树中关系最密切的树叶(ete3包)
树中关系最密切的树叶是指树中与其他节点有最近距离的叶子节点。在树结构中，叶子节点是没有子节点的节点，它们是树的末端节点。
树中关系最密切的树叶可以通过遍历树的方式来确定。一种常用的遍历算法是深度优先搜索（DFS）或广度优先搜索（BFS）。通过这些算法，我们可以遍历树的所有节点，并计算每个节点到其他节点的距离。然后，我们可以找到与其他节点距离最近的叶子节点，这些叶子节点就是树中关系最密切的树叶。
树中关系最密切的树叶的应用场景包括：
- 社交网络分析：在社交网络中，树中关系最密切的树叶可以表示用户之间的最亲密关系，有助于发现用户之间的紧密联系。
- 数据挖掘：在大规模数据集中，树中关系最密切的树叶可以帮助我们发现数据中的相关模式和关联规则。
- 图像处理：在图像处理中，树中关系最密切的树叶可以用于图像分割和对象识别等任务，帮助我们理解图像中的结构和关系。
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我是linux用户，到目前为止，我已经成功地在python2中使用了ete3。
我为python3安装了ete3，但有一些模块是python3找不到的。我相信我已经按照说明安装了所有的依赖项。
我可以从ete3导入ete3和树，但不能导入到目前为止我使用过的任何其他文件。
有关于如何解决这个问题的线索吗？
~$ python3
Python 3.4.3 (default, Nov 28 2017, 16:41:13)
[GCC 4.8.4] on linux
Type "help", "copyright", "credits" or "
浏览 46提问于2018-03-09得票数 0
我目前有一个已经编码的数据集，它看起来像这样： ? 然后，我这样分离了自变量和因变量，然后使用sklearn包将数据集分离为训练集和测试集。 X = df[['year', 'manufacturer', 'make', 'condition', 'cylinders', 'fuel', 'odometer', 'transmission', 'type']]
y = df['price']
X_train, X_test,
浏览 69提问于2019-12-05得票数 0
我偶然发现了基于树的算法Light，并且我读到它垂直地生长树，这意味着Light是按树叶方向生长的(而其他一些算法则是水平增长的)。我只是在想:垂直生长一棵树有什么好处？有吗？
我能看到的一个不同之处(不一定是优势)是，在树生长时，需要定义早期停止标准的方式。对此有什么想法吗？
浏览 1提问于2021-11-06得票数 0
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我读了一篇关于information visualization的文章，偶然发现了它众多表示方法中的一种-- treemap。所以我想知道，它是不是和Java中的树地图一样，或者只是巧合？是的，我从来没有使用过这两个树状地图中的任何一个，所以我很难从彼此中识别出它们。
浏览 3提问于2015-01-30得票数 0
1回答
我正在做一个关于树木在不同环境下如何生长的模拟实验，比如光照强度，树叶形状。
有没有一个Python 3D库可以简化生成带有树叶(在自然界中)的树的过程，并且具有强大的光照投影支持，以便我可以计算光照强度，即使考虑到树叶投射的阴影。
浏览 0提问于2012-02-12得票数 0
有没有一种方法可以在Haskell中高效地进行最佳优先搜索？我想维护一个动态的树。我有一个启发式函数，它可以为每个节点计算一个数字，还有一个后继函数，它将返回一个节点的子节点列表。
在每一步中，我都希望使用启发式最好的叶节点，并用它的子节点替换它。重复这个过程，直到我得到一个“足够好”的节点。
为此，我需要维护树叶的优先级队列。但是，有没有一种方法可以有效地从优先级队列中的叶子转到它在树中的位置，以便我可以修改树？
浏览 3提问于2014-07-23得票数 3
1回答
我需要导入一个名为ete3的包：
from ete3 import EvolTree
以下是我的问题：
我有两个本地化的这个包：
~/path1/path2/ete3~/path1/path3/ete3
我手动更改了其中的一些命令行：~/path1/path3/ete3，但是当我在python3.7中调用ete3时，它调用这里的命令行：~/path1/path2/ete3，但我想在这里导入另一个命令行，~/path1/path3/ete3
有人知道怎么做吗？谢谢你的帮助
浏览 4提问于2019-12-24得票数 0
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首先，我对编程很陌生，所以我期望得到简单而又解释清楚的答案。第二，这是一个非常具体的问题，我不希望版主和其他用户只是把这个问题当作离题或过于宽泛来结束。
