前往小程序,Get更优阅读体验!
立即前往
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
社区首页 >专栏 >letswave7中文教程4:脑电数据预处理-时域分析

letswave7中文教程4:脑电数据预处理-时域分析

作者头像
脑机接口社区
发布2020-06-30 12:01:21
8710
发布2020-06-30 12:01:21
举报
文章被收录于专栏:脑机接口脑机接口

第7步:分割/Epoching

在管理器模块数据列表中选择数据集“sp_filter ica chan_interp butt sel_chan sub093”,在菜单中点击Process->Epochsegmentation-> Segment relative to events (one file per event code)

在Batch模块中,选择事件代码S 9和S 10,并将epoch的开始时间和持续时间设置为-1和3。

点击Batch模块底部的Run按钮,可能会执行一会。执行框如下。

执行完之后,管理器模块的数据列表中会出现两个新的数据集,分别名为“ep_S 9 sp_filter ica chan_interp butt sel_chan sub093”和“ep_S 10 sp_filter ica chan_interpbutt sel_chan sub093”。

在菜单中,有两项用于分段,分别是Segment relative to events and Segment relative to events (one fileper event code)。它们有相似的功能,但是输出是不同的。如果选择了多个事件代码,则Segment relative to events将具有不同的事件代码的所有epoch分割到一个数据集中。但是,对于Segment relative to events (one file per event code),将根据不同的事件代码生成单独的数据集。例如,在P300数据集的情况下,目标和非目标事件被标记为S 9和S 10。因此,通过Segment relative to events (one file per event code),已经生成了两个数据集。

第8步:剔除伪影

在剔除伪影之前,有必要对所有的epochs进行观察。

选择数据集“ep_S 9sp_filter ica chan_interp butt sel_chan sub093”和“ep_S 10 sp_filter ica chan_interp butt sel_chan sub093”,并在右击菜单中选择view。

在波形的multiviewer中,我们可以看到“ep_S 9 sp_filter icachan_interp butt sel_chan sub093”的波形图.

在界面左上角Datasets中可以选择查看不同数据集。也可以在左侧选择不同的Epoch和Channels查看。

将epoch设置为叠加波,并选择所有的epoch。我们选择通道Pz进行观察,因为它是P300分析中最有趣的通道。当然,我们也应该看看其他通道的情况。通过将y轴从-100设置为100,Pz通道上的所有epoch看起来都很好。两个数据集都没有明显的伪迹。

因此,没有必要在该数据集上执行伪影移除。我们将在这个P300数据集的预处理过程中省略这一步。这里为了给大家展示伪影的操作,我们仍然进行了伪影剔除的操作过程。在Letswave7中,我们提供了两种剔除伪影的方法。

首先,我们可以手动来移除带有伪影的epoch。对于该方法,选择“ep_S9 sp_filter ica chan_interp butt sel_chan sub093”和“ep_S 10 sp_filter ica chan_interp butt sel_chan sub093”数据集,点击菜单中的Edit->Arrangesignals->Rearrange or delete epochs, channels, indexes

在Batch模块中,将选择项设置为“Epoch”,并将希望保留的Epoch放入右列。点击Batch模块底部Run按钮,完成伪影剔除工作。

两个名为“sel_epochep_S 9 sp_filter ica chan_interp butt sel_chan sub093”和“sel_epoch ep_S 10 sp_filter icachan_interp butt sel_chan sub093”的新数据集将出现在管理器模块的数据列表中。

第二种方法是利用一些标准来抑制伪迹,例如某些通道上特定间隔内的EEG信号的值超过某个阈值。对于该方法,选择数据集“ep_S 9 sp_filter ica chan_interp butt sel_chan sub093”和“ep_S 10 sp_filter ica chan_interpbutt sel_chan sub093”,

在菜单中点击Process->Artefact rejection and suppression->Reject epochs(amplitude criterion)

在Batch处理模块中,选择Select channels 复选框,然后选择通道Pz。如果复选框没有被选中,那么该函数将在所有通道上工作。在右侧选择复选框x轴限制,并将相应的间隔设置为0到2秒。如果没有选中复选框,则该条件将对x轴的所有范围起作用。因为y轴上有数据,而z轴是单轴的,所以我们不需要检查这两个轴。

