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没想到自己会放弃conda(docker镜像的pyscenic做单细胞转录因子分析)
python
容器镜像服务
容器
不过,我使用了docker镜像的pyscenic,所以绕过了这个报错!那,我们现在演练一下如何使用docker镜像的pyscenic吧!
生信技能树
2021-07-29
1.9K
0
生物信息学流程框架的4个流派
容器镜像服务
数据分析
容器
https
比如Nextflow、Snakemake等等,这方面的各种教程多如牛毛,我这里就不赘述了,大家根据关键词搜索即可自行学习。
生信技能树
2020-12-17
1.5K
0
什么,ENA和SRA数据库存放的单细胞转录组测序数据并不一致啊?
容器镜像服务
容器
python
但是这个两年前的系列笔记是基于V2,V3版本的cellranger,目前呢它更新到了版本4,建议大家以最新版教程为准,在《生信技能树》:cellranger更新到4啦(全新使用教程)
生信技能树
2020-11-11
2.8K
0
服务器被关机,不妨试试看用你的Mac电脑跑NGS流程
https
网络安全
tcp/ip
数据分析
容器镜像服务
现在我就分享一下我自己mac电脑的conda等生物信息学环境配置,提高大家的生产力!
生信技能树
2020-04-14
1.4K
0
没有docker我真的不想动这样的生信软件
容器镜像服务
c 语言
数据库
sql
打包
最开始开发者都是C语言流派, 所以标准的源代码安装三部曲即可,即使 configure+make+ make install 来安装
生信技能树
2020-03-26
999
0
代码海洋-你想模仿的这里都有啊
容器
容器镜像服务
docker我们讲解很多次了,具体大家可以浏览我在在生信技能树上面写过部分docker教程, 目录如下:
生信技能树
2019-12-23
1.6K
0
如何从看不懂Dockerfile到创建自己的镜像
容器镜像服务
容器
bash
开始了解Docker是健明的一篇文章跟着jimmy学docker系列之第2讲:一个软件一个容器,那时正在研究虚拟机(Virtual Machine),发现Docker更适合现在的需求,就从基本概念和操作命令开始学习。前期顺风顺水直到看了胡博士的文章,对其Dockerfile的内容有很多不理解,后来明白Docker并不是单一独立的存在,你想要创建的镜像集成了所需的环境、软件、数据库以及脚本等,是生信处理能力的综合性体现。
生信技能树
2019-03-07
2.7K
0
用Modules优雅地管理服务器的环境变量
gcc
linux
bash
容器镜像服务
git
在我管理的基因组学群里,今天有人提出了这样一个问题,如果有多个版本的BLAST,并且都是用conda安装,应该如何调用不同版本的BLAST
生信技能树
2018-12-07
1.9K
0
Docker应用之一键化安装Wordpress(无需代码基础)
容器镜像服务
wordpress
php
云数据库 SQL Server
数据库
WordPress是使用PHP语言开发的博客平台,用户可以在支持PHP和MySQL数据库的服务器上架设属于自己的网站。
生信技能树
2018-11-08
1.7K
0
跟着jimmy学docker系列之第3讲:为何不创建自己的docker容器呢?
容器镜像服务
容器
ubuntu
.net
前面我们说到,在docker仓库下载的那个容器是错误的,因为它配置的Ubuntu库文件不够,所以我更新了,形成了自己的容器
生信技能树
2018-10-25
547
0
跟着jimmy学docker系列之第2讲:一个软件一个容器
容器镜像服务
容器
ubuntu
git
✎✎✎ 回过头来看当初在生信技能树发布的docker教程已经是2017-07-07的事情了,那是一个好日子?: 我学会docker啦!希望你也可以学会 其实当时只是为了写教程而学习
生信技能树
2018-10-25
1K
0
没有更多了
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