Vennerable做韦恩图

生信编程日常

发布于 2020-07-16 17:19:26

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发布于 2020-07-16 17:19:26

#Install the latest version of this package by entering the following in R:
install.packages("remotes")
remotes::install_github("js229/Vennerable")

导入测试数据，StemCell数据为4个基因list.

library(Vennerable)
data(StemCell)
str(StemCell)

Vstem3<-Vstem[, c("OCT4", "SOX2", "NANOG")]
plot(Vstem3, doWeights = FALSE)

此外，还可以根据集合的大小改变圈圈的大小：

plot(Vstem3,doWeight = TRUE)

除了常规的圆圈，还可以用三角形取交集：

plot(Vstem3,type="triangles")

Vstem <- Venn(StemCell)
plot(Vstem, doWeights = FALSE,type="ellipses")

此外，还有各种不同的表现方式： 1.squares

plot(Vstem, doWeights = FALSE,type="squares")

2.ChowRuskey

plot(Vstem, doWeights = FALSE,type="ChowRuskey")

3.AWFE

plot(Vstem, doWeights = FALSE,type="AWFE")

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