专栏首页医学数据库百科肿瘤转移相关lncRNA数据库

肿瘤转移相关lncRNA数据库

1.写在前面

实验验证的数据库数据库其实和综述差不多。综述是基于一个主题检索相关文献,然后利用文字来进行来进行总结出这些文献的相关特点。而这类经过实验验证的数据库,第一步也是人工来检索相关的文献。第二步则把文献当中的相关信息,通过数据库的形式来呈现出来。这样的好处是我们可以得到作者作用检索的信息。

关于实验验证的数据库,之前也介绍过几个,具体的可以查看我们第二和第三条推送。今天给大家介绍的这个数据库是一个和肿瘤转移相关的lncRNA数据库: LncR2metasta(http://lncr2metasta.wchoda.com/)

2.数据库使用

这个数据库提供了两种可以使用的方法:

  • 浏览模式:在这个模块下,我们可以浏览数据库某一个方面的所有信息。
  • 检索模式:如果我们有目标的lncRNA,我们可以直接的进行检索

下面我们就简单的介绍一下这两个功能。

2.1 浏览模式

在浏览模式下,我们可以对基于lncRNA的类型或者肿瘤转移事件来进行检索。例如,假如我们想要查看肿瘤细胞侵袭相关的lncRNA。

在这一部分,我们可以看到关于这一分类的基本描述,和数据库拿到的lncRNA。

在和这一分类相关的lncRNA当中,我们可以看到lncRNA的基因名;相关研究的肿瘤以及lncRNA在不同数据库当中的ID号。进一步的,我们可以点击lncRNA的基因名,就可以看到具体的文献当中的描述了。在这一部分,我们可以看到关于这个基因在实验当中的信息包括:实验相关的信息;作用的基因以及文献当中的简单描述等等。

2.2 检索模式

如果我们有想要检索的lncRNA,那就可以这个模式下检索了。我们需要做的,就是:i)选择肿瘤转移事件; ii) lncRNA 类型;iii)输入想要检索的lncRNA。

例如我们这里输入:H19

同样的,结果也是以表格形式呈现的,我们点击相关的lncRNA。也是可以看到具体的文章信息。

3. 数据库使用场景

以上是数据库的基本使用方法,除了基本的使用场景。我们这里也提供几个想到的,可能用到的实验场景。

  1. 当我们在进行生信分析的时候,经常会得到很多的转移相关的lncRNA。如果我们想要找一个lncRNA进行下游实验的时候,那创新性还是要考虑的。肯定找一个没做过的最好的。这个时候,我们就可以使用这个数据库查一下我们获得的lncRNA是否有人做过。
  2. 假如我们在分析的时候,寻找到了几个肿瘤转移相关的lncRNA。那我们讨论的时候肯定要进行相关的介绍的。一般的讨论也是基于之前的文献进行讨论的,这个时候我们就可以使用这个数据库检索一下。如果有信息,那就可以利用数据库当中的描述了。

4. 写在后面

以上就是数据库的基本使用了,另外数据库提供了下载功能。我们可以把数据库当中的所有数据下载下来。下载的表格当中,包括的信息还是挺全的。这样方便我们批量的进行检索。

本文分享自微信公众号 - 数据库百科(yxkygjx),作者:Hogg

原文出处及转载信息见文内详细说明,如有侵权,请联系 yunjia_community@tencent.com 删除。

原始发表时间:2020-08-24

本文参与腾讯云自媒体分享计划,欢迎正在阅读的你也加入,一起分享。

我来说两句

0 条评论
登录 后参与评论

相关文章

  • 航母级miRNA数据库

    前几天有小伙伴问关于 miRNA 的数据库,由于 miRNA 相关的数据库太多了,要是分开介绍的话估计要好久好久。幸好,有人已经把 miRNA 相关的数据库整理...

    医学数据库百科
  • m6A数据库总体评价介绍

    通过对昨天检索到的的20个得到的数据库进行整理总结,我们发现一共有19个是和m6A相关(没有关系是因为在摘要当中也提到了m6A,所以我们也就提取到了),在19个...

    医学数据库百科
  • 五月份在线数据库发表汇总(截止05.21)

    由于每个月都会有相关的数据库文章发表,所以我们打算在每个月都会先出一个汇总贴来介绍一下这个月都发表了哪些在线的数据库。之后也会挑选我们自己感兴趣的一些数据库来详...

    医学数据库百科
  • 还在用SELECT COUNT统计数据库表的行数?Out了

    在ABAP里我们如果想用代码获得一个数据库表里有多少条记录,常规做法是使用SELECT COUNT。

    Jerry Wang
  • 云计算数据库迁移需要避免的10个错误

    数据库专家Chris Foot分享了IT团队在进行云计算数据库迁移时通常会遇到的十个疏忽和错误,并为此提供了如何避免这些错误的建议。

    静一
  • 数据库漏洞扫描系统

    中安威士数据库漏洞扫描系统是在综合分析了数据库访问控制、数据库审计、资源管理、数据库加密以及数据库系统本身安全机制的基础上,深入研究了数据库系统本身存在的BU...

    数据库保护
  • Day1 | 认识MySQL

    终端输入mysql,发现提示command not found,需要先设置环境路径;

    DataScience
  • Vc数据库编程基础1

        数据库简单连接就是存储数据的容器. 而库则是一组容器合成的东西. 也就是存储数据的.我们编程中常常会用到数据库.

    IBinary
  • 如何为微服务选择数据库

    作者 | Jeff Carpenter, InfoWorld 翻译 | Jackyrong 你的微服务架构需要多种数据模型。你是应该选择混合持久化呢还是多模型数...

    CSDN技术头条
  • 哥哥面前一条弯弯的河 --「JDBC」连接数据库

    阿凯

扫码关注云+社区

领取腾讯云代金券