开发者社区

文档建议反馈控制台

最新优惠活动

文章/答案/技术大牛

发布

ggplot2和QQ图用于非高斯分布

ggplot2是一种用于数据可视化的R语言包，它提供了一套灵活且强大的绘图语法，可以帮助用户创建各种类型的图表。ggplot2基于图层（layer）的概念，用户可以通过添加不同的图层来构建复杂的图形。

QQ图（Quantile-Quantile Plot）是一种用于检验数据是否符合某种理论分布的图形方法。它通过比较观测值的分位数与理论分布的分位数来判断数据的分布情况。如果数据符合理论分布，则QQ图上的点应该近似落在一条直线上。

ggplot2可以用于绘制QQ图，通过使用ggplot2的geom_qq()函数可以轻松地创建QQ图。用户可以指定理论分布的类型，并将观测值传递给函数，ggplot2会自动计算并绘制QQ图。

ggplot2的优势在于其灵活性和可扩展性。用户可以通过添加不同的图层、调整图形的主题和样式，以及添加标签和注释来定制图表。此外，ggplot2还支持数据分组、数据聚合和数据转换等功能，使得数据的可视化更加方便和高效。

应用场景：

数据分析和探索：ggplot2可以帮助用户对数据进行可视化，发现数据的分布、趋势和异常值，从而进行数据分析和探索。
学术研究：研究人员可以使用ggplot2创建高质量的图表，用于展示研究结果和数据分析过程。
数据报告和演示：ggplot2生成的图表美观且易于理解，适合用于数据报告和演示，帮助观众更好地理解数据和结果。

腾讯云相关产品和产品介绍链接地址：

腾讯云提供了一系列与云计算相关的产品和服务，以下是一些推荐的产品和对应的介绍链接地址：

云服务器（CVM）：提供弹性、安全、可靠的云服务器实例，支持多种操作系统和应用场景。详细介绍请参考：https://cloud.tencent.com/product/cvm
云数据库MySQL版（CDB）：提供高性能、可扩展的云数据库服务，支持自动备份、容灾和监控等功能。详细介绍请参考：https://cloud.tencent.com/product/cdb_mysql
人工智能平台（AI Lab）：提供丰富的人工智能算法和模型，帮助用户快速构建和部署人工智能应用。详细介绍请参考：https://cloud.tencent.com/product/ailab
云存储（COS）：提供安全、可靠的对象存储服务，支持海量数据存储和访问。详细介绍请参考：https://cloud.tencent.com/product/cos
区块链服务（BCS）：提供一站式区块链解决方案，帮助用户快速搭建和管理区块链网络。详细介绍请参考：https://cloud.tencent.com/product/bcs

请注意，以上链接仅供参考，具体的产品和服务详情请访问腾讯云官方网站获取最新信息。

相关搜索:ggplot2:图例为预测图混合颜色和隐藏线 ggplot2:用于连续数据的具有垂直柱的条形图 ggplot2:组合条形图和折线图对齐方式 ggplot2中的密度图和直方图 ggplot2中的条形图，用于显示每个条形图和c中总条形图的百分比范围 ggplot2和R中的简单饼图问题 ggplot2图和重写 Seaborn联合图组颜色编码(用于散点图和密度图)一个对照分布和多个处理分布之间的QQ图图编辑距离(GED)和(非)-isomorphic图

相关搜索:

页面内容是否对你有帮助？

有帮助

没帮助

相关·内容

PP图和QQ图

QQ图分位数图示法（Quantile Quantile Plot，简称 Q-Q 图）统计学里Q-Q图（Q代表分位数）是一个概率图，用图形的方式比较两个概率分布，把他们的两个分位数放在一起比较。...从定义中可以看出Q-Q图主要用于检验数据分布的相似性，如果要利用Q-Q图来对数据进行正态分布的检验，则可以令x轴为正态分布的分位数，y轴为样本分位数，如果这两者构成的点分布在一条直线上，就证明样本数据与正态分布存在线性相关性...PP图 P-P图是根据变量的累积概率对应于所指定的理论分布累积概率绘制的散点图，用于直观地检测样本数据是否符合某一概率分布。...由于P-P图和Q-Q图的用途完全相同，只是检验方法存在差异。要利用QQ图鉴别样本数据是否近似于正态分布,只需看QQ图上的点是否近似地在一条直线附近,而且该直线的斜率为标准差,截距为均值....用QQ图还可获得样本偏度和峰度的粗略信息. scipy 画Q-Q图例子：#qq图 fig = plt.figure() res = stats.probplot(train['SalePrice']

