今天我们介绍一款使用三代全长转录本数据进行转录本校正，聚类，可变剪切分析，定量和差异分析为一体的工具 - FLAIR。来自加利福尼亚大学圣克鲁斯分校（Unive...

目前研究表明，在生物体内，circRNA主要通过其序列特征，发挥miRNA海绵、RNA-binding proteins （RBPs）海绵以及翻译短肽等生物学功...

记得在我去新加坡参加 Nanopore Community Meeting 2023 回来后（2023年9月31日），PacBio发布了其全套 KINNEX 产...

2.连续型的信息（如年龄、基因表达量、风险）分为2or3组分开画：根据中位数；根据某个具体的数值；最佳截断值

2. 线粒体基因比例特别高的，往往细胞表达的nCount比较大，可以通过percent.mt过滤

今天我们继续介绍一款使用三代全长转录本数据进行转录本注释和定量的工具 - Bambu。来自新加坡科技研究局 (A-STAR) 的Jonathan Göke（图1...

今天曾老师还实战了一波现场装版本限制的monocle3包，手忙脚乱一直出岔子莫名其妙的样子竟然和菜鸟我本人平时遇到bug是一样的，瞬间心平气和对未来充满希望了(...

2.19-20年是单细胞的黄金时代，主要的分析步骤这个时段已经确定，看这个阶段的文献已经可以学到很多，虽然现在新出现了大量的工具方法，但对我们数据挖掘都不太有帮...

str_split之后得到的是matrix，之前用管道符是无法直接取列的，加个.就可以了

GSEA & GSVA：以一组基因为单位，来描述是否参与某种功能，直接注释的结果是得到大量的功能节点

今天的内容终于到转录组下游啦，R比起Linux易懂很多，基本上改改分组信息无脑run就好

转录组上游的内容终于上完了，今天的内容太抽象了，每一步处理的内容都不是很好理解，现在上完课也还是摸不着头脑，最大的收获似乎是多按tab键？

一种基于文本的，保存生物序列（通常是核酸序列）和其测序质量信息的标准格式,一般都包含有4行。

回答一个问题：save(a,file="test.RData")这句代码如果报错object a not found，是为什么，应该怎么解决？

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.02.06.527280v2