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Rsweep函数

函数用途 base包sweep函数是处理统计量工具,一般可以结合apply()函数来使用。...函数参数 sweep(x, MARGIN, STATS, FUN = "-", check.margin = TRUE, ...) x:即要处理原数据集 MARGIN:对行或列,或者数列其他维度进行操作...…… 下面我们结合几个具体例子来看 #创建一个4行3列矩阵 M = matrix( 1:12, ncol=3) 1.每一行都减去这一行均值 #方法一,通过rowMeans函数来计算每一行均值...sweep(M,1,rowMeans(M)) #方法二,通过apply函数来计算每一行均值,MARGIN=1,对行做操作 sweep(M,1,apply(M,1,mean)) 2.每一行列都减去这一列均值...#方法一,通过colMeans函数来计算每一列均值 sweep(M,2,colMeans(M)) #方法二,通过apply函数来计算每一列均值,MARGIN=2,对列做操作 sweep(M,2,

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R替换函数gsub

Rgsub替换函数参数如下 gsub(pattern, replacement, x, ignore.case = FALSE, perl = FALSE, fixed = FALSE,...vector举例如下: > x <- c("R Tutorial","PHP Tutorial", "HTML Tutorial") > gsub("Tutorial","Examples",x) #将...Tutorial替换成Examplers [1] "R Examples" "PHP Examples" "HTML Examples" 还有其他一些例子来灵活使用这个函数,结合正则表达式。...,我们知道组织病理分期分成stage I,stage II,stage III和stage IV四个分期 接下来我们试着把组织病理分期从四个组合并成两个组,并转换成因子 我们使用gsub函数...,并转换成因子 我们还是使用gsub函数 #删除组织病理学分期末尾A,B或者C等字母,例如Stage IIIA,Stage IIIB stage=gsub("[ABCD]$","",clin$ajcc_pathologic_stage

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RR 函数

首先构造一个函数,它有一个参数x。这个函数参数列表还包含了一个省略号,因此这个省略号将成为我们调用summary函数参数。...这有点类似于shell通过$引用相应参数。看来很多编程语言都存有相同参数传递机制。 函数属性 R包含了一系列函数用于提取函数类型对象信息。...NULL 如果我们想要在R代码函数参数列表进行操作,formals函数是一个很好工具,它会返回一个配对列表对象(对应参数名和设定默认参数值)。...注意,formals函数仅能运行在R函数上(类型为closure对象),而不能在内嵌函数(bulti-in function)上运行。...解释器将这样递归地在各个环境寻找直到找到该符号或到达全局环境。加入解释器在到达全局环境时依然没有找到var,那么R会在全局环境中指定var值为value。

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Rstack和unstack函数

我们用R做数据处理时候,经常要对数据格式进行变换。例如将数据框(dataframe)转换成列表(list),或者反过来将列表转换成数据框。...那么今天小编就给大家介绍一对R函数来实现这样功能。 这一对函数就叫做stack和unstack。从字面意思上来看就是堆叠和去堆叠,就像下面这张图展示这样。...那么R里面这两个函数具体可以实现什么样功能呢?下面这张图可以帮助大家来理解。unstack就是根据数据框第二列分组信息,将第一列数据划分到各个组,是一个去堆叠过程。...一、unstack 下面我们来看几个具体例子 例如现在我们手上有一个数据框,里面的数据来自PlantGrowth 我们可以先看看PlantGrowth 内容,第一列是重量,第二列是不同处理方式...,后面小编会使用这两个函数来给大家举个真实应用案例,敬请期待。

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Rgrep和grepl函数

在日常数据分析过程,我们经常需要在一个字符串或者字符串向量查找是否包含我们要找东西,或者向量那几个元素包含我们要查找内容。...这个时候我们会用到R中最常用两个函数,grep和grepl。...其实grep这个函数也并非是R所特有的,在linux模式匹配也用grep这个函数,前面我就给大家简单介绍过☞Linux xargs grep zgrep命令。...我们先来看看grep和grepl这两个函数用法。 这两个函数最大区别在于grep返回找到位置,grepl返回是否包含要查找内容。接下来我们结合具体例子来讲解。...☞讨论学习Rgrepl函数 参考资料: ☞Linux xargs grep zgrep命令 ☞讨论学习Rgrepl函数

