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生化小课 | 氨基酸可以作为酸和碱

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尐尐呅
发布2023-09-06 14:44:22
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发布2023-09-06 14:44:22
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文章被收录于专栏:国家基因库生命大数据平台

医学生:生理生化 必有一挂

生科/生技:生化书是我见过最厚的教材

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生化小课

—— 期末/考研 逢考必过——

氨基酸可以作为酸和碱

氨基酸的氨基和羧基,以及某些氨基酸的可电离R基团,起到弱酸和弱碱的作用。当缺乏可电离 R 基团的氨基酸在中性 pH 值下溶解在水中时,α-氨基和羧基形成偶极离子或两性离子(德语为“杂化离子”),它既可以作为酸也可以作为碱(图3-9)。具有这种双重(酸碱)性质的物质是两性的,通常称为两性电解质(来源于“两性电解质”)。一种简单的单氨基单羧酸α-氨基酸,如丙氨酸,在完全质子化时为二元酸;它有两个基团,-COOH基团和-NH+3基团,可以产生质子:

酸碱滴定包括逐步添加或去除质子(第2章)。图3-10显示了甘氨酸二质子形式的滴定曲线。甘氨酸的两个可电离基团,羧基和氨基,用强碱如NaOH滴定。该图有两个不同的阶段,对应于甘氨酸上两个不同基团的去质子化。这两个阶段中的每一个在形状上都类似于单质子酸(如乙酸)的滴定曲线(见图2-16),并且可以以相同的方式进行分析。在非常低的pH值下,甘氨酸的主要离子种类是完全质子化的形式,+H3N−CH2-COOH。

在滴定的第一阶段,甘氨酸的-COOH基团(pKa较低)失去质子。在这一阶段的中点,存在等摩尔浓度的质子供体(+H3N-CH2-COOH)和质子受体(+H3N-CH2-COOO−)物种。与任何弱酸的滴定一样,在pH值等于被滴定质子化基团pKa的中点处达到拐点(见图2-17)。对于甘氨酸,中点的pH值为2.34;因此其-COOH基团的pKa(图3-10中标记为pK1)为2.34。(从第2章中回忆,pH和pKa分别是质子浓度和电离平衡常数的简便符号。pKa是一个基团放弃质子趋势的量度,随着pKa增加一个单位,该趋势降低10倍。)随着甘氨酸的滴定进行,pH 5.97达到另一个拐点;此时,第一个质子的移除基本上已经完成,第二个质子的去除才刚刚开始。在此pH值下,甘氨酸主要以偶极离子(两性离子)+H3N-CH2-COO-的形式存在。我们将很快回到滴定曲线中该拐点的意义(图3-10中标记为pI)。

滴定的第二阶段对应于从甘氨酸的-NH+3基团中除去一个质子。该阶段中点的pH值为9.60,等于-NH+3基团的pKa(图3-10中标记为pK2)。滴定基本上在约12的pH下完成,此时甘氨酸的主要形式为H2N-CH2-COO-。

从甘氨酸的滴定曲线,我们可以得到几个重要的信息。首先,它给出了两个电离基团中每一个的pKa的定量测量:-COOH基团为2.34,-NH+3基团为9.60。注意,甘氨酸的羧基比乙酸的羧基酸性(更容易电离)高100倍以上,正如我们在第2章中所看到的,乙酸的羧基的pKa为4.76,约为与未取代的脂族烃相连的羧基的平均值。甘氨酸的扰动pKa主要是由α-碳原子上的附近带正电的氨基引起的,这是一个电负性基团,倾向于将电子拉向它(一个称为电子撤回的过程),如图3-11所示。所得两性离子上的相反电荷也在一定程度上稳定。类似地,甘氨酸中氨基的pKa相对于氨基的平均pKa被向下扰动。这种效应主要是由于羧基中的电负性氧原子的电子吸收,增加了氨基放弃质子的倾向。因此,α-氨基的pKa低于脂族胺,如甲胺(图3-11)。简而言之,任何官能团的pKa都受到其化学环境的极大影响,这一现象有时在酶的活性位点中被利用,以促进精细适应的反应机制,这取决于特定残基的质子供体/受体基团的扰动pKa值。

甘氨酸滴定曲线提供的第二条信息是,这种氨基酸具有两个缓冲能力区域。其中之一是曲线的相对平坦部分,在2.34的第一个pKa的任一侧延伸约1个pH单位,表明甘氨酸在该pH附近是良好的缓冲液。另一个缓冲区位于pH 9.60附近。(注意,甘氨酸在细胞内液体或血液的pH值约为7.4时不是很好的缓冲液。)在甘氨酸的缓冲范围内,Henderson-Hasselbalch方程可用于计算在给定pH下制作缓冲液所需的甘氨酸的质子供体和质子受体物种的比例。

从氨基酸的滴定曲线得出的最后一条重要信息是其净电荷与溶液pH值之间的关系。在pH 5.97(滴定曲线中两个阶段之间的拐点)时,甘氨酸主要以偶极形式存在,完全电离但没有净电荷(图3-10)。净电荷为零时的特征pH值称为等电点或等电pH,称为pI。对于侧链中没有可电离基团的甘氨酸,等电点只是两个pKa值的算术平均值:

如图3-10所示,甘氨酸在高于其pI的任何pH值下都具有净负电荷,因此当置于电场中时会向正极(阳极)移动。在低于其pI的任何pH值下,甘氨酸具有净正电荷,并将向负电极(阴极)移动。甘氨酸溶液的pH值离其等电点越远,甘氨酸分子群的净电荷就越大。例如,在pH 1.0时,甘氨酸几乎完全以+H3N-CH2-COOH的形式存在,净正电荷为1.0。在pH 2.34时,当+H3N-CH2-COOH和+H3N-CH2-COO−等量混合,平均或净正电荷为0.5。在任何pH值下,任何氨基酸的净电荷的符号和大小都可以用同样的方法来预测。

Principles of Biochemistry

本栏目信息及图片均来源于Lehninger Principles of Biochemistry 第八版,其中文字信息为英文原版的小编翻译/整理版,仅供学习交流使用,欢迎在留言区或私信听课君提供宝贵意见,如有侵权请联系删除。

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原始发表:2023-03-24,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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