1、R中的向量化运算-seq seq(1, 10, by=1) seq(1, 10, by=0.1) seq(1.9, 10, by=0.1) #注意,不能这样子递减 seq(10, 1, by=...=100) seq(10, 1, length.out=91) #数清楚里面的个数 2、R中的向量化运算-rep > rep(3.14, 5) [1] 3.14 3.14 3.14 3.14 3.14...8 9 10 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 > length(rep(1:10, 5)) [1] 50 3、R中的向量化运算...> #相同长度的数组的计算规则 > 1:10 [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 > > 11:20 [1] 11 12 13 14 15 16 17 18 19...,要进行向量计算,短的那个向量会循环使用。
函数的用途 base包中的sweep函数是处理统计量的工具,一般可以结合apply()函数来使用。...函数的参数 sweep(x, MARGIN, STATS, FUN = "-", check.margin = TRUE, ...) x:即要处理的原数据集 MARGIN:对行或列,或者数列的其他维度进行操作...…… 下面我们结合几个具体的例子来看 #创建一个4行3列的矩阵 M = matrix( 1:12, ncol=3) 1.每一行都减去这一行的均值 #方法一,通过rowMeans函数来计算每一行的均值...sweep(M,1,rowMeans(M)) #方法二,通过apply函数来计算每一行的均值,MARGIN=1,对行做操作 sweep(M,1,apply(M,1,mean)) 2.每一行列都减去这一列的均值...#方法一,通过colMeans函数来计算每一列的均值 sweep(M,2,colMeans(M)) #方法二,通过apply函数来计算每一列的均值,MARGIN=2,对列做操作 sweep(M,2,
构造数据 本文为了聚焦于公式函数本身的用法,我构造的示例数据会非常的简单。...img 公式保存了创建它的环境 使用到 R 的朋友几乎都用过公式,它在统计建模方面给了我们极大的方便。不过,公式相比于数值、逻辑值这些数据类型,有什么特点吗?...")= 从属性部分我们可以看到公式保存了创建它的环境。...基本用法 假设我们要对 df 中的 x 和 y 列进行归一化处理,在不使用 scale() 函数的情况下,我们可能会手写一个函数: scale2 <- function(x) { (x - mean...在公式中,我们可以直接使用前面已经定义的变量,这里是 cfs。
R中gsub替换函数的参数如下 gsub(pattern, replacement, x, ignore.case = FALSE, perl = FALSE, fixed = FALSE,...vector举例如下: > x <- c("R Tutorial","PHP Tutorial", "HTML Tutorial") > gsub("Tutorial","Examples",x) #将...Tutorial替换成Examplers [1] "R Examples" "PHP Examples" "HTML Examples" 还有其他的一些例子来灵活使用这个函数,结合正则表达式。...,我们知道组织病理分期分成stage I,stage II,stage III和stage IV四个分期 接下来我们试着把组织病理分期从四个组合并成两个组,并转换成因子 我们使用gsub函数...,并转换成因子 我们还是使用gsub函数 #删除组织病理学分期末尾的A,B或者C等字母,例如Stage IIIA,Stage IIIB stage=gsub("[ABCD]$","",clin$ajcc_pathologic_stage
首先构造一个函数,它有一个参数x。这个函数的参数列表中还包含了一个省略号,因此这个省略号将成为我们调用的summary函数的参数。...这有点类似于shell中通过$引用相应的参数。看来很多的编程语言都存有相同的参数传递机制。 函数的属性 R中包含了一系列的函数用于提取函数类型对象的信息。...NULL 如果我们想要在R代码中对函数的参数列表进行操作,formals函数是一个很好的工具,它会返回一个配对列表对象(对应参数名和设定的默认参数值)。...注意,formals函数仅能运行在R写的函数上(类型为closure的对象),而不能在内嵌函数(bulti-in function)上运行。...解释器将这样递归地在各个环境中寻找直到找到该符号或到达全局环境。加入解释器在到达全局环境时依然没有找到var,那么R会在全局环境中指定var的值为value。
