在使用--no-shared-fs的集群模式下的Snakemake中,可以通过设置cluster-status来进行配置。
cluster-status是Snakemake中用于检查集群作业状态的命令。它用于检查集群中正在运行的作业的状态,以确定哪些作业已经完成,哪些作业仍在运行,以及哪些作业失败。
要设置cluster-status,可以按照以下步骤进行操作:
cluster_status = "python /path/to/cluster_status.py"
将"/path/to/cluster_status.py"替换为实际的cluster_status.py脚本的路径。
通过设置cluster-status,Snakemake将使用指定的脚本来检查集群作业的状态。这样,Snakemake就能够了解哪些作业已经完成,哪些作业仍在运行,以及哪些作业失败,从而更好地管理作业的执行。
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