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生信宝典

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可视化之为什么要使用箱线图?
NGS系列文章包括NGS基础、高颜值在线绘图和分析、转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析 (重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘(典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step))、批次效应处理等内容。
生信宝典
2020-10-30
2.3K0
R包reshape2 |轻松实现长、宽数据表格转换
https://seananderson.ca/2013/10/19/reshape/
生信宝典
2019-10-24
10.3K0
赠你一只金色的眼 - 富集分析和表达数据可视化
GOplot包用于生物数据的可视化。更确切地说,该包将表达数据与功能分析的结果整合并进行可视化。但是要注意该包不能用于执行这些分析,只能把分析结果进行可视化。在所有科学领域,由于空间限制和结果所需的简洁性,切实地去描述事物很难,所以需要将信息进行可视化,使用图片来传达信息。精心设计的图形能在更小的空间提供更多的信息。该包的设想就是能让用户快速检查大量数据,揭示数据的趋势和找出数据中的模式和相关性。
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2019-07-24
1.2K0
生信软件系列 - NCBI使用
做生物研究的对NCBI都不陌生,网站资源、软件丰富,也在不停地迭代更新,越来越容易使用。本文是较早时用于内部培训的资料,最近翻出来看下,还是有一些有意思的点在里面,故分享出来,供大家评阅。
生信宝典
2019-05-09
1.4K1
12个ggplot2扩展包帮你实现更强大的可视化
ggplot2自从2007年推出以来,成为世界范围内下载最频繁、使用最广泛的R包之一。许多人包括ggplot2的创建人Hadley Wickham将这一成功归功于ggplot2背后的哲学。这个软件包的灵感来源于Leland Wilkinson编写的《图形语法》一书,在此书中将graphs 分解成scales和layers,并将原始数据与表现形式分离开。
生信宝典
2018-12-25
2.9K0
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