6451 0

QQ图和PP图

Q-Q图和P-P图原理对于一组数据是否符合某个分布，有很多种统计检验的方法，比如K-S检验，卡方检验，从图形上我们可以用Q-Q图和P-P图来检查数据是否服从某种分布。...图中的点（x,y)对应的是第一个分布的分位数和第二个分布相同的分位数。...P-P图和Q-Q图的用途完全相同，只是检验的方法存在差异。...) pp.plot(x) image.png 用ggplot2绘制Q-Q图 library(ggplot2) df <-data.frame(x=rnorm(250 , mean=10 , sd=1)...) ggplot(df, aes(sample = x))+ geom_qq(size=1) + geom_qq_line(size=1) image.png

2.1K3 0

QQ图和曼哈顿图是嘛意思？

GWAS分析，QQ图和曼哈顿图是标配，可是这两个图具体是什么意思？怎么判断好坏，且听我一一道来。 QQ图和曼哈顿图是嘛意思？...GWAS分析中，会有一个结果，每个SNP的P值，可以根据这个值，以及SNP的染色体和物理位置，进行作图。常见的图是QQ图和曼哈顿图。...比如：什么是QQ图 QQ图，全称quantile-quantile plot，又称为「分位图」它是判断模型假阳性、假阴性的重要指标。「为何要用QQ图来表示GWAS的结果呢？」...QQ图的x坐标是均匀分布的值（理论值），经过-log10转换了。QQ图的y坐标实际的P值（观测值），经过-log10转换了。...所以，好的GWAS分析，有结果的QQ图，都是前期在直线上，后面上翘。有点翘的QQ图才是好的QQ图。

7631 0

ggplot_QQ图和ECDF

QQ图和ECDF sunqi 2020/8/3 QQ图用来描述数据正态性的问题，配合正态性检验进行分析主要的函数和参数 stat_qq() color, shape and size：和之前一样代码...rm(list = ls()) # 导入需要的包 library(ggplot2) # 用于绘图拼接 library(patchwork) # 用于数据处理分析 library(tidyverse)...图，根据颜色分组 stat_qq(aes(color = sex)) + # 配色方案 scale_color_manual(values = c("#00AFBB", "#E7B800")...) + # 添加lab labs(y = "Weight") # 除了ggplot2，ggpbur也可以进行qq图的绘制 # 使用ggpbur包中的ggqqplot函数绘制 library(ggpubr...ECDF图 ECDF：Empirical cumulative distribution function，用于描述数据的分布，横坐标为指标，纵坐标为累计概率从图中可以看出数据的分布比例代码 # 绘图

1.2K2 0

ggplot2 核密度图和直方图

密度图和直方图 sunqi 2020/8/3 Density Plot Density Plot：也称作核密度图函数和参数 geom_density() color, size, linetype:...颜色、大小和线的类型 fill：填充 alpha：透明度绘图 # 需要的包 library(ggplot2) theme_set( theme_classic() + theme(legend.position...aes(color = sex)) + # 这个函数很熟悉吧 scale_color_manual(values = c("#868686FF", "#EFC000FF")) # 更改线的颜色和填充颜色和垂直线...=ls()) # 需要的包 library(ggplot2) theme_set( theme_classic() + theme(legend.position = "top") )...结束语核密度图和直方图一般在论文中使用的很少，这也就注定是一个数据探索阶段的绘图，所以修的再漂亮也没什么用 love&peace

4.7K6 1

R语言绘图 | 绘制QQ图和曼哈顿图

QQ图和曼哈顿图是GWAS结果展示必备的图，今天小编教大家使用R包"CMplot"绘制这两个图。首先准备输入文件： ?...简单几行命令，QQ图和曼哈顿图就绘制好啦！参考资料： https://github.com/YinLiLin/R-CMplot

