conda下载multiqc出现报错+conda配置镜像+R语言环境修改
原创conda下载multiqc出现报错+conda配置镜像+R语言环境修改
原创
素素
修改于 2023-10-20 16:09:33
修改于 2023-10-20 16:09:33
文章被收录于专栏：生信课程note＋实验知识
一、conda下载multiqc出现报错
1.在fastqc环境中下载multiqc
conda install -c bioconda multiqc python=32.出现报错”RuntimeError: Click will abort further execution because Python 3 was configured to use ASCII as encoding for the environment
解决方法：
每次运行前设置编码环境变量
export LC_ALL=en_US.utf-8
export LANG=en_US.utf-8二、Conda环境配置国内镜像源
- 阿里云
conda config --add channels https://mirrors.aliyun.com/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.aliyun.com/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.aliyun.com/anaconda/cloud/bioconda/2.北京外国语大学
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/3.清华大学
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/4.西安交通大学
conda config --add channels https://mirrors.xjtu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.xjtu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.xjtu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/删除镜像
conda config --remove channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/查看镜像
conda config --show channels三、R语言不同版本切换
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原创声明：本文系作者授权腾讯云开发者社区发表，未经许可，不得转载。
如有侵权，请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。
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