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组间差异分析就要这样可视化！
腾讯云开发者社区
在之前的文章中，我们分享了多个基因差异分析的可视化，使用的是ggpubr这个R包，ggpubr在标记p值时，可以根据指定的差异分组自动添加组间的连线，非常方便，但是无法指定添加的p值的位置，在某些时候会缺乏灵活性，今天要介绍的是另外一个R包ggsignif，其帮助手册链接如下
生信修炼手册
2022-06-09
459
0
文献阅读：NAD+代谢相关基因在肌萎缩侧索硬化症中的预后研究
腾讯云开发者社区
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fcell.2022.831273/full
生信修炼手册
2022-03-14
407
0
circos 可视化手册-line plot 篇
腾讯云开发者社区
在直线图中，会看到如下所示的分割线，max_gap的作用就是设置分割线的间距，max_gap = 1u 代表每隔1个单位画一条分割线，其用法和ticks类似
生信修炼手册
2020-05-11
767
0
peak差异分析的工具那么多，如何选择？
腾讯云开发者社区
tcp/ip
对于ATAC_seq, chip_seq等抗体富集型文库而言，peak calling是分析的第一步。通过peak calling,可以得到抗体富集的区域，这些区域有对应的生物学功能，在chip_seq中，可以是转录因子结合区或者发生组蛋白修饰的区域，ATAC中对应的就是开放染色质区域。
生信修炼手册
2020-05-07
3.7K
0
玩转基因组浏览器之查看gwas结果
腾讯云开发者社区
对列的顺序没有要求，IGV通过文件名后缀来识别文件格式，gwas结果对应的后缀可以是以下几种
生信修炼手册
2020-05-07
1.1K
0
解密ATAC中的测序饱和度分析
android
腾讯云开发者社区
linux
html
测序数据量对于NGS数据分析是非常重要的，测序数据量过低，不能有效覆盖基因组完整信息，测序数据量过高，则会造成冗余，不够经济。为了验证当前测序量能否满足需求，或者说加大测序量是否能够进一步挖掘的更大量的信息，通常需要进行饱和度分析。
生信修炼手册
2020-05-07
1.8K
0
Hi-C Data Browser:Hi-C数据浏览器
腾讯云开发者社区
Lieberman-Aiden等人利用Hi-C技术研究了人淋巴母细胞的三维结构，首次提出了A/B compartment的概念，文章发表在science上，标题如下
生信修炼手册
2019-12-19
758
0
A/B compartment:染色质区室简介
腾讯云开发者社区
Hi-C技术的出现推动了三维基因组学的发展，利用Hi-C技术，科学家不仅证实了染色质疆域的存在，而且进一步发现了更多染色质的三维特征。
生信修炼手册
2019-12-19
4.1K
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