2.4K2 0

GWAS分析中QQ图和曼哈顿图如何看？

除了曼哈顿图，还有QQ图，它主要是从模型的角度看一下显著位点是否是假阳性。显著性的位点，怎么能缺少LDblock（LDblock绘制连锁不平衡和单体型图），倒三角缺不了的！...有时候还会绘制LD衰减图（LD衰减图绘制--PopLDdecay）。做完GWAS只给出显著性位点和注释基因的汇总统计表格，没有几个绚丽的图就不好意思出来见人，如何绘制曼哈顿图和QQ图？...QQ图和曼哈顿图是嘛意思？ GWAS分析中，会有一个结果，每个SNP的P值，可以根据这个值，以及SNP的染色体和物理位置，进行作图。常见的图是QQ图和曼哈顿图。...比如：什么是QQ图 QQ图，全称quantile-quantile plot，又称为「分位图」它是判断模型假阳性、假阴性的重要指标。「为何要用QQ图来表示GWAS的结果呢？」...所以，好的GWAS分析，有结果的QQ图，都是前期在直线上，后面上翘。有点翘的QQ图才是好的QQ图。

1.5K3 0

如何解读GWAS分析中QQ图和曼哈顿图

最近有老师问GWAS可视化的内容，GWAS分析结果没有曼哈顿图和QQ图是没有灵魂的，这两个图究竟怎么看呢，下面介绍一下：大家好，我是邓飞，GWAS分析应该是可视化最靓的仔了，五颜六色，形状各异，真叫人眼花缭乱...除了曼哈顿图，还有QQ图，它主要是从模型的角度看一下显著位点是否是假阳性。显著性的位点，怎么能缺少LDblock（LDblock绘制连锁不平衡和单体型图），倒三角缺不了的！...有时候还会绘制LD衰减图（LD衰减图绘制--PopLDdecay）。做完GWAS只给出显著性位点和注释基因的汇总统计表格，没有几个绚丽的图就不好意思出来见人，如何绘制曼哈顿图和QQ图？...QQ图和曼哈顿图是嘛意思？ GWAS分析中，会有一个结果，每个SNP的P值，可以根据这个值，以及SNP的染色体和物理位置，进行作图。常见的图是QQ图和曼哈顿图。...所以，好的GWAS分析，有结果的QQ图，都是前期在直线上，后面上翘。有点翘的QQ图才是好的QQ图。

6366 0

GWAS分析中可视化：QQ图和曼哈顿图

大家好，我是邓飞，对于GWAS分析结果，第一个要看的是曼哈顿图，看看有没有显著性的点，没有显著性的点，项目白做了！第二个要看的是QQ图，比较翘就非常理想。...无论是软件自动出图，还是需要自己作图，学习根据GWAS结果手动作图都是必须的。我们一般使用qqman作图和cmplot两个包画GWAS的QQ图和曼哈顿图，后者颜色更漂亮。...qqman作图「QQ图绘制」这里，只需要一列P值即可。...「qq图绘制」 CMplot(dat,plot.type = "q",threshold = 0.05) 对比一下cmplot和qqman的QQ图：可以看到，cmplot的QQ图更好看，而且还有置信区间...合并密度图和圆形曼哈顿图： CMplot(dat,plot.type="c",r=0.4,col=c("grey30","grey60"),chr.labels=paste("Chr",c(1:22),

1K1 0

R语言基础绘图教程——第9章:火山图和QQ图

火山图 diff0 = read.table("volcano_plot.txt",sep="\t",header=T) P.value = diff0$adj.P.Val FC = diff0$logFC...利用ggplot2绘图 #using ggplot2 library(ggplot2) ggplot(data=df,aes(x=FC,y=-log10(P.value)))+ geom_point...QQ图 #生成100个正态分布的随机数 data = rnorm(100,0,1) #生成柱状图，查看所生成随机数的分布情况 hist(data,10) ?...for 100 numbers") qqline(data50, pch=16, col="red") #fig2 qqnorm(data100, pch=16, main="QQ-plot for...200 numbers") qqline(data100, pch=16, col="red") #fig3 qqnorm(data150, pch=16, main="QQ-plot for 500

