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今天我们介绍一款使用三代全长转录本数据进行转录本校正,聚类,可变剪切分析,定量和差异分析为一体的工具 - FLAIR。来自加利福尼亚大学圣克鲁斯分校(Unive...
PacBio测序平台构建完成的测序文库形状就如同一个哑铃(Dumbell), 所以叫做SMRT bell, 图1右所示。其主要组成部分是:发卡状的接头(Hai...
今天我们继续介绍一款使用三代全长转录本数据进行转录本注释和定量的工具 - Bambu。来自新加坡科技研究局 (A-STAR) 的Jonathan Göke(图1...
Functional IsoTranscriptomics (FIT) 是美国弗罗里达大学(University of Florida)Ana Conesa 教...
Isoseq 数据分析第一部分我们最后使用了isoseq cluster 获得了聚类后高质量的转录本,但是我们仍然不知道这些经过聚类的转录本在基因组的位置以及属...
很多物种的转录本非常多样和复杂,绝大多数真核生物基因不符合“一基因一转录本”的模式,这些基因往往存在多种可变剪切(Alternative splicing,AS...
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