除了函数,减少重复代码的另一种工具是迭代,它的作用在于可以对多个输入执行同一种处理,比如对多个列或多个数据集进行同样的操作。
在R中更易于处理的数据形式是data.frame,list并不是太好处理,常用操作就是对它进行循环迭代。
semi_join anti_join实际上没有发生过两个数据框的连接,其实是对左边的数据框取子集
很多人推荐《R语言实战》这本书来入门R,当然,这本书非常不错,我也是通过这本书开始接触的R。这种入门的学习路径属于base R first,学习的流程基本是先了解变量的类型、数据的结构,再深入点就会学到循环与自定义函数。有些类似于先认识编程,再按照数据处理、可视化、统计分析等应用方向开始下一个学习的旅程。
step1 对matrix进行转置:使gene名变为列名,将样本名转化为data.frame中的第一列
-(3)注意:之前提到过,矩阵的某一列不能单独转换数据类型,需要把矩阵转换成数据框再转换某列的数据类型;或者把这列单独提取出来再转换其数据类型;
tidyverse就是Hadley Wickham将自己所写的包整理成了一整套数据处理的方法,包括ggplot2、dplyr、tidyr、readr、purrr、tibble、stringr、forcats。出版有《R for Data Science》(中文版《R数据科学》),这本书详细介绍了tidyverse的使用方法。
通常 dplyr 和 R 更适合对列进行操作,而对行操作则显得更麻烦。这篇文章,我们将学习围绕rowwise() 创建的 row-wise 数据框的 dplyr 操作方法。
假设数据以 tibble 格式保存。数据集如果用于统计与绘图,需要满足一定的格式要求,(Wickham, 2014) 称之为 整洁数据 (tidy data),基本要求是每行一个观测,每列一个变量,每个单元格恰好有一个数据值。这些变量应该是真正的属性,而不是同一属性在不同年、月等时间的值分别放到单独的列。
数据框函数- 排序arrange()和desc参数、distinct()去重复、mutate()数据框新增列
一、玩转字符串 stringr包 图片 1.str_length() 检测字符串长度 x <- "The birch canoe slid on the smooth planks." x ### 1.检测字符串长度 str_length(x) #计算字符串中有多少字符 length(x) #计算向量中元素的个数 图片 图片 2. str_split 字符串拆分 x <- "The birch canoe slid on the smooth planks." x ### 2.字符串拆分 str_sp
专题一:玩转字符串1.检测字符串长度x <- "The birch canoe slid on the smooth planks."xstr_length(x)#检测字符串内的字符数,空格也算length(x)#向量里面元素的个数2.字符串拆分str_split(x," ")#以空格为分隔符号将字符串拆分开x2 = str_split(x," ")[[1]];x2y = c("jimmy 150","nicker 140","tony 152")str_split(y," ")str_split(y,"
是用于清洗数据的工具,如dplyr一样,其中每一列都是变量,每一行都是观察值,并且每个单元格都包含一个值。 “ tidyr”包含用于更改数据集的形状(旋转)和层次结构(嵌套和“取消嵌套”),将深度嵌套的列表转换为矩形数据框(“矩形”)以及从字符串列中提取值的工具。它还包括用于处理缺失值(隐式和显式)的工具。
大家好,本文为R语言数据处理120题系列完整版本。作者精心挑选120道数据处理中相关操作以习题形式发布,一共涵盖了数据处理、计算、可视化等常用操作,并对部分题目给出了多种解法与注解。动手敲一遍代码一定会让你有所收获!
y4 <- filter(deg, a>1 & b < 0.05);table(y4)
1.字符串图片1.str_length图片x <- "The birch canoe slid on the smooth planks."x### 1.检测字符串长度str_length(x)length(x) #返回字符串的个数2.str_splitsplit返回列表,但是列表不能进行计算,对列表进行取子集### 2.字符串拆分str_split(x," ")x2 = str_split(x," ")[[1]];x2y = c("jimmy 150","nicker 140","tony 152")st
原博客简介:Predictive Hacks是与数据科学相关的在线资源中心。该博客是由一群数据科学家运营,专注于讲解在各种领域如何运用大数据技术(从机器学习和人工智能到业务领域)。
这里我使用 Schizosaccharomyces pombe 这个物种的蛋白数据做例子,搜了一下拉丁名好像是裂殖酵母。
使用rbind(),操作同cbind() 加和 colSums() 或 rowSums()
数据导入和数据整理较乏味和无聊,很容易从入门到放弃!从数据转换和可视化开始,容易看到成果,保持学习的动力。
算法设计题(10分) (1)阅读下列递归算法,写出非递归方法实现相同功能的C程序。 void test(int &sum) { int x; scanf(x); if(x=0) sum=0 el
本文精心挑选在数据处理中常见的120种操作并整理成习题发布。并且每一题同时给出Pandas与R语言解法,同时针对部分习题给出了多种方法与注解。本系列一共涵盖了数据处理、计算、可视化等常用操作,动手敲一遍代码一定会让你有所收获!
