多吃绿叶蔬菜或可有助于预防脂肪肝

科研进展

1、NBT:定义病毒基因组质量标准

《Nature Biotechnology》,美国能源部(DOE)联合基因组研究所(JGI)研究人员构建了重要的病毒序列数据库,同时提出了病毒基因组标准,指出了三类基因组质量分级:“Genome fragments”指由单个或多个片段组成,预测完整性小于90%,或者没有预测基因组大小,注释量小;“high-quality draft genome”指基因组序列完成90%或更多,片段gaps主要是重复区域;“finished genome”是指由没有gaps的单个连续序列组成的完整基因组和广泛的注释。(生物通)

2、全基因组测序支持将现存野生虎种群划分为6个独立的亚种

《Current Biology》,北京大学、北大-清华生命科学联合中心等联合团队选取了32份确定地理来源的虎样本进行全基因组测序(平均为10X),共找到约180万个多态性位点。结果表明,虎的物种形成时间大约在2-3百万年前,群体基因组学分析将现代虎的最近共同祖先追溯至距今大约11万年,之后在种群重新扩散过程中,在气候变化、栖息地隔离、遗传漂变和自然选择等因素共同作用下形成了现代虎6个独立亚种(苏门答腊虎,孟加拉虎,印支虎,马来虎,东北虎和华南虎)的地理分布和遗传分化格局。该研究通过全基因组扫描发现了多个可能与虎的适应性演化有关的基因组区域。其中与体型发育相关的ADH7基因及其邻近区段在苏门答腊虎种群的基因组中显示出强烈的正选择信号。相对于其他亚种,苏门答腊虎体型较小,有可能与苏门答腊岛上缺乏大型有蹄类猎物,可供虎捕食的物种(例如野猪、麂子等)体型也较小有关。该发现首次揭示了虎的种内适应性演化的遗传机制。(生物通)

3、舌苔菌群或可作为胃炎进展的生物标志物

《Protein & Cell》,清华大学研究人员纳入78名胃炎患者和50名健康个体,分析不同阶段胃炎患者(浅表性胃炎、萎缩性胃炎和肠上皮化生)的舌苔菌群变化。与健康对照相比,胃炎患者的舌苔菌群中有21种微生物存在显著差异。与差异微生物相关的28条通路中,共519个基因在胃炎患者中上调,包括代谢、抗生素生物合成、趋化性等,另有359个基因下调。简明弯曲菌的丰度与胃炎进展阶段显著相关,且在胃炎患者的舌苔与胃液中均存在。因此,舌苔菌群或可作为长期观测胃炎的生物标志物。(热心肠研究院)

4、多吃绿叶蔬菜或可有助于预防脂肪肝

以往研究表明,许多蔬菜中天然存在的硝酸盐可提高细胞中线粒体的效率,且多吃果蔬还有助改善心血管功能和糖尿病。《PNAS》,瑞典卡罗琳医学院研究人员研究表明,多吃生菜、菠菜等含有硝酸盐的绿叶蔬菜可能有助降低脂肪肝患病风险。此外,还显示,补充硝酸盐的小鼠不仅患脂肪肝的风险降低,血压也有所下降,患2型糖尿病的小鼠血糖水平也有所改善。因此,建议多吃绿叶蔬菜,每天只需食用200克左右可起到一定的保健效果。(科技日报)

产业及政策动态

1、Indivumed与A * STAR合作开发以亚洲为中心的癌症数据库,用于个体化肿瘤学

德国肿瘤研究公司Indivumed与新加坡A * STAR的分子和细胞生物学研究所(IMCB)开展合作,推出癌症图书馆计划,以支持精准诊断和个性化癌症治疗的发展。合作伙伴将利用该国的临床网络对同意的个体收集各种组学数据。这些数据将存储在所谓的以亚洲为中心的癌症数据库中,供当地科学家和临床医生用于学术和转化研究。Indivumed已运营了一个名为IndivuType的数据库,该数据库将患者的临床信息与基因组学、转录组学、蛋白质组学,精准蛋白组学和数字组织病理学数据相结合。以亚洲为中心的癌症数据库将成为Indivumed的多组学库的一部分,并将包含蛋白质组学分析数据,研究人员将能够使用一整套分析技术,生物信息学和人工智能解决方案进行探索。(Genomeweb

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