1.7K2 0

ggplot2绘制森林图(有亚组和没亚组)

之前写了很多篇推文介绍森林图，包括了常见的forestplot/forestploter/ggforestplot等多个R包：画一个好看的森林图用更简单的方式画森林图 R语言画森林图系列3 R语言画森林图系列...4 R语言画误差线的5种方法虽然写的很详细，有亚组和没亚组的都包括了，但是base r的语法对于新手来说确实很难理解，不如ggplot2系列清晰易懂，而且各种空格/NA等占位符的使用也不好理解。...所以今天介绍下如何使用ggplot2画森林图，相比于之前介绍的森林图画法，主要是数据不复杂，只要在图层上改改细节即可。但是对于零基础的人来说，依然是有难度的！...) library(patchwork) p2+p4+p5+p1+p3+plot_layout(widths = c(0.1,0.05,0.05,0.1,0.1)) 这颜值已经算是不错了，但是和之前的相比还是有些差距...最后大家思考一个问题：多因素回归的森林图和亚组分析的森林图是一样的吗？

1.9K4 0

ggplot2饼图和图注顺序不一致如何解决

不知道大家用ggplot2绘制饼图的时候有没有遇到过饼图上展示的顺序和图注上展示的顺序不一致的情况。今天小编就来跟大家一起来探讨一下这个问题。...首先我们来构建这样一个数据框，里面包含7种水果和相应的数目。...来绘制饼图 library(ggplot2) pie=ggplot(data, aes(x="", y=prop, fill=name)) + geom_bar(stat="identity",...所以这样得到的饼图的顺序实际上是apple，banana，cherry......而图注的顺序跟name本身的顺序一致为apple，pear，orange.........按所占百分比排序之后再绘制饼图的代码如下

2.6K2 0

R语言ggplot2漂亮的热图和配色简单小例子

偶然间在github 上发现的这个链接，示例数据和代码都有，很好的R语言学习素材链接是 https://github.com/blmoore/blogR ，主要内容有 image.png 光看这个可能有些枯燥...，今天重复这个热图这个图具体的数据是什么意思暂时还没太看明白，最终用于作图的数据格式如下 image.png 前半部分准备数据的代码这里就不介绍了 image.png 准备数据的过程可能稍微有点枯燥，...大家感兴趣的话可以自己研究研究我们直接运行画图代码加载ggplot2 library(ggplot2) 最基本的热图 ggplot(mdf, aes(y=state, x=year, fill=c...="white", #linewidth=2, width=.9, height=.9) image.png 这里原来热图对应的小单元格高和宽是都可以调整的...调整热图的颜色和图例 ggplot(mdf, aes(y=state, x=year, fill=c)) + geom_tile(colour="white", #linewidth

7.6K2 0

R语言ggplot2每周一图活动：第三周~柱形图和散点图

) %>% dplyr::select(animeID, title_english, title_japanese, genre, score, scored_by, members) 柱形图

3152 0

R语言ggplot2每周一图活动：第四周~簇状柱形图和堆积柱形图

堆积柱形图代码数据来源 https://github.com/kaustavSen/tidytuesday/blob/master/2021/week_11.R 感兴趣的可以尝试下原始代码我将数据整理部分的代码去掉了...bechdel_test_text <- read_csv("bechdel_test_text.csv") bechdel_step_df <- read_csv("bechdel_step_df.csv") library(ggplot2...25, 45), plot.background = element_rect(fill = "#f0f0f0", color = "#f0f0f0") ) image.png 簇状柱形图的代码...2018-05-29_getting_fancy_ggplot2/ library(readr) success_rates<-read_csv("success_rates.csv") library(ggplot2

