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Seurat - Guided Clustering Tutorial (https://satijalab.org/seurat/v3.0/pbmc3k_tu...
对两个或两个以上单细胞数据集的整合分析提出了独特的挑战。特别是,在标准工作流下,识别存在于多个数据集中的基因可能存在问题。Seurat v4 包括一组方法,以匹...
Luecken MD, Theis FJ. Current best practices in single-cell RNA-seq analysis: a ...
实际的科研项目中不可能只有一个样本,多样本的单细胞数据如何合并在一起,是否需要校正批次效应呢?先上一张图说明多样本scRNA数据的批次效应:
在单细胞数据分析过程中,上游的拆库定量,中游的分群注释,目前的门槛是很低的了。但是解析细胞类型异质性不应止于这些,还可以看细胞群之间的通讯。当然,这方面我们介绍...
考虑到咱们生信技能树粉丝对单细胞数据挖掘的需求,我开通了一个专栏《100个单细胞转录组数据降维聚类分群图表复现》,也亲自示范了几个,不过自己带娃,读博,时间精力...
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TA 很懒,什么都没有留下╮(╯_╰)╭