CJ-Chen

LV0
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Fasta序列文件合并与分割,支持.seq等无头序列

我隐约记得我写过类似主题,但也并不确定。相关功能,我并不写使用说明的冲动,一者是这些功能至少是四五年前就有的,二者是这些功能其实比较简单,但也并不常用。然而,现...

CJ-Chen
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稀有 | GXF Stat 一次统计物种的Gene/mRNA/Exon/Intron/CDS/UTR...信息

近日在鼓捣课题的过程中,遇到了一些数据整理需求。需要快速统计物种的序列特征情况,比如基因,转录本,外显子,内含子,CDS,UTR等。但我们其实都清楚,很多物种的...

CJ-Chen
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贴心 | GXF Fix 修复 / 优化基因结构注释信息文件 - GTF/GFF3

目前基因组测序和组装成本几乎已经到任何一个课题组都可以单独负担的价码,大量物种的基因组序列被测定和释放。与此同时,对应的基因结构注释信息文件,如GTF或GFF3...

CJ-Chen
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windows下直接跑MEME suite?对!任何人都可以。

Motif,模式,pattern,如下。我个人理解为:一组具有类似特征的序列。而在分子序列中,那么就是具有类似分子(如碱基或氨基酸)的序列。

CJ-Chen
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TBtools | 多图合一至强版教程!进化树+Motifs+结构域+启动子+基因结构+....

“Gene Structure View (Advanced)”这个功能可以说,也是一时兴起写出来的。开发的主要动机,还是发现师弟师妹在做的事情实在是太费时间精...

CJ-Chen
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插件 | 蛋白序列集合功能注释快速完成 - Quick Protein Anno

一般而言,我们会使用BLAST软件,比对到一些数据库,然后整理整理。不过这个过程还是相对较慢。快,估计是所有人都在追求的。要加速这个过程,其实只需要做两个事情:

CJ-Chen
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!Help | 我又有一个有趣的想法!

Emmm,最近,说实话,确实是忙。基本没维护 TBtools 用户社群。好在老铁群管以及热心社群成员的无私付出,勉强应付得了林林总总的成员使用问题。

CJ-Chen
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生信札记

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