无论如何，我想用某种数据结构在java中实现Huffman编码。但是，我正在考虑使用splay树，因为它不会在我的课程教学大纲中涉及，也因为我想学习一种新的数据结构。现在的主要问题是，哈夫曼编码算法首先是否需要显示树的数据结构？
在基于Huffman的数据压缩项目中，我可以使用显示树做什么？或者你更愿意为这个项目提出一个更好的数据结构(因为它的效率和创造力)，因为它是独一无二的，而不是听说过的。
谢谢
浏览 2提问于2016-03-09得票数 2
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我在思考图形中的一个问题，这个问题的一部分如下所述：
我们有一个图G=(V，E)，它的生成树T=(V，F ) (F是E的子集)，对于G(在E上)中的每一个min割集，它将图划分为两个带有节点(U，U')的子图(每个子图都不需要连通)我们在F中检查这个割集的大小，它们的名称是G(U，U')和T(U，U')，我想找出：
ratio = max{T(U,U')/G(U,U')} for all possible U,U'
我认为这是NP难的，但我无法证明这一点。这里有一件很明显的事情，那就是如果我们在T中有一个顶点与G的次数相同，比率是1，它也是明显的
浏览 0提问于2011-12-03得票数 1
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1回答
我们正在虚幻4中制作一个游戏，当我们在编辑器中玩游戏时，它是非常滞后的，直到我们转到引擎可伸缩性设置，并将阴影调低。然后它运行得很好。但是当我们导出项目时，看起来阴影仍然存在，并且游戏的延迟非常严重，比如每秒5帧。如何使打包的构建使用低阴影设置？
浏览 4提问于2015-05-03得票数 0
1回答
我有一个动态生成的树视图
我们的想法是循环到它们里面，只是为了得到一些值，但是我们不知道每个元素有多少个childs。
<ul>
<li>something here</li>
<li>something here
<ul>
<li></li>
<li></li>
...more and more childs
</ul>
</li>
</
浏览 0提问于2016-11-30得票数 0
2回答
我曾经使用yum列出所有已安装的软件包：
yum list installed
现在我只需要列出顶级包，也就是说，如果一个包是另一个包的依赖项，则不应该显示它。GNOME的Add/Remove软件可以做到这一点，但是我需要终端中的输出。
我查了一下百胜手册，但找不到开关。
浏览 0提问于2010-10-09得票数 11
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2回答
我需要在内存中有一个图(或一些等效的数据结构)，它应该包含一组in (数字)，并且要求图(或一些数据结构)可能有大约10000 nodes.The的场景解释如下。如果我选择任何接口或我自己的自定义implementation.Please，请考虑内存和速度(请随时告诉我任何建议)。
例如：
我会在每个实例中获取所有的叶节点。即在下图中，我只需要6,7,8。
如果程序从图中删除6，那么输出将是4,5,7,8
很抱歉强调这一点，again.Please考虑内存和速度，因为它应该在安卓上运行。
谢谢
浏览 0提问于2013-01-27得票数 3
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1回答
我制作了自己的“决策树”，以找到一组事务的最佳分段。使用ttest和递归函数，该函数使用在该实例的一组可能的分割变量中找到的最重要的分割变量将数据一分为二。 输出是这样的： ('Blue', (('Mid', (42.0, ('Low', (11.64, ('High', (13.55, ('Very Low', (0.0, ('Very High', (3.29, 6.25)))))))))), ('Yellow', (('Mid', (44.39, ('
浏览 21提问于2021-04-29得票数 0
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我感兴趣的是理解随机森林是如何计算概率估计的，无论是在一般情况下还是在Python的scikit-learn库中(其中估计的概率由predict_proba函数返回)。
谢谢，盖伊
浏览 1提问于2013-01-07得票数 7
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问题：
我正在尝试导入newick格式的系统发育树，我以前已经这样做过，(一棵以同样的方式制作的树，所以代码工作！)然而，这棵树似乎是问题所在。我收到了一个重复的提示标签错误。如果是这样的话，有没有一种方法可以很容易地删除R中的重复提示呢？