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HMM模型在量化交易应用(R语言版)

函数形式:X(t+1) = f( X(t) ) HMM由来 物理信号是时变,参数也是时变,一些物理过程在一段时间内是可以用线性模型来描述,将这些线性模型在时间上连接,形成了Markov链。...既解决了短时信号描述,又解决了时变模型间转变问题。 RHmm包介绍 应用(训练样本是2007-2009年) 黑是HMM模型收益,红是基准。...HMM在波动率市场应用 输入是:ATR(平均真实波幅)、log return 用是depmixS4包 模型输出并不让人满意。 HS300测试 去除数据比较少9支,剩291支股票。...(一个模型包括:输入、样本筛选/过滤、拟合参数、拟合函数、模型参数、目标函数等等等等。这么多东西需要测试, oh my god!) 改进 这里还是只讲HMM模型吧!...同样,回撤比较大问题还是不能避免。看来需要寻找其他方式来避免大回撤。

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巧用R各种排名窗口函数

函数对比 SQL窗口函数语句中over语句中两个关键词:partition by和order by,R语言中也有与之一一对应函数: ?...1 row_number函数 R语言中row_number函数与sqlrow_number函数相同,对group_by后面字段进行分组,按照order_by后面字段排序,生成一个连续不重复编码...2 min_rank函数 R语言中min_rank函数与sqlrank函数相同,row_number函数对order_by后面字段相同记录编码是不同,min_rank就是解决这个问题,对相同记录编码相同...同样得到与sql相同输出结果: ? 4 ntile函数 R语言中ntile函数与sqlntile函数相同,把每一组分成几块,块数由参数n决定: ?...总结 简单介绍R语言中4个排名窗口函数函数名几乎与sql4个排名窗口函数一样(除了min_rank与rank),但R语言排名窗口函数输出结果与sql输出结果有点不同:R语言数据结果不改变原来数据顺序

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如何回调函数传入其他参数

如何回调函数传参数 最近写JS经常会因为回调函数传参而头疼,今天总结一下回调函数传参方法,以后应用中就不用在到处去找了。 首先构建一个需要向回调函数传入参数典型应用。...在一个页面中产生了一系列Ajax Proxy请求,传入是一个ID,根据ID返回了不同内容值,我们需要把这些内容打印在页面上,同时给页面元素赋予ID,这个时候就需要向回调函数传入ID,以产生带...这种方法在传入单个变量时没什么问题,但是当我们在一个循环结构,不断传入变量到回调函数,这个时候传入变量会采用最后一次传入变量值,这就与我们预想结果有了出入。...一种变体,你不需要显示声明一个回调函数,而是使用一个匿名函数直接进行你所需要处理。...如何回调函数传参数 总结一下:回调函数传入参数终极办法其实就是利用Closure,这个看来是唯一可行而且比较优雅方法,下面将Closure写法列在下面:      var callback

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R语言实现质谱峰量化

LC-MASS,GC-MASS等简称对于药物研发的人应该相当不陌生,但是对于它们产生数据进一步分析,反而显得心有余而力不足。今天我们给大家介绍一下R语言中是如何把质谱数据进行提取。...其中IPO主要是通过质控数据优化XCMS计算参数;XCMS主要进行质谱数据获取、校正;Rmpi主要是并行运算接口,支持多进程运算。...首先我们说明今天所有操作都是基于3.5.1版本R,因为在3.5以后版本bioconductor安装包形式有所改变,它自己开发了R包管理程序,并未R语言提供API。...我们还需要自己加上另一个分析函数: diffreport(xset,class1 =levels(sampclass(xset))[1], class2 = levels(sampclass(xset)...最后得到我们想要峰面积数据: ? ? 同时对数据进行两组之间差异分析(box)和离子图谱提取(eic): ? ? 至此质谱数据进行了量化处理,接下来就是对数据进行进一步分析。

