生信基础知识100讲

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中心法则专题

测序平台专题

1.Sanger测序

2.illumina测序3.罗氏454测序4.SOLiD测序5.Ion Torrent测序6.pacbio测序7.纳米孔测序

数据格式专题

1.FastQ和FastA格式2.SAM格式3.gff/gtf格式4.Bigwig/Wiggle格式5.bed格式6.vcf格式7.Blast&Blat

测序数据质量控制专题

1.测序数据质量控制之FastQC2.测序数据质量控制之cutadapt3.测序数据质量控制之sickle4.测序数据质量控制之Trimmomatic5.测序数据质量控制之fastx Toolkit6.测序数据质量控制之RSeQC7.测序数据质量控制之CHIPQC组学专题1.组学专题-基因组学2.组学专题-转录组学3.组学专题-表观基因组学4.组学专题-微生物组学5.组学专题-蛋白质组学6.组学专题-代谢组学变异形式专题1.变异形式专题-参考基因组2.变异形式专题-基因结构3.变异形式专题-SNP多肽性4.变异形式专题-SNV5.变异形式专题-CNV6.变异形式专题-SV7.变异形式专题-INDEL遗传资源数据库专题1.遗传资源数据库专题-1000genomes2.遗传资源数据库专题-hapmap3.遗传资源数据库专题-EXAC4.遗传资源数据库专题-ESP65005.遗传资源数据库专题-UK10K6.遗传资源数据库专题-COSMIC7.遗传资源数据库专题-TCGA8.遗传资源数据库专题-gnomAD

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