5161 0

gplots heatmap.2和ggplot2 geom_tile实现数据聚类和热图plot

主要步骤 ggplot2 数据处理成矩阵形式，给行名列名 hclust聚类，改变矩阵行列顺序为聚类后的顺序 melt数据，处理成ggplot2能够直接处理的数据结构，并加上列名 ggplot_tile进行画图...gplots 数据处理成矩阵形式，给行名列名调制颜色并用heatmap.2画热图（heatmap.2函数内部用hclustfun 进行聚类） R语言代码 library(ggplot2) library...average") #对矩阵进行转置，对原本的列进行聚类 colInd<-hc$order #将聚类后列的顺序存为colInd data<-data[rowInd,colInd] #将数据按照聚类结果重排行和列...dp=melt(data) #对数据进行融合，适应ggplot的数据结构，以进行热图的绘制 colnames(dp) <- c("Gene","Sample","Value") p <- ggplot

4.7K7 0

图的深度优先和广度优先算法（DFS递归与非递归）

本博客前面文章已对图有过简单的介绍，本文主要是重点介绍有关图的一些具体操作与应用阅读本文前，可以先参考本博客各种基本算法实现小结（四）—— 图及其遍历和图的一些基本算法无向图...——邻接矩阵的深度优先和广度优先算法实现测试环境：VS2008（C） #include "stdafx.h" #include #include #...define VertexType char #define InfoType int int *visited; /********************************/ /**** 图的结构定义...next; ivex=pn->ivex; free(pn); } return ivex; } /********************************/ /**** 图的实现

1.8K5 0

跟着Nature学作图 Figure3：R语言ggplot2 堆积柱形图和簇状柱形图

https://www.nature.com/articles/s41586-022-05275-y s41586-022-05275-y.pdf 代码没有公开，但是作图数据基本都公开了，争取把每个图都重复一遍...今天的推文重复论文中的Figure3 image.png 首先是作图数据簇状柱形图 image.png 堆积柱形图 image.png 作图代码 getwd() setwd("data/20221014...library(readxl) fig3a<-read_excel("Figure3.xlsx", sheet = "fig3a") fig3a library(ggplot2...library(patchwork) p1+p2+ plot_annotation(tag_levels = "a") image.png 这里a小图上图例里的虚线不知道是怎么添加的，出图后借助其他软件来编辑吧

4572 0

ggplot2实现分半小提琴图绘制基因表达谱和免疫得分

最近看到很多人问下面这个图怎么绘制，看着确实不错。于是我查了一些资料，这个图叫split violin或者half violin，本质上是一种小提琴图。...这里利用上期处理好的TCGA HNSCC的配对数据进行练习，数据包含43个肿瘤样本和43个癌旁样本。除了基因表达量绘制的结果展示，最后还附带一个ESTIMATE计算免疫评分的例子。...这里加载包装好的2个函数,用于后面的统计和绘图 source("./assist/Function_for_violin_plot.R") 计算均值和误差 ## 4....出图 # 这个是我自己写的一个ggplot2的主题，可以自定义修改其中的参数 if(T){ mytheme <- theme(plot.title = element_text(size = 12...包绘制精美的小提琴图》数据和代码下载： https://gitee.com/ct5869/shengxin-baodian/tree/master/TCGA 作者：赵法明编辑：生信宝典

3.2K5 2

R语言ggplot2簇状柱形图和堆积柱形图组合到一起的效果

image.png 在一个交流群看到有人问这个图怎么实现，今天的推文我们来介绍一下如何用R预言的ggplot2实现上面这个图。...首先是准备作图数据，作图数据整理成如下格式，我这里用excel存储 image.png 读取数据 library(readxl) library(ggplot2) library(tidyverse)...scale_fill_manual(values = c("#f8766d","#a3a500","#00bf7d","#00b0f6","gray")) image.png 背后灰色的柱子是堆积柱形图，...前面的柱子是簇状柱形图示例数据和代码可以给推文打赏1元获取欢迎大家关注我的公众号小明的数据分析笔记本小明的数据分析笔记本公众号主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子

3462 0

点击加载更多

扫码

添加站长进交流群

领取专属 10元无门槛券

手把手带您无忧上云

扫码加入开发者社群

相关资讯

热门标签

活动推荐

运营活动

活动名称

广告关闭