R ggplot2是否存在与性能分析程序包中的chart.Correlation函数等效的函数？
R ggplot2是一个用于数据可视化的强大工具，而性能分析程序包中的chart.Correlation函数用于绘制相关性矩阵的图表。虽然ggplot2本身没有与chart.Correlation函数完全等效的函数，但可以使用ggplot2和其他R包的组合来实现相似的功能。
在ggplot2中，可以使用geom_tile函数创建热力图来表示相关性矩阵。首先，需要将相关性矩阵转换为适合绘制热力图的数据格式。可以使用reshape2包中的melt函数将相关性矩阵转换为长格式的数据框。然后，使用ggplot2的ggplot函数创建一个基本的图表对象，并使用geom_tile函数添加热力图的图层。最后，可以使用scale_fill_gradient函数来调整热力图的颜色映射。
以下是一个示例代码：
library(ggplot2)
library(reshape2)
# 创建相关性矩阵
cor_matrix <- cor(mtcars)
# 将相关性矩阵转换为长格式的数据框
cor_data <- melt(cor_matrix)
# 创建基本的图表对象
p <- ggplot(cor_data, aes(x = Var1, y = Var2, fill = value))
# 添加热力图的图层
p <- p + geom_tile()
# 调整热力图的颜色映射
p <- p + scale_fill_gradient(low = "blue", high = "red")
# 显示图表
print(p)这段代码将创建一个基于ggplot2的热力图，用于可视化相关性矩阵。你可以根据自己的需求进一步调整图表的样式和布局。
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有什么方法可以在正方形上拟合x和y的不均匀长度的数据集来创建一个连续的热图？
数据集有10行(y轴)和1000列(x轴)的数据集。我的意图是绘制一个连续的热图，这个热图应该是一个使用ggplot2的正方形。
下面是一个例子：
df<- data.frame(matrix(runif(10000,1,100), nrow=10))
非常感谢。
浏览 3提问于2016-06-09得票数 0
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我尝试用热图绘制每个脚手架和每个物种的值。我参考了下面的帖子来设置我的脚本：How to plot a heat map by chromosome in R 但输入表本身是不寻常的，并遵循以下格式： structure(list(scaffolds = c("Scaffolds_0", "Scaffolds_1", "Scaffolds_2",
"Scaffolds_3", "Scaffolds_4", "Scaffolds_5", "Scaffolds_6", "Sc
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r、ggplot2、plotly
我想在ggplot2或plot_ly中绘制相关矩阵，它应该是交互式的，并同时显示相关值和相应的p值。
我已经尝试了以下代码。
library(ggplot2)
library(plotly)
library(reshape)
library(Hmisc)
x <- Seatbelts
y <- as.matrix(x)
rt <- rcorr(y)
mtlr <- melt(rt$r)
mtlp <- melt(rt$P)
gx <- ggplot(mtl, aes(X1,
浏览 41提问于2017-03-10得票数 1
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在R中按颜色创建矩阵
r、image、matrix
假设我创建了一个测试矩阵4*4矩阵：
varieties = c("A", "B", "C", "D")
matVar = matrix(c(1,5,3,4,8,5,2,8,9,4,6,5,3,7,3,2), nrow = length(varieties), ncol = length(varieties))
我有一个矩阵，看起来如下：
[,1] [,2] [,3] [,4]
[1,] 1 8 9 3
[2,] 5 5 4 7
[3,] 3 2 6
浏览 4提问于2014-04-25得票数 0
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用ggplot2创建的r相关热图:如何在y轴上翻转标签？
r、ggplot2、heatmap、correlation
我发现了使用ggplot2创建相关热图的简单方法：
data(attitude)
library(ggplot2)
library(reshape2)
ggplot(melt(cor(attitude)), aes(Var1, Var2)) +
geom_tile(aes(fill = value))
然而，这将方差放在矩阵的对角线上。我期望他们在对角线上。我尝试使用rev()命令来完成这一任务：
ggplot(melt(cor(attitude)), aes(Var1, rev(Var2))) +
geom_tile(aes(fill = value))
就瓷砖内部
浏览 3提问于2015-04-02得票数 2
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1回答
格图细胞间平铺线
r、ggplot2、heatmap
我正在使用ggplot和geom_tile来形成热图。我想在细胞间插入一些模糊的线条。
例如：
我的ggplot geom_tile热图：
library(ggplot2)
library(reshape2)
data("iris")
x = melt(cor(iris[,1:4]))