我们用R做数据处理的时候,经常要对数据的格式进行变换。例如将数据框(dataframe)转换成列表(list),或者反过来将列表转换成数据框。...那么今天小编就给大家介绍一对R函数来实现这样的功能。 这一对函数就叫做stack和unstack。从字面意思上来看就是堆叠和去堆叠,就像下面这张图展示的这样。...那么R里面这两个函数具体可以实现什么样的功能呢?下面这张图可以帮助大家来理解。unstack就是根据数据框的第二列的分组信息,将第一列的数据划分到各个组,是一个去堆叠的过程。...一、unstack 下面我们来看几个具体的例子 例如现在我们手上有一个数据框,里面的数据来自PlantGrowth 我们可以先看看PlantGrowth 中的内容,第一列是重量,第二列是不同的处理方式...,后面小编会使用这两个函数来给大家举个真实的应用案例,敬请期待。
在R中,expand.grid()函数可以返回几个元素所有可能的组合,使我们免于多层遍历的苦恼。...其实这个就是我们提供的sex,age,major中的变量分别组合起来得到的,类似于,遍历三层循环得到所有的排列组合。
方案 在一个新的 R 会话中使用 search() 可以查看默认加载的包。...#> [19] "package:datasets" "package:methods" #> [21] "Autoloads" "package:base" 以下提供的函数能够列出包中的函数和对象...showPackageContents <- function(packageName) { # 获取特定包所有内容的列表 funlist <- objects(packageName)...移除包含箭头 <- 的东西 idx <- grep("<-", funlist) if (length(idx) !...qr.resid qr.solve qr.X quarters quarters.Date quarters.POSIXt quit R_system_version R.home R.Version
在日常数据分析的过程中,我们经常需要在一个字符串或者字符串向量中查找是否包含我们要找的东西,或者向量中那几个元素包含我们要查找的内容。...这个时候我们会用到R中最常用的两个函数,grep和grepl。...其实grep这个函数也并非是R所特有的,在linux中模式匹配也用grep这个函数,前面我就给大家简单介绍过☞Linux xargs grep zgrep命令。...我们先来看看grep和grepl这两个函数的用法。 这两个函数最大的区别在于grep返回找到的位置,grepl返回是否包含要查找的内容。接下来我们结合具体的例子来讲解。...☞讨论学习R的grepl函数 参考资料: ☞Linux xargs grep zgrep命令 ☞讨论学习R的grepl函数
函数形式:X(t+1) = f( X(t) ) HMM由来 物理信号是时变的,参数也是时变的,一些物理过程在一段时间内是可以用线性模型来描述的,将这些线性模型在时间上连接,形成了Markov链。...既解决了短时信号的描述,又解决了时变模型间的转变问题。 RHmm包介绍 应用(训练样本是2007-2009年) 黑的是HMM模型的收益,红的是基准。...HMM在波动率市场中的应用 输入是:ATR(平均真实波幅)、log return 用的是depmixS4包 模型的输出并不让人满意。 HS300测试 去除数据比较少的9支,剩291支股票。...(一个模型包括:输入、样本筛选/过滤、拟合参数、拟合函数、模型的参数、目标函数等等等等。这么多东西需要测试, oh my god!) 改进 这里还是只讲HMM模型吧!...同样,回撤比较大的问题还是不能避免。看来需要寻找其他的方式来避免大的回撤。
函数对比 SQL中窗口函数语句中over语句中两个关键词:partition by和order by,R语言中也有与之一一对应的函数: ?...1 row_number函数 R语言中的row_number函数与sql中的row_number函数相同,对group_by后面字段进行分组,按照order_by后面字段排序,生成一个连续不重复的编码...2 min_rank函数 R语言中的min_rank函数与sql中的rank函数相同,row_number函数对order_by后面字段相同的记录编码是不同的,min_rank就是解决这个问题,对相同的记录编码相同...同样得到与sql中相同的输出结果: ? 4 ntile函数 R语言中的ntile函数与sql中的ntile函数相同,把每一组分成几块,块数由参数n决定: ?...总结 简单介绍R语言中4个排名窗口函数,函数名几乎与sql中的4个排名窗口函数一样(除了min_rank与rank),但R语言的排名窗口函数的输出结果与sql中的输出结果有点不同:R语言的数据结果不改变原来的数据顺序
函数语法 函数名<-function(parameters){ statemens return(expression)} printLine <- function () { print("---...-----------------------------------------"); } #函数的调用 printLine(); #错误:无参函数,有参调用 printLine("parameter...function (n) { for(i in 1:n) { print("--------------------------------------------"); } } #错误:有参函数...,实现了summary函数的加强版功能!...更多自编函数,参见Erin的自编函数整理,直接调用帮助你的数据分析工作事半功倍哦!
