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用R代替简单的cytoscape绘图需求

相关教程----R语言之生信(11)五分钟学会用R语言构建ceRNA网络

一般做分子或者基因蛋白等的调节网络,不可避免的需要绘制调节网络,如下图所示:

之前,我一般都是首选cytoscape软件,将数据导入cytoscape以后,就可以绘图。但是cytoscap的缺点是:第一个cytoscape软件下载和运行占用空间比较大,第二个需要手动调节每一个节点,或者批量调节节点,比较费时费力。所以我比较希望一个能够自动帮我绘图且省时省力的软件。因此我们可以使用R语言绘制如下的图片:

第一种方法

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