当前代码：
library(ape)
library(geiger)
library(caper)
taxatree <- read.tree("test2.tre")
sumdata <- read.csv("ogtprop.csv")
sumdataPGLS <-data.frame(A=s
浏览 0提问于2018-07-10得票数 2
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我有一个包含20,000个观测和19个变量的数据集。首先，我有一个性别专栏，它有三个层次，即'M'，'F‘和'U’，在那里你可以被认为是不公开的。每当性别专栏中有“U”字时，就会有安娜出现在另外两个栏目，即“年龄”和“任期”。这基本上可以解释为不愿意透露其性别、不愿意透露其年龄和任期的人。我该如何处理这种情况？除了这三列之外，dataset中还有其他16列在其中有有意义的数据。在这种情况下，正常的估算技术会像KNN估算那样帮助我吗？
以下是我已经尽了最大努力的可重复的例子：
x<-data.frame(gender=c('M','M
浏览 0提问于2018-09-11得票数 1
1回答
您好，我有一棵树，例如：
>>> print(tree)
/-A
--|
| /-B
\-|
| /-C
\-|
| /-D
\-|
\-E
tree=Tree("(A,(B,C,(D,E)));") (ete3 function)
我正在寻找一种方法来查看与特定叶子最接近的叶子。
例如，这里与C关系最密切的叶子是D和E.，与D关系最密切的叶子是E，与B关系最密切的叶子是C, D和E.
浏览 13提问于2020-02-28得票数 0
我想在Haskell中表示一个如下形状的“树”：
/\
/\/\
/\/\/\
/\/\/\/\
` ` ` ` `
/和\是树枝，`是树叶。你可以看到，从任何节点开始，沿着左边的路径，然后右边到达同一个节点，沿着右边的路径，然后是左边。您应该能够标记树叶，在每个节点上应用两个子集的函数，并在O(n^2)时间内将此信息传播到根。我幼稚的努力给了我一个指数级的运行时间。有什么提示吗？
浏览 3提问于2011-12-07得票数 16
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1回答
在OOP中查看继承层次结构树时，当两个对象在图中并排出现时，它们之间的关系是什么？例如: NSWindow和NSView都继承自NSResponder，那么他们是兄弟姐妹吗？它们各自的方法是如何关联的？
浏览 0提问于2010-09-26得票数 0
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我正在使用，似乎它无法跨大团队进行搜索。
我的应用程序有User.ReadBasic.All.权限
例如，我在Office组，我不能在Windows组中搜索某人。
GET https://graph.microsoft.com/v1.0/me/people/?$search="Terry Myerson"
它会回来的
{
"value": []
}
编辑：我从Marc那里得到了答案，但我仍然觉得它应该返回无关的人，让结果排在后面。所以我创建了一个特性请求。你可以。
浏览 5提问于2017-10-24得票数 1
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嗨，我是一个web开发人员，一个客户问我是否可以构建一个应用程序来显示OrderedFriendsListInitialData.中包含的信息当您查看Facebook新闻提要上的源代码时，会发现此信息。
Facebook的服务条款非常清楚不刮掉Facebook页面，所以我需要通过API访问数据。这样做的目的是让用户通过Facebook应用程序方便地查看这个列表。
也是，如果这是不可能的，那么Facebook是否会破例刮掉这个单数元素，只为了将其显示给生成它的用户。
也就是说，不将其显示给其他人，只刮掉数据直接显示给用户，而不将其保存到任何数据库中。
浏览 13提问于2012-12-05得票数 0
我使用Apache Spark Mllib 1.4.1 (PySpark，Spark的python实现)根据我拥有的LabeledPoint数据生成决策树。树可以正确生成，我可以使用以下命令将其打印到终端(提取规则，该用户将其称为)：
model = DecisionTree.trainClassifier( ... )
print(model.toDebugString()
但我想要做的是可视化或绘制决策树，而不是将其打印到终端。有没有什么方法可以在PySpark中绘制决策树，或者可以保存决策树数据并使用R绘制它？谢谢!
