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TCGA数据挖掘(四):表达差异分析(4)
数据挖掘
在之前我们的文章:TCGA数据挖掘(三):表达差异分析中,我们利用的是TCGAbiolinks包中的TCGAanalyze_DEA函数进行差异表达分析,我们也提到可以选择基于limma或edgeR包进行分析,TCGA数据挖掘(三):表达差异分析这一讲中我们利用的是edgeR包,之后我们在文章:TCGA数据挖掘(四):表达差异分析(2)和TCGA数据挖掘(四):表达差异分析(3)中分别也介绍了其他方法的差异分析,包括edgeR和DESeq包,今天这一讲,我们就利用TCGAbiolinks包中的TCGAanalyze_DEA函数基于limma包进行差异分析。
DoubleHelix
2019-09-18
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