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小明的数据分析笔记本

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了解学习高通量测序技术(NGS)神器SequencEnG:66种高通量测序技术全介绍
SequencEnG 是一个在线的平台,对应的链接是http://education.knoweng.org/sequenceng/#
用户7010445
2023-01-06
4160
跟着Nature Communications学作图:R语言ggplot2散点加误差线展示响应比(Response ratio)
https://www.nature.com/articles/s41467-020-16881-7#Sec15
用户7010445
2023-01-06
5240
使用jellyfish软件利用二代测序数据估计基因组大小
https://bioinformatics.uconn.edu/genome-size-estimation-tutorial/
用户7010445
2022-04-08
1.2K0
使用blastn鉴定lncRNA中可能是miRNA前体的序列
最近在看植物长链非编码RNA的论文,其中一个分析步骤是鉴定lncRNA中可能是属于miRNA前体的序列
用户7010445
2021-07-12
5670
跟着Nature Genetics 学画图:R语言ggplot2画地图并且叠加饼状图的简单小例子
The world map was constructed using the R package ggplot2 with the Natural Earth dataset.
用户7010445
2021-05-07
1.5K0
R语言典型相关分析(Canonical Correlation analysis, CCA)的一些参考资料
以上图片出自教程http://my.ilstu.edu/~wjschne/444/CanonicalCorrelation.html#(4)
用户7010445
2021-03-15
3.4K0
R语言ggplot2两个离散变量画热图的简单小例子
数据集下载链接 http://userweb.eng.gla.ac.uk/umer.ijaz/bioinformatics/ecological/SPE_pitlatrine.csv
用户7010445
2021-03-15
1.2K0
ggplot2画点和连线展示主成分分析的结果简单小例子
https://github.com/Tom-Jenkins/utility_scripts
用户7010445
2021-03-14
1.2K0
跟着Nature Genetics学数据分析~SNP数据计算距离矩阵然后构建NJ树
工具对应的github主页 https://github.com/BGI-shenzhen/VCF2Dis
用户7010445
2021-01-20
4.4K1
R语言ggtree画圆形的树状图展示聚类分析的结果
那么圆形的树状图如何实现呢?我查找了一下相关资料。R语言包dendextend这个包可以实现,利用help(package="dendextend")查看帮助文档,能够看到其中的一个小例子
用户7010445
2020-11-13
3K0
R语言做正态性检验的一个小例子
R语言里做做正态性检验通常用到的函数是shaporo.test(),这个是叫Shapiro-Wilk(夏皮罗-威尔克)正态性性检验。
用户7010445
2020-10-26
3.3K0
文献笔记二十一:PhenoGram可视化染色体上的信息
这个工具的基本功能是:可视化展示某些特征在染色体上的位置,比如snp、基因等。可以看下软件官网提供的一些例子 http://visualization.ritchielab.org/phenograms/examples
用户7010445
2020-08-19
9820
JBrowse安装配置的一些教程
按照 JBrowse使用说明:如何安装JBrowse这篇教程中的步骤进行安装 用到的命令是
用户7010445
2020-07-24
1.3K0
R数据可视化简单小例子~NBA球员薪水排行榜Top10
http://www.espn.com/nba/salaries/_/year/2020
用户7010445
2020-06-10
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eggnog-mapper软件的安装配置
http://eggnogdb.embl.de/download/emapperdb-5.0.0/eggnog.db.gz http://eggnogdb.embl.de/download/emapperdb-5.0.0/eggnog_proteins.dmnd.gz
用户7010445
2020-04-01
3K0
Django2.2帮助文档的第一个例子:一个简易的投票系统—Prat3_4
https://docs.djangoproject.com/en/2.2/intro/tutorial01/
用户7010445
2020-03-06
5380
Django2.2帮助文档的第一个例子:一个简易的投票系统—Prat1_2
https://docs.djangoproject.com/en/2.2/intro/tutorial01/
用户7010445
2020-03-03
5180
R语言网络图的一个小例子
http://www.kateto.net/wordpress/wp-content/uploads/2019/06/sunbelt2019.zip
用户7010445
2020-03-03
6950
南京林业大学正版win10系统安装
我安装 windows10 系统 软件下载地址 https://net.njfu.edu.cn/c10/index.html 下载iso文件 使用UltralSO软件制作U盘启动盘 UltralSO软件下载地址 大家可以自行在网上搜索 或者在我的公众号小明的数据分析笔记本留言 制作U盘启动盘的步骤https://blog.csdn.net/yinjun151/article/details/50909731 我自己的电脑是华硕Y581c,开机后选择U盘启动是按esc键,大家可以根据自己
用户7010445
2020-03-03
8760
文献笔记五十六:武汉新型冠状病毒的进化分析
论文中的进化分析用到了64条冠状病毒的全基因组序列 其中有6条是武汉新型冠状病毒基因组序列
用户7010445
2020-03-03
7370
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