浏览 6提问于2015-08-06得票数 11
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我有一些基于功能的div，其中有class(es)，我只是尝试从last div中获取first div的data attribute。因此，我决定closest将适合我的需求。但不幸的是，它正在返回null。有人能告诉我我的片段怎么了吗。
HTML:
<div class="DivApplication">
<div class="DivImg DivImgRun DivImgLeft" data-internalid=16></div>
<div class="DivAppName">A
浏览 0提问于2013-07-23得票数 2
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1回答
我有一个包含多个包的项目组，其中一些包需要同一项目组中的其他包。软件包并不都设置了相同的软件包输出目录。问题就是从这里开始的。根据我构建的BPLs包，有时转到一个目录，另一次转到不同的目录。
我试着简化正在发生的事情。假设我们有两个包PackLib和PackDependent。PackDependent的"Requires“列表中有PackLib。PackLib的“包输出目录”是"C:\PackLib"，PackDependent的目录是"C:\PackDependent“。问题是:当我构建PackLib时，bpl会转到"C:\PackLib”--这就是
浏览 3提问于2011-03-01得票数 1
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我很难弄清楚下面的代码段在做什么。它摘自亨里克·万恩·詹森( Henrik Wann Jensen )所著的“用光子作图合成真实感图像”( Realistic )一书。我认为它想要做的(或者考虑到它在代码中的位置它应该尝试做的事情)是计算某个开始索引和结束索引之间数组中的中间索引。
// inputs are an array, start and end indices that define a subset of the array
int median = 1;
while((4*median) <= (end-start+1))
median += median;
if
浏览 0提问于2011-12-01得票数 1
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2回答
我有一个(n_sample X 2)数组，我想使用sklearn.neighbors.KDTree中的KDTree对它们进行集群。
我有一个示例代码：
from sklearn.neighbors import KDTree
import numpy as np
np.random.seed(0)
X = np.random.random((10, 2))
tree = KDTree(X, leaf_size=2)
现在我想提取树的叶子上的点，这样每一片叶子都可以成为一个簇。同一叶中的点属于同一簇。
在上面的例子中，由于最大leaf_size是2，所以我们将有大约10 /2=5个集群。
我想要
浏览 5提问于2016-04-01得票数 2
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1回答
我正在为企业解决方案开发一个面向django应用程序的用户。目前，用户可以将站点上的数据分类为私有集合，仅对自己可见。一个功能要求是让经理能够查看他们下属的私人收藏。
我的问题是，实现这个层次结构的最佳解决方案是什么？我想出了几个解决方案：
从用户到用户名为manager的外键。创建一个@user_passes_test测试，该测试通过从集合所有者处查找的管理器关系递归，直到a)请求用户被发现是管理器，或者b)管理器为Null，指示请求用户未被授权访问此页面。
- Benefits: simple hierarchy is accurately represented with m
浏览 2提问于2011-07-07得票数 0
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1回答
在我的项目中，我在下面的Python3环境中调用了一个名为ete3的特定包： /beegfs/home/me/.conda/envs/mypython3/lib/python3.7/site-packages/ete3/... 我首先打开Python3.7： /beegfs/home/me/.conda/envs/mypython3/bin/python3.7 我将其称为ete3包： from ete3 import * 但是ete3不是来自/beegfs/home/me/.conda/envs/mypython3/lib/python3.7/site-packages/ete3/ 而是
浏览 7提问于2019-12-24得票数 0