ggplot(data=x,aes(Var1,Var2,fill=value)) + geom_tile() # No line between the cells
我想要的(来自R中的d3heatmap包)
library(d3heatmap)
data("iris")
x =
浏览 1提问于2015-09-19得票数 10
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1回答
如何在不覆盖以前的绘图的情况下存储要在多个绘图中使用的in图列表？
arrays、r、list、ggplot2
我想用从另一个函数(下面的cd参数)创建的对象在多个图中绘制一些协方差/相关矩阵的热图。协方差矩阵存储在一个三维数组中，这样cd$covmat[,,i]就可以调用ith协方差矩阵。
最初，我对复制同样的情节有一些问题。然而，我发现我有一个环境问题。我尝试了几种方法来解决这个问题，下面的代码是最新的，但是我不明白为什么它没有正确地阅读它。
有什么特别的原因吗？我尝试过包含和排除环境参数(希望我不需要这个参数)，并且我尝试在aes()参数中直接使用这个环境参数。
drawCovs<-function(cd,ncols){
require(ggplot2)
coords=exp
浏览 1提问于2013-12-23得票数 2
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使用ggplot2制作盒图时出错
r、ggplot2、boxplot
当我运行这个脚本时，我刚开始使用ggplot2与R。
var<-schz.[1,]
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不知道如何自动为data.frame类型的对象选择比例。默认为连续的。错误:美学必须是长度1或与数据(80)：x，y相同
数据集如下：
有人能告诉我怎么回事吗？我知道它是用ggplot2函数中的x和y定义的，但是我不能修复它！
浏览 2提问于2016-07-08得票数 0
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1回答
作为数据文件排序的热映射ggplot2
r、ggplot2
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那篇文章的代码很好
library(reshape2)
library(ggplot2)
library(scales)
library(plyr)
data <- read.csv("fruits.txt", head=TRUE, sep=",")
data.m = melt(data)
data.m <- ddply(data.m, .(variable), transform, rescale = rescale(value))
data.m <- ddply(data.m, .(variable), t
浏览 1提问于2014-08-02得票数 1
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如何用广泛的数据制作热图？
r、plot、ggplot2
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library(ggplot2)
data1<-structure(list(Genus = structure(1:15, .Label = c("a", "b", "c",
"d", "e", "f", "g", "h", "i", &#
浏览 0提问于2018-05-09得票数 2
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从ggplot2图形中移除前导零
r、ggplot2、leading-zero
我试图使用ggplot生成相关矩阵的热图，而不包括数据中的前导零。
考虑"datasets“包中的LifeCycleSavings中的这个示例：
pop75 dpi ddpi
sr 0.317 0.220 0.305
pop15 -0.908 -0.756 -0.048
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library(reshape2)
melted_cors <- melt(cors)
library(ggplot2)
ggplot(melted_cors, aes(Var2, Var1, fill = value)) +
geom_tile(co
浏览 2提问于2017-04-09得票数 0
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如何在R中绘制几幅热图
r、ggplot2、heatmap、gganimate
我有30个方阵形式的热图。每个热图都链接到一个日期，我想创建一个动画，根据日期从一个热图转换到下一个热图。为了做到这一点，我在R中使用了R，并且遇到了一些问题。让我用一些随机数据展示一个例子。
# GENERATE RANDOM DATA. 30 3X3 MATRICES STORED IN list_matrices
pacman::p_load(tidyverse, ggplot2, av, gganimate)
list_matrices = list()
for(i in 1:30){list_matrices[[i]] = matrix(runif(9), nrow=3)}
#
浏览 1提问于2021-07-22得票数 0
1回答
填充ggplot2问题中的热图
r、loops、ggplot2、heatmap、fill
我正试着用ggplot2制作一个热图。我想要绘制的是一个矩阵的形式，它是函数的结果。
以下是数据：
Image A B C D E F
1 3 23 45 23 45 90
2 4 34 34 34 34 89