[1] "The birch canoe slid on the smooth planks."
大家在学习R语言的时候,大多参考《R语言实战》这本书,但这本书年代过于久远(中文第二版是2016年),主要着力点也是在R base上,R语言可视化的ggplot2包也只是简要介绍,而对于tidyverse包,《R语言实战》并未涉及,这也导致R语言的学习难度增加,今天我们给大家引入tidyverse包的学习。
前言 这个笔记的起因是在学习DataExplorer 包的时候,发现: 📷 这我乍一看,牛批啊。这语法还挺长见识的。 转念思考了一下🤔,其实目的也就是将数据框中的指定列转换为因子。换句话说,就是如何可以批量的对数据框的指定行或者列进行某种操作。(这里更多强调的是对原始数据框的直接操作,如果是统计计算直接找summarise 和它的小伙伴们,其他的玩意儿也各有不同,掉头左转: 34. R 数据整理(六:根据分类新增列的种种方法 1.0) 其实按照我的思路,还是惯用的循环了,对数据框的列名判断一下,如果所取的
本示例数据集很小,实际中数据量很大,可以根据使用filter()函数筛选出后续需要的“行”子集。
图片 专题1 玩转字符串 图片 检测字符串长度 代码1 str_length(x) if(!require(stringr))install.packages('stringr') library(stringr) x <- "The birch canoe slid on the smooth planks." x [1] "The birch canoe slid on the smooth planks." str_length(x) [1] 42 ### 1.检测字符串长度,包含空格和符号 le
注意默认nThread=getDTthreads(),即使用所有能用的核心,但并不是核心用的越多越好,本人亲自测试的情况下,其实单核具有较强的性能,只有在数据大于3Gb的情况下,开启10核(我的机器全部核心30多核)效率才比一个核心更高,而默认使用全部的核心效率一直非常低。因此对于不是非常巨大的文件,建议设置为1,不要使用全部核心
他认为替换不干净,应该是循环有问题。希望我们帮忙检查,我通常是懒得看其他人写的代码,所以让群里的小伙伴们有空的都尝试写一下。
上一节介绍了跟练所需的软件,R包和数据,这节开始跟练书中的第一块内容:数据可视化。
最近知乎热议:R和Python谁更优雅的问题,或者谁更适合数据分析的问题,各种讨论,非常值得一看:
首先用file.edit('~/.Rprofile')打开.Rprofile文件;然后在.Rprofile文件内添加下列两行代码
本文介绍基于R语言中的readxl包与ggplot2包,读取Excel表格文件数据,并绘制具有多个系列的柱状图、条形图的方法。
dplyr中的across函数取代了之前的xx_if/xx_at/xx_all,用法更加灵活,初学时觉得不如xx_if/xx_at/xx_all简单易懂,用习惯后真是利器!
str_detect(x,"h")##是否含有关键词h,生成与X长度相等的逻辑值向量,可用于向量取子集;
数据框的本质是一个由向量构成的列表,由于列长度相同,所以可以当做矩阵进行访问和操作。比如选择满足特定条件的行,使用[]符号,第一个参数提供一个逻辑向量,第二个参数留空。
上一课我们学习的是索引NumPy数组的具体元素,包括单个元素索引,范围元素索引以及条件元素索引。这一节课我们尝试用循环的方式,遍历数组中所有元素。考虑到常见的数组往往不止一个维度,因此while和for循环写起来很费事,所以我们有必要学习NumPy自带的遍历方法。
在tidyverse中,整洁数据一般都是每一行是一个观测,每一列是一个变量,基本上所有操作都是基于整洁的数据进行的,都是对某列做什么操作。但有时候我们也需要对某行做一些操作,dplyr中现在提供了rowwise()函数快速执行对行的操作。
4. filter 匹配对应行的数据。并生成结果。等同于subset函数。实例:
解决思路: 利用np.random.rand()函数生成随机的矩阵。 abs函数实现对矩阵中每一个元素和指定元素相减 np.argsort()函数实现找到排序后新元素在原来矩阵中的下标 利用mask函数提取矩阵中第一列的元素 最后利用for循环遍历所有的二维坐标,找到矩阵中每行中满足特定要求的数字 ---- 环境搭建准备: 需要提前下载好numpy模块。 下载示范: win+r进入运行窗口。 📷 2.输入cmd,进入命令行窗口 📷 📷 3.输入如下命令: pip install nump
博客原文:https://suzan.rbind.io/2018/01/dplyr-tutorial-1/ 作者:Suzan Baert
先前已经讲过R语言生成测试数据、数据预处理和外部数据输入等内容,但这仅仅是第一步,我们还需要对数据集进行筛选、缺失值处理等操作,以便获得可以应用于建模或者可视化的数据集(变量)。接下来就以鸢尾花测试数据集进行进一步的数据管理和筛选操作。
tibble是一种简单数据框,它对data.frame的功能进行了一些修改,更易于使用。本文将介绍tidyverse的核心R包之一——tibble包
