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R语言列筛选的方法--select

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邓飞
发布2022-02-09 09:48:02
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发布2022-02-09 09:48:02
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文章被收录于专栏:育种数据分析之放飞自我

大家好,我是飞哥呀。

我们知道,R语言学习,80%的时间都是在清洗数据,而选择合适的数据进行分析和处理也至关重要,如何选择合适的列进行分析,你知道几种方法?

如何优雅高效的选择合适的列,让我们一起来看一下吧。

1. 数据描述

数据来源是我编写的R包learnasreml中的fm数据集。

代码语言:javascript
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r$> library(learnasreml)

r$> data(fm)

r$> head(fm)

「我们的目的:」

❝提取fm的TreeID,Rep,dj,dm,h3,并重命名为:ID, F1, y1 , y2, y3 ❞

2. 使用R语言默认的方法:列选择

这一种,当然是简单粗暴的方法,想要哪一列,就把相关的列号提取出来,形成一个向量,进行操作即可。比如

代码语言:javascript
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r$> d1 = fm[,c(1,3,6,7,11)]

r$> head(d1)
  TreeID Rep    dj    dm  h3
1  80001   1 0.334 0.405 239
2  80002   1 0.348 0.393 242
3  80004   1 0.354 0.429 180
4  80005   1 0.335 0.408 301
5  80008   1 0.322 0.372 271
6  80026   1 0.359 0.450 258

r$> names(d1) = c("ID","F1","y1","y2","y3")

r$> head(d1)

结果:

「缺点:」

这种方法,需要找到性状所在的列号,然后还要重命名,比较麻烦。

而且,后面如果想要根据列的特征进行提取时(比如以h开头的列,比如属性为数字或者因子的列等等),就不能实现了。

这就要用到tidyverse的函数了,selectrename,都是一等一的良将。

3. tidyverse的rename函数

代码:

代码语言:javascript
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a2 = fm %>% rename(ID=TreeID, F1 = Rep, y1 = dj, y2 = dm, y3 = h3)

这里,rename只是单独的修改名称,并没有提取出来。

还要使用select进一步的提取:

4. tidyverse的select函数

如果使用select函数,一行代码就可以搞定:

代码语言:javascript
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a1 = fm %>% select(ID=TreeID, F1 = Rep, y1 = dj, y2 = dm, y3 = h3)

5. select函数注意事项

「常见的坑:」

❝注意,MASS包中也有select函数,而且优先级更高,如果你载入了MASS包,select就不能使用了。 ❞

哪怕你再次载入tidyverse包,也不行:

载入dplyr包,也不行:

「MASS就是这么豪横。」

像这种情况,解决办法有两种:

5.1 绝对引用函数

即使用select时,要用dplyr::select

代码语言:javascript
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a3 = a2 %>% dplyr::select(ID,F1,y1,y2,y3)

这样也比较麻烦。

5.2 放到环境变量中

「推荐的方法:」

代码语言:javascript
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r$> select = dplyr::select

r$> a3 = a2 %>% select(ID,F1,y1,y2,y3)

推荐在载入包时,将下面代码放在开头,就可以肆无忌惮的应用select了,毕竟,环境变量的优先级是第一位的。

代码语言:javascript
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library(tidyverse)
select = dplyr::select

6. 提取h开头的列

这里,用starts_with,会匹配开头为h的列。

其它还有contains,匹配包含的字符,还有end_with,匹配结尾的字符。

应有尽有,无所不有。

代码语言:javascript
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re1 = fm %>% select(starts_with("h"))

7. 提取因子和数字的列

「匹配数字的列:」

代码语言:javascript
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re2 = fm %>% select_if(is.numeric)

「匹配为因子的列:」

代码语言:javascript
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re3 = fm %>% select_if(is.factor)

同志们,你学会了吗?

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原始发表:2022-01-20,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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目录
  • 1. 数据描述
  • 2. 使用R语言默认的方法:列选择
  • 3. tidyverse的rename函数
  • 4. tidyverse的select函数
  • 5. select函数注意事项
    • 5.1 绝对引用函数
      • 5.2 放到环境变量中
      • 6. 提取h开头的列
      • 7. 提取因子和数字的列
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