前往小程序,Get更优阅读体验!
立即前往
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
社区首页 >专栏 >网络药理学TCMSP数据库

网络药理学TCMSP数据库

作者头像
用户1359560
发布2020-08-11 15:55:05
2K0
发布2020-08-11 15:55:05
举报
文章被收录于专栏:生信小驿站生信小驿站

原文叙述:

在TCMSP中选择“Herb name”检索得到海藻、黄 芪、丹参、熟地黄、鱼腥草、荆芥穗的分子ADME参数信 息,由于该数据库尚未收录牡蛎相关的分子信息,故通 过查阅文献得到牡蛎相关的成分,并在TCMSP中选择 “Chemical name”得到这些成分的ADME参数信息。 然后根据每个分子的口服生物利用度(OB)和类药性 (DL)筛选出肾病Ⅲ号方中各中药可能的活性成分。

在TCMSP中检索出与肾病Ⅲ号方7味中药有关的 全部化合物,根据OB≥30%和DL≥0.18[ 6-7]的筛选条件 得到海藻有4个、黄芪20个、丹参65个、熟地黄2个、 牡 蛎2个、鱼腥草7个、荆芥穗8个活性成分,其中海藻、 黄 芪、鱼腥草含有相同活性成分1个,丹参与荆芥穗、荆芥 穗与熟地黄、黄芪与鱼腥草、荆芥穗与熟地黄各含有相 同活性成分1个,共得到102个活性成分(表1)。

步骤

进入数据结果页面,我们可以看到,数据有很多列,这些指标,可以根据自己的分析去删选,现在一般的分析主要用OB和DL两个作为删选条件,当然大家可以自己设定条件。该数据库特别的价值在于,它为每种化合物提供了药物药代动力学信息,如成药相似性(DL),口服生物利用度(OB),血脑屏障(BBB),肠上皮通透性(Caco-2) ,脂水分配系数(ALogP)和H键供体/受体(Hdon / Hacc)的数量。

结果如下
复制网页
保存到表格当中
整理成三线表
本文参与 腾讯云自媒体分享计划,分享自作者个人站点/博客。
如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

本文分享自 作者个人站点/博客 前往查看

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

本文参与 腾讯云自媒体分享计划  ,欢迎热爱写作的你一起参与!

评论
登录后参与评论
0 条评论
热度
最新
推荐阅读
目录
  • 原文叙述:
  • 步骤
    • 结果如下
      • 复制网页
        • 保存到表格当中
          • 整理成三线表
          相关产品与服务
          数据库
          云数据库为企业提供了完善的关系型数据库、非关系型数据库、分析型数据库和数据库生态工具。您可以通过产品选择和组合搭建,轻松实现高可靠、高可用性、高性能等数据库需求。云数据库服务也可大幅减少您的运维工作量,更专注于业务发展,让企业一站式享受数据上云及分布式架构的技术红利!
          领券
          问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档