3 34 33 24 89 23 67
4 3 45 234 90 12 78
5 78 89 34 23 12 56
6 56 90 56 67 34 45
以下是功能：
vector_a <- names(mas
浏览 0提问于2018-07-27得票数 0
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如何在R中实现S3通用绘图功能？
r、function
所以我一直试图在R中制作一个S3通用绘图函数.我读过几个解释S3函数的博客和例子。但我还是很难搞清楚。在我的包中，我有一个创建矩阵的函数。然后，我还有另一个函数，它把创建的矩阵作为一个参数，然后把这个矩阵画成一个热图。我试图将第二个函数(即绘制热图)转换为S3泛型函数。希望下面的例子能解释我的意思。
首先，我有一个函数来创建一个矩阵：
#' myMatrix
#'
#' @description Creates Matrix
#'
#' @param rows No of rows
#' @param cols No of cols
#'
浏览 4提问于2020-07-13得票数 0
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堆叠条形图
r、ggplot2、geom-bar
我想用ggplot2和geom_bar创建一个堆叠的图表。
以下是我的源数据：
Rank F1 F2 F3
1 500 250 50
2 400 100 30
3 300 155 100
4 200 90 10
我想要一个叠加的图表，其中x是秩，y是F1，F2，F3中的值。
# Getting Source Data
sample.data <- read.csv('sample.data.csv')
# Plot Chart
c <- ggplot(sample.d
浏览 0提问于2014-01-20得票数 49
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带有宽文件的R颜色贴图
r、colors、dplyr、heatmap、heat
data=data.frame("team"=c("hawks","sharks","kongs","wolves"),
"v1"=c(runif(4, -1, 1)),
"v2"=c(runif(4, -1, 1)),
"v3"=c(runif(4, -1, 1)),
"v4"=c(runif(4, -1, 1)))
li
浏览 5提问于2019-07-26得票数 0
1回答
R:如何使用ggplot2创建半颜色和半数字的热图？
r、ggplot2、heatmap
我试图用一个热图来表示一个相关矩阵，一半的热图使用颜色，另一半使用实际的相关值。
到目前为止，我已经能够创建两个独立的三角形热图(一个有颜色，另一个有相关值)。是否有一种方法可以在ggplot2中覆盖或组合这些地块来创建一个热图？有没有另一种更有效的方法来创建一个热图，即一半颜色和一半数字？
下面是我的代码，向您展示我迄今所做的工作。
A <- c(1,4,5,6,1)
B <- c(4,2,5,6,7)
C <- c(3,4,2,4,6)
D <- c(2,5,1,4,6)
E <- c(6,7,8,9,1)
df <- data.frame(A,B,C
浏览 4提问于2021-11-16得票数 0
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使用geom_tile在ggplot2()中使用heatmap -寻找与旧代码相当的代码
r、plot、ggplot2
我有一个有三个变量的数据框架:位置、天气和wc。
我想使用geom_tile在ggplot2()中制作一个热图，这样天气就在y轴上，位置在x轴上，wc是填充。我在上找到了一些代码，生成了我想要的那种情节。
问题是，虽然我可以制作基本的情节(p)，但我无法获得完成工作的代码(网页上有最终产品的视觉)。据我所知，有些代码是针对较早版本的ggplot2()的，但我不知道更新后的等价物是什么。
任何帮助都将不胜感激。
起点(df)：
df1 <- data.frame(location=c("az","az","az","bi",&
浏览 2提问于2017-11-15得票数 0
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如何用to图绘制矩阵
r、matrix、ggplot2
我可不想用‘t图来绘制矩阵。
下面是一些示例代码：
# create a dummy matrix
d2 <- matrix(data=NA,nrow=21,ncol=21,dimnames=list(-10:10,-10:10))
sig <- 3; mx <- 0; my <- 0;
for (jr in as.numeric(dimnames(d2)[[1]])){
for (jc in as.numeric(dimnames(d2)[[2]])){
d2[jr+11,jc+11] <- 1/sig/(2*pi)^.5*exp(-((jr-mx
浏览 0提问于2019-07-15得票数 4
2回答
如何将多个箱图放在R中的同一张图中？
r、plot、ggplot2、rstudio、boxplot
很抱歉，我没有这个问题的示例代码。
我想知道的是，是否可以在R中创建多个并排的框图，表示我的数据框中的不同列/变量。每个箱线图也只表示一个变量--我想将y-scale设置为(0,6)的范围。
如果这是不可能的，如果我只想用一个变量创建一个boxplot，我如何使用ggplot2中的面板选项呢？谢谢!
理想情况下，我想要类似于下图的东西，但没有像ggplot2中那样的因子分组。同样，每个箱线图将表示完全独立的单列。
浏览 0提问于2015-06-13得票数 7
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