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生信修炼手册

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python中文件目录操作的常见方法
在实际开发中,除了掌握文件读写的基本操作,还需要熟练地对文件和目录进行操作,比如创建目录,判断文件是否存在等等, 在os和os.path这两个内置模块中,提供了基本的操作方法。首先来看下os.path提供的几个常用功能
生信修炼手册
2020-05-11
4580
python中数值相关的操作
最后一个函数比较特殊,ord函数根据ASCII码将单个字符转换为数值,与之相对,chr函数可以将数值转换为ASCII编码的字符。
生信修炼手册
2020-05-07
1.2K0
使用UPORA对peak进行注释
UROPA是一个命令行工具,可以对基因组区域进行注释,这里的基因组区域要求是BED格式,比如chip,ATAC_seq等数据产生的peak区间。同时需要提供一个GTF格式的基因组注释信息,比如从UCSC,ensemble,ncbi等数据库下载的参考基因组文件。在注释结果中不仅给出了peak在基因组中的定位,还会给出对应的正负链,与基因的距离,对应的基因类型等较为全面的注释信息。官方文档网址如下
生信修炼手册
2019-12-19
6780
GWAS中的Gene-Gene Interactions如何分析?看这里
在遗传学中,当两个基因相互作用然后导致对应性状的出现,说明两个基因间存在相互作用。在之前的文章中,介绍了很多的基因相互作用模型,列表如下
生信修炼手册
2019-12-19
8700
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