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育种数据分析之放飞自我

生物统计, 数量遗传学, GWAS, GS
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351
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569052
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80
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GCTA学习6 | GCTA计算GRM矩阵(G矩阵)
GRM矩阵,全称:genetic relationship matrix (GRM)。
邓飞
2022-02-09
1.3K1
1.5w字的Rmarkdown入门教程汇总
Rmarkdown 是 R 语言环境中提供的 markdown 编辑工具,运用 rmarkdown 撰写文章,既可以像一般的 markdown 编辑器一样编辑文本,也可以在 rmarkdown 中插入代码块,并将代码运行结果输出在 markdown 里。R Markdown 格式,简称为 Rmd 格式, 相应的源文件扩展名为.Rmd。输出格式可以是 HTML、docx、pdf、beamer 等。
邓飞
2021-04-22
8.9K0
育种数据分析中的遗传相关及其显著性的计算
3. 软件实现遗传相关计算 3.1 数据格式 前三列是系谱,有3个性状: y1, y2, y3 , 想要计算y1和y3的遗传相关,并用LRT检验显著性
邓飞
2021-03-30
2.3K0
PCA分析的方方面面
今天做PCA分析时,发现了这个ggord包,绘图很给力。利用官方的文档,学习一下。这其中,我又将PCA相关的分析方法和作图汇总了一下:
邓飞
2021-03-30
1.6K0
如何检测遗传相关的显著性:LRT检验操作方法
3. 软件实现遗传相关计算 3.1 数据格式 前三列是系谱,有3个性状: y1, y2, y3 , 想要计算y1和y3的遗传相关,并用LRT检验显著性
邓飞
2019-09-17
1.4K0
如何在RStudio进行python编程
新版本的Rstudio, 需要R包:reticulate在1.10以上, 如果是1.09会报错, 而如果你的R是microsoftR是老版本的话, CRAN不是默认的镜像, 安装不成1.10版本. 解决方法: 使用github安装:
邓飞
2019-06-13
2.4K0
如何高效的在服务器和本地进行上传和下载文件
昨天, 师弟告诉我可以在xshell中使用sz进行下载, 想要上传的话用rz就行了. 然后我竟然没有听过. 学习最好的方法就是写一篇博客, 比如这篇.
邓飞
2019-06-13
3.6K0
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