之前有幸作为研究生选修课『生物信息学』的助教,给非生物信息专业的研一同学上过两次课。同学们都很好学,下课后也有许多问题来问我们,其中问的最多的方面就是数据库。然而我也不是百科全书,很多研究领域我都不熟悉,有时候回答不上来,就很僵硬。
今天突然想到nucleic acids research(NAR)好像收录了不少数据库方面的文章,我就上pubmed搜了一下,竟然发现了这篇文章『The 2018 Nucleic Acids Research database issue and the online molecular biology database collection』。原来NAR每年都会出这样一篇总结文章,妈妈再也不用担心我找不到数据库了~~~文中提到, 每年NAR都会审核已收集的数据库是否能用,如果不能就会与作者联系,更新信息,若有数据库已经废弃,那NAR就会将其从collection删除。每年在NAR上发表的数据库自动添加到collection,若数据库是在别的期刊中发表的话,也可以申请 加入collection。 The NAR online Molecular Biology Database Collection目前存有1737个数据库,分为15类,41个子类。
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随便点击一个进去,可以看到数据库的详细信息。如此之多的数据库,当真让人眼花缭乱啊!
不过需要注意的是,尽管常用的、知名度很高的数据库基本都在collection中,尚有不少数据库未被收录其中,另外2018年刚出的数据库显然也未被收录其中。文中的Table1、Table2就列出了部分2018年NAR及其他期刊发表的数据库。
推荐大家看一下这篇文章,如果懒的下载,可以直接问我要,5天内,过时不候~~~
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