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R语言实现非标ELISA数据量化

,因产物量与标本受检物质量直接相关,故可根据颜色反应深浅有无定性或定量分析一个过程。...那么,既然是通过颜色来定量就需要有标准曲线去作为参考,然而并不是每次都有参考曲线。此时就需要用到反曲线模型来进行评估数据最快酶反应点(PMG),得到我们量化数据。...我们今天给大家介绍一个4 参数反曲模型如何在R语言中实现,首先看下这个模型公式: [rcxmsl6clv.jpeg] 其中,f(x)是反应每个x稀释度吸光系数;a是最大吸光度,d是最小吸光度;b是在...c处斜率;c是PMG点 接下来我们需要安装包 install.packages("minpack.lm") 我们看下其中主要函数nlsLM: [urxymjg6dz.jpeg] 其中主要参数:...:模型不同项用+分隔。 :-表示从模型移除某一项,y~x-1表示从模型移除常数项 ::冒号在formula中表示交互项,也就是说两项之间存在相互作用共同决定因果关系。

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Python量化编程

在Andrew Ng>课程,多次强调了使用向量化形式进行编码,在深度学习课程,甚至给出了编程原则:尽可能避免使用for循环而采用向量化形式。...许多Numpy运算都是用C实现,相比Python循环,速度上有明显优势。所以采用向量化编程,而不是普通Python循环,最大优点是提升性能。...另外相比Python循环嵌套,采用向量化代码显得更加简洁。...总之,无论你有多长数据列表并需要对它们进行数学转换,都强烈考虑将这些Python数据结构(列表或元组或字典)转换为numpy.ndarray对象并使用固有的矢量化功能。...更多关于numpy向量化编程指导,可以参考这本开源在线书籍:From Python to Numpy )

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R概率分布函数及可视化

对此,我们可以在R调用相应概率分布函数并进行可视化,可以非常直观辅助学习。...R拥有众多概率函数,既有概率密度函数,也有概率分布函数,可以调用函数,也可以产生随机数,其使用规则如下所示: [dpqr]distribution_abbreviation() 其中前面字母为函数类型...,含义如下: d=密度函数(density) p=分布函数(distributionfunction) q=分位数函数(quantilefunction) r=生成随机数(随机偏差) distribution_abbreviation...为概率分布名称缩写,R概率分布类型如下所示: 对于概率密度函数和分布函数,其使用方法举例如下:例如正态分布概率密度函数为dnorm(),概率分布函数pnorm(),生成符合正态分布随机数rnorm...R也可以产生多维随机变量,例如MASS包mvrnorm()函数可以产生一维或者多维正态分布随机变量,其使用方法如下所示: mvrnorm(n=1, mu, Sigma...)

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125-R编程19-请珍惜R量化操作特性

量化问题(Vectorize) · 语雀 (yuque.com)[1] R inferno 前言 虽然之前也在[[50-R茶话会10-编程效率提升指北]] 中提过向量化可以极大改善效率。...但还是按照inferno 内容,特此额外总结一下。 1-别用循环方言教R做事 lsum <- sum(log(x)) 我们所有操作,都可以对向量每一个元素执行。...同样在[[50-R茶话会10-编程效率提升指北]] 我们举过如下例子:在计算总和、元素乘积或者每个向量元素函数变换时, 应使用相应函数,如sum, prod, sqrt, log等。...,可以将标量(接受单一参数函数转换为向量化形式。...相当于把你函数直接向量化。 从上可知,Vectorize函数量化效率比起apply 并没有较为明显提升,但原汁原味量化函数可是飞速了许多。

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模型量化量化在LLM应用 | 得物技术

量化过程以矩阵乘法基本单元操作为例,基于 weight-only量化前后乘积均方差,可以写出如下优化函数,W 是在Transformer Linear层权重,X表示其对应输入。...参数和数据定义如下:W∈R^{K×M},X∈R^{M×N},Y=W×X∈R^{K ×N}calibrate set:部分数据用作推理,用于查看各层输入张量值范围,并基于此量化。...具体量化过程如下:计算Hessian(上述优化函数对于W_hatHessian,而非反向传播Hessian),加入扰动项:act order sort(desc_act,值范围相近column一起做量化...(outer loop)操作完该block,更新其后面的所有列:group_size若不指定group size,默认g=-1,以所有列为单位统计量化参数,并对每一行权重做量化,对于W∈R^{K×M}...若指定group size,例如g=128,则会以每128列为单位统计量化参数,并对每一行权重做量化,对于W∈R^{K×M},量化参数数量为K×(M/g)。

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