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网络药理学TCMSP数据库

原文叙述:

在TCMSP中选择“Herb name”检索得到海藻、黄 芪、丹参、熟地黄、鱼腥草、荆芥穗的分子ADME参数信 息,由于该数据库尚未收录牡蛎相关的分子信息,故通 过查阅文献得到牡蛎相关的成分,并在TCMSP中选择 “Chemical name”得到这些成分的ADME参数信息。 然后根据每个分子的口服生物利用度(OB)和类药性 (DL)筛选出肾病Ⅲ号方中各中药可能的活性成分。

在TCMSP中检索出与肾病Ⅲ号方7味中药有关的 全部化合物,根据OB≥30%和DL≥0.18[ 6-7]的筛选条件 得到海藻有4个、黄芪20个、丹参65个、熟地黄2个、 牡 蛎2个、鱼腥草7个、荆芥穗8个活性成分,其中海藻、 黄 芪、鱼腥草含有相同活性成分1个,丹参与荆芥穗、荆芥 穗与熟地黄、黄芪与鱼腥草、荆芥穗与熟地黄各含有相 同活性成分1个,共得到102个活性成分(表1)。

步骤

进入数据结果页面,我们可以看到,数据有很多列,这些指标,可以根据自己的分析去删选,现在一般的分析主要用OB和DL两个作为删选条件,当然大家可以自己设定条件。该数据库特别的价值在于,它为每种化合物提供了药物药代动力学信息,如成药相似性(DL),口服生物利用度(OB),血脑屏障(BBB),肠上皮通透性(Caco-2) ,脂水分配系数(ALogP)和H键供体/受体(Hdon / Hacc)的数量。

结果如下
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整理成三线表

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