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在高性能计算（HPC）的世界里，除了编写高效的代码，构建一个稳定、可复现的运行环境同样至关重要。作为 HPC 平台的技术人员，我们发现超过 50% 的用户工单都...
在常规的基因组学研究中，人们常常把“参照基因组”当作某一物种遗传信息的“规范模板”。但这犹如仅通过一份标准住宅设计图去推断所有家庭的住宅布局，不可避免地忽视了众...
Slurm (Simple Linux Utility for Resource Management， http://slurm.schedmd.com/ )...
今天给大家介绍的是基于 Sentieon 软件开发的用于鸡全基因组测序数据的自动化流程脚本。该流程实现了从原始测序数据（FASTQ）到变异检测结果（GVCF）以...
Slurm 是一个开源的、高度可扩展的工作负载调度器，专为高性能计算集群设计。它的名字是 Simple Linux Utility for Resource M...
今天给大家介绍的是基于 Sentieon 软件开发的用于水稻全基因组测序数据的自动化流程脚本。该流程实现了从原始测序数据（FASTQ）到变异检测结果（GVCF）...
LDAP即轻量级目录访问协议，是一种开放的、跨平台的行业标准协议，用于访问和维护分布式目录信息服务。可以把它理解为一个专门优化的、用于频繁查询和读取的数据库。它...
在此专门科普HPC各类知识
在传统的基因组学中，我们习惯于将一个“参考基因组”视为一个物种的遗传“标准答案”。然而，这就像仅凭一张标准户型图去理解所有家庭的房屋户型，必然会遗漏大量个性化的...
今天给大家介绍的是基于 Sentieon 软件开发的用于猪全基因组测序数据的自动化流程脚本。该流程实现了从原始测序数据（FASTQ）到变异检测结果（GVCF）以...
今天给大家介绍的是基于 Sentieon 软件开发的用于小麦全基因组测序数据的自动化流程脚本。该流程实现了从原始测序数据（FASTQ）到变异检测结果（GVCF）...
普通小麦(AABBDD)源于7000-8000年前中东地区四倍体小麦与粗山羊草的自然杂交。约3500-4000年前传入中国，逐渐成为华北主要农作物。
皮尔逊综合征(Pearson Syndrome，PS)是一种由线粒体DNA缺失引起的罕见多系统遗传病，主要影响骨髓和胰腺功能。该病通常在婴儿早期发病，以难治性贫...
提维岛民由于遗传隔离形成了独特的血型抗原分布特征，与澳大利亚主要献血群体(高加索人种)存在显著差异，在输血过程中容易引发同种免疫反应。面临着因血型抗原多态性导致...
肿瘤突变负荷（TMB）作为预测免疫检查点抑制剂疗效的生物标志物在多种实体瘤中显示出潜力，但其在小细胞肺癌（SCLC）中的作用尚不明确。SCLC通常具有高TMB，...
血浆中的线粒体DNA损伤相关分子模式(mtDNA DAMPs)与多种疾病的发病机制和预后密切相关。目前主流的qPCR检测方法存在诸多局限性，如易受核基因组线粒体...
不同的研究方案和各异的临床及研究制度下收集的基因组数据存在的区别，因此创建协调统一的数据库是有益的，尤其在儿科罕见疾病领域。且能解决研究型医院在研究和临床实践时...
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