我最近遇到的一个特定模板模式使用布尔类型检查来确定要调用的专门化。除了策略参数由数据类型控制而不是使其可配置之外，对该模式非常熟悉。
template<
typename Ty,
bool as_type = is_associative<Ty>::value,
bool it_type = is_iterable<Ty>::value,
bool pr_type = is_pair<Ty>::value
>
struct brackets
{
// Any other case is an Error
浏览 1提问于2014-08-16得票数 0
2回答
这两个版本有什么区别？
public static int countLeaves(IntTreeNode root) {
if (root == null) {
return 0;
} else
return 1 + countLeaves(root.left) + countLeaves(root.right);
}
public static int countLeaves(IntTreeNode root) {
if (root == null) {
return 0;
} else if
浏览 4提问于2017-10-28得票数 0
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如何实现一个函数来返回在该树中给定元素之前找到的叶子的数量？假设你是从左到右读树的？
我找到了这样做，但它并不是很简单，而且使用了异常机制，我想可能有一个优雅的方式来做它？
浏览 0提问于2012-08-31得票数 0
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要从n高的一棵树中得到一棵高n+1的二叉树，我们最多可以用两片叶子来代替以前的一棵树。正式语言和自动机简介- Peter Linz
有人能给我解释一下(视觉上的)我们是如何通过加倍树叶来获得一棵高度为n+1的二叉树吗？
浏览 2提问于2022-09-05得票数 0
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我们得到一棵树，它的类型如下：
type ('nonterminal, 'terminal) parse_tree =
| Node of 'nonterminal * ('nonterminal, 'terminal) parse_tree list
| Leaf of 'terminal
以及以下形式：
let t = (Node ("+", [Leaf 3; Node ("*", [Leaf 4; Leaf 5])])
并要求我们编写一个函数，该函数以树为参数，并返回它找到的叶子列表(从左到右)，这样
浏览 0提问于2019-04-15得票数 0
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1回答
下面的图像中的树不是平衡二叉树吗？我的一个朋友认为这是不可能平衡的，因为节点A在距离根E的深度2处，而G和L在距离E的深度4处，因此E必须不平衡-2倍。我认为节点只有在以下情况下才是不平衡的：
Absolute(Heigh of left subtree - Height of right subtree) > 1
因为D，所以E的左子树的高度是3，而不是2。让我的朋友信服的最好方法是什么？
浏览 2提问于2015-01-24得票数 1
我已经为包含值为>= 0的叶节点的n级数据集创建了d3树布局。有些树枝比其他树枝短，也就是说，不是所有的树叶都在同一水平。
我现在想修剪那些叶值之和等于0的层次结构(叶子和分支)的树，但不确定如何做到这一点。任何建议都很感谢。
浏览 2提问于2013-02-28得票数 1
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我已经用曲线树苗插件在搅拌器中创建了一棵树。然后，我已经在网格中转换了对数曲线，并将其与树叶网格相结合。我试着创建一个普通的UV贴图，但是因为顶点太多而导致漂白崩溃。所以我需要创建一个uv贴图，在那里我为所有的树叶绘制原木纹理和一个纹理。我该如何创建它呢?谢谢并为我糟糕的英语道歉
浏览 3提问于2015-08-21得票数 0
如上所述，我很好奇是否有一种方法可以生成流程图或类似的东西，显示来自meteor/react项目的导入结构。这将大大加快我的开发时间。
我喜欢这样的东西：
app.js
- mycomponent1.js中的MyComponent1
-MyComponent2来自my component2.js
-来自anothercompoent.js的另一个组件
-来自yetanotherone.js的另一个
用于项目中的整个导入树。
类似于tree命令，但它分解了导入内容、导入内容和位置的流程。
浏览 1提问于2020-09-21得票数 0
1回答
我有Debian，因为它很稳定，大多数包都很过时，例如SQLAlchemy 0.4，而当前版本是0.5.x。我想知道我是否应该设置backports (如果是这样的话，我应该如何具体地设置它们，以便只对我选择的单个包进行升级)，还是让它成为sid，这样我就可以获取更多最新的包。