如何向回调函数中传参数 最近写JS经常会因为向回调函数中传参而头疼,今天总结一下向回调函数中传参的方法,以后的应用中就不用在到处去找了。 首先构建一个需要向回调函数中传入参数的典型应用。...在一个页面中产生了一系列的向Ajax Proxy的请求,传入的是一个ID,根据ID返回了不同的内容值,我们需要把这些内容打印在页面上,同时给页面元素赋予ID,这个时候就需要向回调函数中传入ID,以产生带...这种方法在传入单个的变量时没什么问题,但是当我们在一个循环的结构中,不断的传入变量到回调函数,这个时候传入的变量会采用最后一次传入的变量值,这就与我们预想的结果有了出入。...的一种变体,你不需要显示的声明一个回调函数,而是使用一个匿名函数直接进行你所需要的处理。...如何向回调函数中传参数 总结一下:向回调函数中传入参数的终极办法其实就是利用Closure,这个看来是唯一可行而且比较优雅的方法,下面将Closure的写法列在下面: var callback
大家好,又见面了,我是你们的朋友全栈君。 使用R中merge()函数合并数据 在R中可以使用merge()函数去合并数据框,其强大之处在于在两个不同的数据框中标识共同的列或行。...确实如此,merge()函数的不同参数可以实现内join,left join,right join以及完整join。 merge()函数有很多参数,看起来非常吓人。...如何理解不同类型的合并 merge() 函数支持4种类型数据合并: Natural join: 仅返回两数据框中匹配的数据框行,参数为:all=FALSE....,所以R基于两者state的name进行匹配。...总结 本文详细介绍R中merge()函数参数及合并数据类型。利用sql的表连接概念进行类比,简单易懂。
LC-MASS,GC-MASS等简称对于药物研发的人应该相当不陌生,但是对于它们产生的数据的进一步分析,反而显得心有余而力不足。今天我们给大家介绍一下R语言中是如何把质谱数据进行提取的。...其中IPO主要是通过质控数据优化XCMS中的计算参数;XCMS主要进行质谱数据的获取、校正;Rmpi主要是并行运算的接口,支持多进程运算。...首先我们说明今天的所有操作都是基于3.5.1版本的R,因为在3.5以后的版本bioconductor的安装包形式有所改变,它自己开发了R包管理的程序,并未R语言提供API。...我们还需要自己加上另一个分析函数: diffreport(xset,class1 =levels(sampclass(xset))[1], class2 = levels(sampclass(xset)...最后得到我们想要的峰面积的数据: ? ? 同时对数据进行两组之间的差异分析(box)和离子图谱的提取(eic): ? ? 至此质谱数据进行了量化处理,接下来就是对数据进行进一步的分析。
,因产物的量与标本中受检物质的量直接相关,故可根据颜色反应的深浅有无定性或定量分析的一个过程。...那么,既然是通过颜色来定量就需要有标准的曲线去作为参考,然而并不是每次都有参考的曲线。此时就需要用到反曲线模型来进行评估数据的最快酶反应点(PMG),得到我们的量化数据。...我们今天给大家介绍一个4 参数的反曲模型如何在R语言中实现,首先看下这个模型的公式: [rcxmsl6clv.jpeg] 其中,f(x)是反应每个x稀释度的吸光系数;a是最大吸光度,d是最小吸光度;b是在...c处的斜率;c是PMG点 接下来我们需要安装包 install.packages("minpack.lm") 我们看下其中主要的函数nlsLM: [urxymjg6dz.jpeg] 其中主要的参数:...:模型中不同的项用+分隔。 :-表示从模型中移除某一项,y~x-1表示从模型中移除常数项 ::冒号在formula中表示交互项,也就是说两项之间存在相互作用共同决定因果关系。
