细胞数据获取的门槛:从GEO到Cell Ranger

生信菜鸟团

书接上回,一步步尝试代码复现,然后,我们就来到了Figure 2.I,乍看只是平平无奇的堆叠图嘛,殊不知这是多个外部数据集整理后的对比~

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Redis基础教程(十五):Redis GEO地理信息查询与管理

用户11147438

在现代互联网应用中,地理位置数据变得越来越重要,尤其是在地图服务、位置追踪、本地化营销和地理围栏应用中。Redis,作为一款高性能的键值存储数据库,自从3.2版...

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