tidyverse系列应该算是R语言数据分析中的瑞士军刀了,统一的格式,简洁的代码,管道符便于阅读的形式,都能让大家快速上手。R数据科学就是专门讲这个系列的,但是对于很多函数的用法和细节问题,都没有说,所以在使用时还是会经常遇到各种问题。
t检验相信大家应该都不陌生。不管是大学里面的数理与统计,还是研究生阶段的生物统计学,里面都会提到t检验。
tibble 是一种简单数据框,它对传统数据框的功能进行了一些修改,其所提供的简单数据框更易于在 tidyverse 中使用。
本期“大猫的R语言公众号”由“村长”供稿。村长,数据科学、指弹吉他及录音工程爱好者,浙大金融学博士在读,在data.table包和MongoDB的使用上有较多经验。
while语句,提供了编写通用循环的一种方法,而for语句是用来遍历序列对象内的元素,并对每个元素运行一个代码块。break,continue用在循环内,跳出整个循环或者跳出一次循环。 一、while循环 1、一般格式 格式:首行以及测试表达式,有一列或多列缩进语句的主体以及一个选用的else部分(控制权离开循环时而没有碰到break语句时会执行) python会一直计算开投的测试,然后执行循环主体内的语句,直到测试返回假值为止。 while <test>: <statements1> else: <statements2> 2、例子 >>> while True: ... print "Type Ctrl+C to stop!" >>> while x: ... print x, ... x=x[1:] ... diege iege ege ge e 注意 print末尾的逗号,会使所有输出都出现在同一行。 >>> a,b=0,10 >>> while a<b: ... print a, ... a+=1 ... 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 Python并没有其他语言中所谓的"do until”循环语句,不过我们可以在循环主体底部以一个测试和break来实现类似的功能。 while True: do something if exitTest():break 3、对比shell的while语句 while 命令 do 命令1 命令2 done 在系统管理时常用与逐行读取一个文件并处理。 while read line do echo $line done < /etc/rc.conf shell中还有一个类似while的循环until until 条件 do 命令1 命令2 done EG: IS_ROOT=`who |grep root` until [ "$IS_ROOT" ] do echo 'root online' sleep 2 done 二、 break continue pass和循环的else break 跳出最近所在的循环(跳出整个循环语句) continue 跳到最近所在循环的开头处(来到循环的首行,跳过本次循环) pass 什么事也不做,只是空占位语句 循环else块 只有当循环正常离开时才会执行(也就是没有碰到break语句) 1、一般循环格式 加入break和continue语句后,while循环的一般格式如下: while <test>: <statements1> if <test2>:break if <test3>:continue if <test4>:pass else: <statements2> break和continue可以出现在while(或for)循环主体的任何地方,但通常会进一步嵌套在if语句中,根据某些条件来采取对应的操作。 2、列子 pass >>> while 1:pass ... pass可用于空类,有时有指的是"以后会填上”,只是暂时用于填充函数主体而已: >>> def func1(): ... pass continue continue语句会立即跳到循环的顶端,开始下一次循环。 >>> while x: ... x=x-1 ... if x%2!=0:continue ... print x, ... 8 6 4 2 0 这个例子中,如果是奇数就返回循环顶部,不会打印.是偶数就打印。 这个下面这个结果一样 >>> while x: ... x=x-1 ... if x%2==0: ... print x, ... 8 6 4 2 0 注意这两个例子的print位置,第一个print是属于while块的,测试不通过下执行,测试通过就回到循环顶端,第二个是属于if块的,只有测试通过才打印 >>> while x: ... x=x-1 ... if x%2==0: ... print x, ...break break语句会
在《接口自动化测试框架-AIM》这篇博客中,提到了parewise算法。 这次对其进行性能优化,共3点。 一、 因为笛卡尔积和两两拆分,是有序的。 就保证了两两拆分后的每列都是相同位置的元素。 所以在
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