在Andrew Ng的>课程中,多次强调了使用向量化的形式进行编码,在深度学习课程中,甚至给出了编程原则:尽可能避免使用for循环而采用向量化形式。...许多Numpy运算都是用C实现的,相比Python中的循环,速度上有明显优势。所以采用向量化编程,而不是普通的Python循环,最大的优点是提升性能。...另外相比Python循环嵌套,采用向量化的代码显得更加简洁。...总之,无论你有多长的数据列表并需要对它们进行数学转换,都强烈考虑将这些Python数据结构(列表或元组或字典)转换为numpy.ndarray对象并使用固有的矢量化功能。...更多关于numpy向量化编程的指导,可以参考这本开源的在线书籍:From Python to Numpy )
对此,我们可以在R中调用相应的概率分布函数并进行可视化,可以非常直观的辅助学习。...R中拥有众多的概率函数,既有概率密度函数,也有概率分布函数,可以调用函数,也可以产生随机数,其使用规则如下所示: [dpqr]distribution_abbreviation() 其中前面字母为函数类型...,含义如下: d=密度函数(density) p=分布函数(distributionfunction) q=分位数函数(quantilefunction) r=生成随机数(随机偏差) distribution_abbreviation...为概率分布名称的缩写,R中的概率分布类型如下所示: 对于概率密度函数和分布函数,其使用方法举例如下:例如正态分布概率密度函数为dnorm(),概率分布函数pnorm(),生成符合正态分布的随机数rnorm...R也可以产生多维随机变量,例如MASS包中的mvrnorm()函数可以产生一维或者多维正态分布的随机变量,其使用方法如下所示: mvrnorm(n=1, mu, Sigma...)
向量化问题(Vectorize) · 语雀 (yuque.com)[1] R inferno 前言 虽然之前也在[[50-R茶话会10-编程效率提升指北]] 中提过向量化可以极大的改善效率。...但还是按照inferno 中的内容,特此额外总结一下。 1-别用循环的方言教R做事 lsum <- sum(log(x)) 我们的所有操作,都可以对向量的每一个元素执行。...同样在[[50-R茶话会10-编程效率提升指北]] 我们举过如下例子:在计算总和、元素乘积或者每个向量元素的函数变换时, 应使用相应的函数,如sum, prod, sqrt, log等。...,可以将标量(接受单一参数的)函数转换为向量化形式。...相当于把你的函数直接向量化。 从上可知,Vectorize函数的向量化效率比起apply 并没有较为明显提升,但原汁原味的向量化函数可是飞速了许多。
量化过程以矩阵乘法的基本单元操作为例,基于 weight-only量化前后的乘积的均方差,可以写出如下优化函数,W 是在Transformer 中的Linear层权重,X表示其对应的输入。...参数和数据定义如下:W∈R^{K×M},X∈R^{M×N},Y=W×X∈R^{K ×N}calibrate set:部分数据用作推理,用于查看各层输入张量的值范围,并基于此量化。...具体量化过程如下:计算Hessian(上述优化函数对于W_hat的Hessian,而非反向传播中的Hessian),加入扰动项:act order sort(desc_act,值范围相近的column一起做量化...(outer loop)操作完该block,更新其后面的所有列:group_size若不指定group size,默认g=-1,以所有列为单位统计量化参数,并对每一行的权重做量化,对于W∈R^{K×M}...若指定group size,例如g=128,则会以每128列为单位统计量化参数,并对每一行的权重做量化,对于W∈R^{K×M},量化参数的数量为K×(M/g)。
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云