浏览 0提问于2009-11-11得票数 0
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1回答
我一直在遵循blender的Tree+Leaves教程，因为我正在用树叶填充树，我想知道通过将它导出到C# (WPF)，它是否会使每一片叶子都成为一个“单一对象”，这样我就可以将某种行为添加到我从树中挑选的单个叶子中。
例如，我想要做的是，当某个事件发生时，让随机落叶落下，控制落叶时的动画，并使其停留在地面上一段时间，在很长一段时间结束时，树将半裸。
提前谢谢~致以问候
浏览 1提问于2014-11-07得票数 0
我的主程序如下所示(伪代码)：
public void main(String[] args) {
// produce lots of int[] data which is stored inside a list of hashmaps
List<HashMap<Integer, int[]>> dataArray1 = new
ArrayList<HashMap<Integer, int[]>>();
...
// create a
浏览 3提问于2013-04-17得票数 1
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我正在尝试运行网站上的代码，但一直收到以下错误：
ImportError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-12-a0ac9cfa4061> in <module>()
1 from ete3 import Tree
2 t = Tree( "((a,b),c);" )
----> 3 t.render("mytree.png", w=183, units="mm")
浏览 24提问于2016-10-22得票数 0
4回答
如何确定递归树的高度，它是在处理递归运行时构建的？它和确定一棵普通树的高度有什么不同？
编辑:对不起，我想添加如何从递归关系中获取递归树的高度。
浏览 3提问于2009-08-28得票数 13
1回答
在Python3.5中，添加了类型注释(参见)。
是否有一种方法来定义递归类型注释，比如树状结构？
class Employee(object):
def __init__(self, name: str, reports: List[Employee]):
self.name = name
self.reports = reports
在上面，注释List[Employee]似乎不起作用。运行代码会导致以下错误：
NameError: name 'Employee' is not defined
浏览 1提问于2016-07-13得票数 28
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如果我有一个立方体被分成8个更小的立方体，每个立方体又可以再细分为8个立方体，那么我的系统叫什么？
我知道这是一棵树的一个特例，每个树枝恰好包含8个其他树叶/树枝。
我记得它的名字以"Oct“开头，维基百科上有一篇关于它的文章，但我真的找不到了！
有人知道这样的数据结构实际上是什么吗？
浏览 2提问于2011-01-10得票数 0
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2回答
给定一个解析树(使用漂亮打印选项获得)
(ROOT (S (NP (PRP You)) (VP (MD could) (VP (VB say) (SBAR (IN that) (S (NP (PRP they)) (ADVP (RB regularly)) (VP (VB catch) (NP (NP (DT a) (NN shower)) (, ,) (SBAR (WHNP (WDT which)) (S (VP (VBZ adds) (PP (TO to) (NP (NP (PRP$ their) (NN exhilaration)) (CC and) (NP (FW joie) (FW
浏览 3提问于2016-09-04得票数 2
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1回答
“龙书”第二章的问题
、、、
在第29页上，它说“从左到右读取的解析树的叶子形成了树的产出量，这是从解析树根部的非终结符生成或派生的字符串。在图2.2中，生成的字符串是9-5*2。在该图中，所有的叶子都显示在底部。从今以后，我们不一定要用这种方式排列叶子。”为什么不行？
它还说：“任何一棵树的叶子都有从左到右的自然顺序，这是基于这样的想法:如果a和b是具有相同父代的两个孩子，并且a在b的左边，那么a的所有后代都在b的后代的左边。”什么意思？
这是这本书的第二版
浏览 0提问于2012-03-28得票数 1
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