点击Batch模块底部Run按钮,完成伪影剔除工作。在管理器模块的数据列表中将出现两个新的数据集,分别名为“ar-amp ep_9 sp_filter ica chan_interp butt sel_chan sub093”和“ar-amp ep_10 sp_filter icachan_interp butt sel_chan sub093”。事实上,由于这里的P300数据没有伪影要剔除,所以没有epochs被剔除,这两个新的数据集与前一个完全相同。

第9步:重参考(Rereference)

在P300的研究中,通常选择双侧乳突区域的平均值作为参考。因此,我们将重新参考TP9和TP10的平均值。

选择数据集“ep_S 9sp_filter ica chan_interp butt sel_chan sub093”和“ep_S 10 sp_filter ica chan_interp butt sel_chan sub093”,

然后在菜单中单击Process->Rereferencesignals->Rereference

在Batch模块中,在左侧列表框中选择TP9和TP10作为新参考,在右边的列表框(Apply reference for)中选择要应用参考的所有通道。

点击Batch模块底部Run按钮,完成伪影剔除。两个名为“reref ep_S 9sp_filter ica chan_interp butt sel_chan sub093”和“reref ep_S 10 sp_filter ica chan_interp butt sel_chan sub093”的新数据集将出现在管理器模块的数据列表中。

在这里,我们选择TP9和TP10作为两个通道的平均值作为新的参考。对于普通的平均值参考,我们可以在左侧的列表框中选择所有的通道,然后将所有通道的平均值用作新的参考。

第10步:基线校正

在分割中,我们将epoch的起始时间和持续时间设置为-1 s和3 s,这意味着epoch将从-1到2s开始。因此,我们将基线设置为-1 s到0 s来进行基线校正。

选择数据集“rerefep_S 9 sp_filter ica chan_interp butt sel_chan sub093”和“reref ep_S 10 sp_filter icachan_interp butt sel_chan sub093”,在菜单中点击Process->Baseline operation->Baseline correction

在Batch模块中保持默认设置,点击Batch模块底部的Run按钮,完成伪影剔除。

两个新的数据集“blreref ep_S 9 sp_filter ica chan_interp butt sel_chan sub093”和“bl reref ep_S 10 sp_filter icachan_interp butt sel_chan sub093”将出现在管理器模块的数据列表中。

第11步:平均

经过十步预处理后,我们可以简单地对epoch进行平均以进行时域分析。选择数据集“bl reref ep_S 9 sp_filter ica chan_interp butt sel_chan sub093”和“bl reref ep_S 10 sp_filter icachan_interp butt sel_chan sub093”,然后在菜单中单击Process->Average->Compute averag, std, median across epochs

在Batch模块中保持默认设置,点击Batch模块底部的Run按钮进行平均。

两个新的数据集的名称“avgbl reref ep_9 sp_filter ica chan_interp butt sel_chan sub093”和“avg bl reref ep_10 sp_filter icachan_interp butt sel_chan sub093”将出现在管理器模块的数据列表中。

查看结果

选择数据集“avg blreref ep_9 sp_filter ica chan_interp butt sel_chan sub093”和“avg bl reref ep_10 sp_filter icachan_interp butt sel_chan sub093”。单击右键菜单中的”View”,我们可以在multiviewer中看到波形的时域结果。

下面我们选择两个数据集并选择通道Pz,我们可以在Pz上看到P300的结果。打开工具栏中的地形,将光标设置为0.35,可以观察P300的地形。由于它是单受试者的结果,ERP仍然是有噪声。[光标位置和地形图位置在工具栏,有箭头指示]

也可以换个头型

在这一部分中,我们一步一步地演示了预处理和时域分析。对于每个步骤,都要在文件名中添加前缀,如butt、ica和reref。因此,从数据集的名称中,我们对处理步骤能够有大致的了解。

本文参与 腾讯云自媒体分享计划,分享自微信公众号。
原始发表:2020-06-16,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

本文分享自 脑机接口社区 微信公众号,前往查看

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

本文参与 腾讯云自媒体分享计划  ,欢迎热爱写作的你一起参与!

评论
登录后参与评论
0 条评论
热度
最新
推荐阅读
目录
  • 第8步:剔除伪影
  • 第9步:重参考(Rereference)
  • 第10步:基线校正
  • 第11步:平均
相关产品与服务
批量计算
批量计算(BatchCompute,Batch)是为有大数据计算业务的企业、科研单位等提供高性价比且易用的计算服务。批量计算 Batch 可以根据用户提供的批处理规模,智能地管理作业和调动其所需的最佳资源。有了 Batch 的帮助,您可以将精力集中在如何分析和处理数据结果上。
领券
问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档