在进行数据挖掘的时候,我们往往会筛选到不止一个符合我们预期的数据集,这些数据集来源于不同的研究人员。这样得到的这些数据集就会存在我们所谓的批次效应,如不同实验...
NumPy是 Python 科学计算(Scientific Calculation,SC,也就是本系列标题中缩写字母的含义) 生态系统的基础与最重要的组成部分(...
其中,GSEXXXXXX 是该数据集的 accession number,是一个唯一标识符,用于在 GEO 数据库中检索该数据集的信息。可以通过构建类似这样的 ...
就会发现,matrix.mtx文件里面的33694、2049、1878957数值,分别是细胞数量,基因数量,以及有表达量的值的数量(全部的值应该是33694X2...
但是如果要下载成百上千个文件,最好是使用代码批量下载,而且现在单细胞技术的大行其道,使得表达量矩阵文件本身也会很巨大,比如:https://www.ncbi.n...
Composites all the images in a collection, using the mask. Arguments: this:colle...
今天正式开始教画图了,具体的代码其实挺多地方讲到了,上课的好处就是可以听到很多细节和经验,是自己零散地找资料不能相比的,收获很多,感觉要全部吞下来还要再复习几遍
广义的基因有6w+个,包括lncRNA、miRNA等等,每年可能都有个别基因增增减减的情况,累计在一起,就存在基因库版本的差异,10年前查到的和今年的可能不一样...
georadiusbymember 和 georadius 命令一样, 都可以找出位于指定范围内的元素, 但是 georadiusbymember 的中心点是由...
geoadd key [NX|XX] [CH] longitude latitude member [longitude latitude member ......
对于bitmap,我们取值的时候,需要知道bit的位置,改值的时候,需要知道位置和修改结果。取值和修改的操作变得复杂了一些,但是节省了存储空间,属于时间换空间。...
官方文档:https://pyecharts.org/#/zh-cn/quickstart Python使用Pyecharts画Geo地图,如何显示具体地点名...
GEO 主要用于存储地理位置信息(纬度、经度、名称)添加到指定的key中。该功能在 Redis 3.2 版本新增。
为了根据地图的地理数据生成 SVG 中 path 元素的路径值,需要用到d3.geoPath([projection[, context]),称它为地理路径生成...
这个时候仅仅是需要替换里面的GPL的信息即可,当然了,前提是,网络得好,因为是geo数据库,在海外。。。。
Apache Pulsar 是一个多租户、高性能的服务间消息传输解决方案,支持多租户、低延时、读写分离、跨地域复制(GEO Replication)、快速扩容、...
输入数据是数值型矩阵/数据框,颜色的变化表示数值的大小。有相关性热图和差异基因热图。
AnnoProbe是曾建明老师2020年开发的一款用于下载GEO数据集并注释的R包,收录在tinyarray里。 idmap##根据所给的GPL号,返回探针的注...
高通量的原始数据通常情况下会上传到NCBI的SRA(Sequence Read Archive)数据库。
生成Group向量的三种常规方法,三选一,选谁就把第几个逻辑值写成T,另外两个为F。如果三种办法都不适用,可以继续往后写else if